Les chercheurs ont utilisé le criblage à haut débit de bibliothèques de capside de vecteur viral adéno-associé (AAV) pour maximiser la probabilité d'obtenir des variantes d'AAV avec les propriétés souhaitées. À la suite de ces expériences, ils ont acquis des connaissances inattendues, rapportées dans un article publié dans Thérapie génique humaine, une revue à comité de lecture de Mary Ann Liebert, Inc., éditeurs.
Mark Kay et ses collègues de l'Université de Stanford (Stanford, CA) sont les auteurs de l'article intitulé «Tracking Adeno-Associated Virus Capsid Evolution by Thigh-Throughput Sequencing». Les chercheurs ont utilisé le criblage à haut débit de bibliothèques de capsides AAV à code à barres pour suivre l'évolution dirigée de la capside AAV. L'objectif ultime est de pouvoir identifier plus rapidement des vecteurs AAV recombinants améliorés à utiliser dans les essais cliniques de thérapie génique.
Parmi les conclusions les plus importantes figuraient les suivantes: il n'est pas essentiel d'utiliser plusieurs cycles de sélection, ce qui peut en fait être contre-productif. Des variantes d'AAV fonctionnelles et efficaces ont été obtenues après un seul tour de sélection. De plus, une infection avec une multiplicité d'infection élevée (MOI) est préférable à une infection avec un MOI faible, car l'utilisation de faibles MOI entraîne plus de variation entre les écrans et n'est pas optimale pour sélectionner les capsides les plus désirées. En outre, la concurrence peut avoir lieu entre AAV avec des capsides spécifiques dans les cellules qui. Ont été infectés par différents AAV. D'autres conclusions clés sont décrites dans l'article.
Ce travail de pointe du Dr Kay et de ses collègues de Stanford aide à faire de l'évolution dirigée des capsides d'AAV moins une «boîte noire». Ses idées sont susceptibles de conduire à la découverte de nouvelles capsides importantes qui pourraient autrement être négligées. «
Rédacteur en chef Terence R. Flotte, MD, Celia et Isaac Haidak Professeur d'éducation médicale et doyen, prévôt et vice-chancelier exécutif adjoint, Faculté de médecine de l'Université du Massachusetts, Worcester, MA
La source:
Référence de la revue:
de Alencastro, G., et al. (2020) Tracking Adeno-Associated Virus Capsid Evolution by High-Throughput Sequencing. Thérapie génique humaine. doi.org/10.1089/hum.2019.339.
Publié dans: Biologie cellulaire | Génomique
