Premières données publiées sur le serveur de préimpression bioRxiv* suggère qu’une autre lignée Omicron, appelée BA.2, est plus contagieuse que BA.1 – la lignée Omicron qui a déclenché la flambée hivernale de cas de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) en janvier 2022.
L’étude actuelle a identifié les caractéristiques de la variante BA.2 et a constaté que par rapport à la souche Omicron originale, BA.2 est plus résistante au système immunitaire et montre une plus grande fusion cellulaire que BA.1.
Étude : Caractéristiques virologiques de la variante SARS-CoV-2 BA.2. Crédit d’image : CI Photos/Shutterstock
Depuis février 2022, la variante Omicron a muté en trois lignées : BA.1, BA.2 et BA.3. Une sous-lignée de BA.1 avec une substitution R346K dans la protéine de pointe est classée comme BA.1.1.
Sommaire
Descendance évolutive des lignées Omicron
Le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) BA.1 est apparu en premier, suivi de BA.2 et BA.3. Semblables à BA.1, les souches antérieures de BA.2, BA.3 et BA1.1 ont été détectées dans la province de Gauteng en Afrique du Sud, ce qui suggère que la diversification d’Omicron s’y est produite.
Alors que BA.1 s’est répandu à travers le monde à un rythme plus rapide que BA.2, la lignée BA.2 est devenue plus répandue que BA.1 depuis janvier 2022 dans plusieurs pays, dont les Philippines, l’Inde, le Danemark, Singapour, l’Autriche et le Sud. Afrique.
Les chercheurs de l’étude ont créé un modèle pour analyser la dynamique épidémique de différentes lignées de SRAS-CoV-2 et estimer le nombre de cas de COVID-19 pour chaque pays par chaque lignée virale. La fréquence de la lignée BA.2 était 1,40 fois plus élevée que BA.1, ce qui suggère que les cas causés par BA.2 se développeront et se propageront plus rapidement dans le monde que BA.1.
BA.2 montre une résistance aux anticorps monoclonaux
La séquence génétique de la protéine de pointe de la lignée BA.2 diffère considérablement de la lignée BA.1, ce qui suggère qu’elle peut conférer une plus grande résistance immunitaire contre les anticorps.
Pour étudier cela, les chercheurs ont effectué des tests de neutralisation avec des pseudovirus et des anticorps neutralisants qui seraient produits après la vaccination. Les résultats ont montré que BA.2 était similaire à BA.1 dans les anticorps résistants induits par le vaccin. BA.1 s’est montré hautement résistant aux vaccins à ARNm et au vaccin AstraZeneca.
La lignée Omicron BA.2 était également complètement résistante à deux anticorps monoclonaux connus sous le nom de Casirivimab et Imdevimab. De plus, il y avait une résistance 35 fois plus élevée à un anticorps thérapeutique, appelé Sotrovimab, par rapport au virus B.1.1 contenant D614G. BA.1 et BA.2 étaient tous deux très résistants aux échantillons de sérum de convalescence contenant des anticorps après récupération du virus SARS-CoV-2 d’origine, du virus Alpha et du virus Delta.
Ces données suggèrent que, comme BA.1, BA.2 est hautement résistant aux antisérums induits par la vaccination et l’infection par d’autres variants du SRAS-CoV-2 ainsi que trois anticorps thérapeutiques antiviraux », a écrit l’équipe de recherche.
Les chercheurs ont également étudié des échantillons convalescents infectés par BA.1. Treize échantillons convalescents provenaient d’individus entièrement vaccinés, 1 échantillon convalescent provenait d’une personne ayant reçu une dose de vaccin et 3 échantillons convalescents provenaient d’individus non vaccinés. Alors que les résultats n’étaient pas statistiquement significatifs, BA.2 est apparu 1,4 fois plus résistant aux sérums infectés par BA.1.
Une autre observation était que les échantillons convalescents d’individus entièrement vaccinés présentaient des effets antiviraux plus forts contre toutes les variantes par rapport aux échantillons de sérum à 1 dose ou non vaccinés.
Une enquête plus approfondie a montré que l’immunité humorale induite par BA.1 est moins efficace contre BA.2. En utilisant des échantillons de sérum convalescents de hamsters infectés 16 jours après l’infection, l’équipe a découvert que BA.1 et BA.2 présentaient une résistance élevée contre les échantillons de sérum infectés par B.1.1 et Delta. BA.2 a montré une résistance de 2,9 fois contre les sérums de hamsters convalescents infectés par BA.1 par rapport à BA.1.
Caractéristiques virologiques de la lignée BA.2
BA.2 était plus contagieux que BA.1 lors de l’étude du processus de réplication dans les cellules épithéliales nasales humaines. BA.2 a également montré significativement plus de fusion cellulaire que BA.1. Il y avait des syncytia 1,52 fois plus grandes dans BA.2 que dans BA.1.
On a émis l’hypothèse que les propriétés fusogènes supérieures de BA.2 provenaient d’un clivage plus efficace de la protéine de pointe que BA.1. Cependant, une analyse Western blot a montré que la protéine de pointe BA.2 était moins clivée que la protéine de pointe BA.1, indiquant que la fusogénicité s’est produite indépendamment du clivage.
Au lieu de cela, BA.2 peut être plus fusogène et réplicatif que BA.1 d’une manière dépendante de TMPRSS2. Les tests de fusion cellulaire ont révélé que la fusogénicité de la protéine BA.2.spike et la protéine de pointe B.1.1 étaient similaires dans les cellules contenant TMPRSS2 par rapport à celles qui n’en avaient pas.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
