Le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) a provoqué la pandémie de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), déclenchant une période de services de santé débordés et d’instabilité économique alors que le virus se frayait un chemin à travers le monde.
La variante Omicron est apparue en novembre 2021 et a immédiatement suscité de sérieuses inquiétudes en raison de sa transmissibilité sans précédent.
Une nouvelle préimpression sur le medRxiv* Le serveur rapporte les résultats d’une étude axée sur ses caractéristiques d’évasion immunitaire, en particulier sa capacité à échapper à la neutralisation par des anticorps dirigés contre les variantes antérieures du SRAS-CoV-2 ou contre l’antigène de pointe utilisé dans les vaccins COVID-19.
Sommaire
Fond
Les deux années qui se sont écoulées depuis le début de la pandémie ont vu l’émergence de plusieurs variantes du virus. Alors que certains ont disparu de la vue peu de temps après leur apparition, d’autres ont été observés comme étant plus transmissibles, virulents ou échappant aux réponses immunitaires de l’hôte plus efficacement que la variante ancestrale.
La capacité d’échapper à la neutralisation par les anticorps naturels et thérapeutiques conduit à ce qu’une variante donnée soit qualifiée de variante préoccupante (COV), tout comme la transmissibilité nettement accrue indépendamment des changements environnementaux. La première variante à émerger était la souche D614G, qui a rapidement remplacé la souche ancestrale de Wuhan en mai 2020 en raison de sa capacité accrue, ce qui la rendait plus susceptible de se propager rapidement.
C’est pendant la période de dominance du D614G que le vaccin Moderna mRNA-1273 a été développé. Les essais cliniques, en particulier l’essai de phase trois sur l’efficacité du coronavirus (COVE), ont montré qu’il était efficace à 94 % pour réduire l’incidence des maladies symptomatiques après le SRAS-CoV-2.
Le titre d’anticorps de liaison et de neutralisation contre le pic D614G était bien corrélé avec l’efficacité du vaccin dans cet essai. Ces deux résultats ont conduit à considérer cette protéine de pointe comme point de référence pour le développement de vaccins et les tests de neutralisation.
Il est toutefois important de se rappeler que la variante D614G reste à ce jour l’une des variantes du SARS-CoV-2 les plus facilement neutralisées. Elle est restée dominante jusqu’au début de 2021, date à laquelle la variante Alpha a pris le relais, pour être à son tour rapidement remplacée par la variante Delta.
Les variantes Alpha et Delta ont montré la capacité de résister à la neutralisation par les anticorps provoqués par le vaccin Moderna, mais la capacité de neutralisation n’a diminué que de deux à trois fois par rapport au D614G. Il y a également eu d’autres COV comme la variante bêta qui ont provoqué des épidémies locales en Afrique du Sud pendant plusieurs mois, montrant une résistance marquée aux anticorps induits par le vaccin. Même ainsi, les vaccins à acide ribonucléique messager (ARNm) comme l’ARNm-1273 de Moderna continuent d’offrir une protection significative contre le variant, avec seulement une petite réduction de l’efficacité contre les maladies graves et les décès.
Omicron a également été signalé pour la première fois en Afrique du Sud, fin 2021. Il possède le plus grand nombre de mutations de pointe parmi les variantes à ce jour, avec 15 mutations dans le domaine de liaison au récepteur de pointe (RBD), qui est la cible de plus de 50 anticorps neutralisants. .
Qu’a montré l’étude ?
La présente étude décrit les résultats des tests de neutralisation sur la variante Omicron utilisant des échantillons de sérum de personnes qui avaient reçu un cycle complet du vaccin à ARNm-1273 (100 g), dans un test de pseudovirus. Les dosages sur ces échantillons ont été effectués indépendamment dans deux laboratoires différents.
Deux séries d’échantillons ont été utilisées. Le premier contenait des échantillons sélectionnés avec des titres neutralisants élevés contre D614G, tandis que le second avait des titres modérés. Les variantes de pointe Omicron et Beta ont été testées pour comparer directement les deux.
Dans une deuxième série de tests, des échantillons de sérum d’individus vaccinés qui avaient reçu deux doses d’ARNm-1273 (100 g) et un troisième rappel de 50 g ont été dosés dans les deux laboratoires, mais des échantillons différents ont été envoyés à l’un ou l’autre laboratoire. Alors qu’un laboratoire a testé le sérum d’individus ayant reçu un rappel de 9 mois, l’autre a utilisé des échantillons de sérum provenant d’une étude clinique où les individus ont reçu un rappel hétérologue quatre mois ou plus à partir de la deuxième dose, en particulier les individus infectés par D614G avec la réponse la plus élevée. .
Les chercheurs voulaient comprendre dans quelle mesure Omicron résistait à la neutralisation par les anticorps induits par le vaccin par rapport à Beta ou D614G. Ils ont constaté que les titres moyens géométriques (GMT) de la dose infectieuse demi-maximale (DI50) étaient réduits de 84 et 49 fois dans les deux laboratoires, lorsqu’il s’agissait de neutraliser Omicron. À l’inverse, le COV bêta avait également des valeurs de GMT ID50 réduites, mais seulement environ 14 fois et 9 fois inférieures.
Après l’administration du boost de 50 g, le pouvoir de neutralisation a été multiplié par 12, l’ID50 devenant six fois et quatre fois moins puissant qu’avec la souche D614G, et environ 3 fois plus faible pour la souche Beta. En d’autres termes, la troisième dose de rappel a amélioré la neutralisation des variantes Beta et Omicron.
Dans un sous-ensemble intéressant d’échantillons, les individus vaccinés ont été suivis au cours de la période commençant deux semaines à partir de la deuxième dose, avant la dose de rappel, et deux semaines après la deuxième dose. Deux des sept participants ont été infectés par des infections révolutionnaires environ cinq à six mois après la deuxième dose, mais avant la dose de rappel.
A cette époque, les variantes Alpha et Delta dominaient aux USA. Les anticorps induits par le vaccin étaient donc les plus élevés contre D614G, au point de post-vaccination de deux semaines, mais les plus faibles pour Omicron. Dans cette situation, les titres d’Omicron ont été réduits de 35 fois, mais contre Beta, de 9 fois inférieurs à ceux du D614G.
Les titres neutralisants ont fortement baissé le jour du rappel, mais étaient à leur maximum deux semaines après le rappel, pour dépasser les titres obtenus après la deuxième dose, dans les trois variantes.
Le rapport des valeurs ID50 GMT à ce stade était de 13:1 et 7:1, pour les variantes Omicron et Beta, respectivement. Pour deux participants qui ont été infectés 5 mois après la deuxième dose, la réponse au rappel vaccinal était plus élevée que les titres avec le rappel vaccinal seul.
Cette augmentation du titre neutralisant a été observée pour les trois variantes malgré le fait qu’aucune d’entre elles n’avait rencontré la variante Omicron jusque-là.
L’infection par une variante antérieure peut améliorer la réponse vaccinale aux trois variantes, et ce rappel supplémentaire du vaccin peut encore augmenter cette réponse. «
Conclusion
Les résultats de cette étude montrent une réduction des titres neutralisants d’Omicron de 49 à 84 fois par rapport au D614G, chez les individus entièrement vaccinés (vaccin ARNm-1273). Cela indique un risque plus élevé de maladie symptomatique à la suite d’infections percées. Cependant, cela peut être atténué par une dose de rappel du même vaccin.
Il convient de garder à l’esprit que l’étude était de petite taille et le suivi de courte durée. D’autres études devraient examiner les résultats de cette enquête préliminaire sur le potentiel d’échappement d’anticorps d’Omicron après vaccination avec l’ARNm-1273, et après une troisième dose de rappel.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.