Imaginez une course de chevaux, où le vainqueur remporte tout et reçoit à la fois de la nourriture et une protection contre les ennemis. De la même manière, les bactéries se font concurrence dans l’intestin des nouveau-nés.
Le but de nombreuses bactéries est d’être les premières à pénétrer dans l’intestin des nouveau-nés, puis d’empêcher les bactéries concurrentes d’y pénétrer. Et chaque espèce de bactérie se présente sous la forme de nombreuses variantes génétiques différentes. Certaines des variantes peuvent être facilement traitées avec des antibiotiques, tandis que d’autres, plus malveillantes, parviennent à leur résister. Certains d’entre eux peuvent donner aux bébés des infections difficiles à traiter. »
Jukka Corander, chercheur et professeur, Département de biostatistique, Université d’Oslo
Une étude menée par le Sanger Institute en Angleterre a montré qu’il existe une grande différence entre la flore intestinale présente chez un bébé né de manière naturelle par rapport à la flore d’un bébé né par césarienne (césarienne). Si un bébé est exposé à la flore intestinale de sa mère, cela protégera probablement le nouveau-né contre des types de bactéries plus nuisibles.
Aucune bactérie hospitalière trouvée dans aucun des groupes de naissance
Comment la méthode d’accouchement affecte-t-elle si des variantes indésirables de différentes bactéries se retrouvent dans l’intestin des bébés ?
« Nous avons étudié plusieurs types de bactéries, dont Klebsiella pneumoniae et Enterococcus fecalis. Des variantes de ces bactéries résistantes aux antibiotiques se sont propagées dans les hôpitaux du monde entier. Nous voulions savoir si les bébés nés par césarienne étaient plus souvent infectés par ces bactéries. bactéries hospitalières », explique Corander.
Heureusement, ils n’ont pas trouvé de bactéries hospitalières chez les bébés nés par césarienne, ni par voie vaginale.
« C’est une bonne nouvelle, car sinon, les bébés risqueraient de contracter des infections difficiles à traiter », poursuit Corander.
Les chercheurs ont découvert que la prévalence des bactéries résistantes aux antibiotiques n’était pas plus élevée chez les bébés nés par césarienne. Ils n’ont trouvé qu’un nombre limité de bactéries multirésistantes dans les deux groupes de naissance.
Leurs découvertes ont été récemment publiées dans Nature Communications.
Les chercheurs traitent rapidement des millions de brins d’ADN
L’équipe de recherche du professeur Corander a mis au point une toute nouvelle façon de détecter relativement rapidement quelle variante génétique d’une bactérie est présente dans un échantillon. Jusqu’à présent, il n’a été possible de savoir qu’approximativement de quel type il s’agit.
Les chercheurs ont conçu la nouvelle méthode de détection en créant une vaste bibliothèque d’échantillons auxquels de nouveaux échantillons peuvent être comparés. De plus, ils ont mis en place un nouveau modèle statistique et un algorithme qui leur permettent de gérer des millions de brins d’ADN non seulement rapidement, mais avec une plus grande précision qu’auparavant.
E. coli a empêché les bactéries concurrentes
L’équipe de recherche a également étudié la bactérie E. coli, qui peut provoquer un empoisonnement du sang. Quelle est la probabilité qu’une certaine variante d’E. coli gagne la bataille pour la dominance dans les intestins ? Corander a trouvé trois variantes qui peuvent entraîner un risque d’infection plus élevé.
« Nous avons trouvé de nombreuses variantes différentes d’E. coli chez les bébés. Mais nous avons également découvert que la variante qui a remporté la course pour entrer dans l’intestin, semblait être capable d’empêcher les autres variantes d’envahir pendant plusieurs semaines », explique le professeur.
L’étude a été menée en collaboration avec plusieurs autres universités de Norvège, d’Angleterre et de Finlande, et a été financée par le Conseil norvégien de la recherche et l’investissement majeur de la Fondation Trond Mohn dans la recherche sur la résistance aux antibiotiques. Le projet fait partie du réseau de recherche AMR-Bridge.
