Une étude récente publiée dans Pharmacologie Alimentaire et Thérapeutique rapporte que les patients avec un nombre d’haplotypes du virus de l’hépatite B (VHB) inférieur ou égal à deux sont plus susceptibles d’obtenir une guérison fonctionnelle avec un traitement contre l’hépatite B chronique.
Étude: Le nombre d’haplotypes du virus de l’hépatite B au départ est un marqueur prédictif de la guérison fonctionnelle pendant le traitement antiviral pour les patients atteints d’hépatite B chronique de génotypes A et D hbeag-positifs. Crédit d’image : eranicle / Shutterstock.com
Sommaire
Arrière plan
L’hépatite B chronique (HCB) est une maladie du foie potentiellement mortelle causée par une infection par le VHB. L’infection à CHB, qui touche environ 296 millions de personnes dans le monde, est associée à un risque accru de décès dû à la cirrhose et au cancer du foie.
En 2015, environ 887 000 personnes sont décédées directement des suites de maladies liées à l’HCB. Il n’y a aucun traitement connu pour CHB ; cependant, dans de rares cas, certains antiviraux peuvent accomplir ce que l’on appelle une «guérison fonctionnelle» ou l’élimination de l’antigène de surface de l’hépatite B (HBsAg) du sang.
Le VHB est un virus désoxyribonucléique (ADN) avec une phase d’acide ribonucléique (ARN) essentielle à la réplication virale. Il n’y a pas de relecture lorsque l’ARN est copié sur l’ADN, ce qui a conduit à l’émergence de neuf génotypes variants AI du génome du VHB.
Les génotypes A et D du VHB sont plus courants dans les pays occidentaux, tandis que les génotypes B et C sont fréquemment identifiés en Asie, et le génotype E est le plus courant en Afrique. Le nombre d’haplotypes (HN) est essentiellement une mesure de cette variété, une valeur inférieure indiquant un génome viral moins diversifié.
À l’aide d’une cohorte de test HBeAg-positif et d’une cohorte de validation indépendante HBeAg-positive, les chercheurs de la présente étude ont cherché à savoir si le HN par patient au départ était un biomarqueur approprié pour prédire la guérison fonctionnelle ou l’échec à obtenir un traitement fonctionnel chez les patients ayant reçu un traitement antiviral et si cela était spécifique au génotype.
À propos de l’étude
Des échantillons de base AgHBe positifs provenant de 86 patients infectés par le VHB de génotype A et D ont été examinés pour déterminer si le HN pouvait être utilisé comme biomarqueur de la perte d’AgHBs pendant le traitement par le fumarate de ténofovir disoproxil (TDF). Les résultats ont été validés à l’aide d’échantillons de base de 181 patients atteints des génotypes A et D du VHB utilisant un traitement au TDF ou au ténofovir alafénamide.
Dans les échantillons de base, la version CliqueSNV, un programme de reconstruction d’haplotype récemment développé explicitement créé pour les données NGS à lecture courte, a été utilisée pour reconstruire les haplotypes. Les patients HBsAg-positifs et HBsAg-perdus dans chaque cohorte ont été combinés pour déterminer le seuil optimal pour séparer les patients HBsAg-positifs des patients HBsAg-perdus.
Résultats de l’étude
Chez les patients HBeAg-positifs, le HN avant le traitement était inférieur à celui des patients HBeAg-négatifs. Dans la cohorte de test G103 AgHBe positif, le HN était significativement plus faible pour les génotypes A et D que pour les génotypes B et C.
Ces résultats suggèrent que la variabilité de la séquence, ou « plasticité », est associée à une probabilité réduite de perte de HBsAg. De plus, les niveaux de HN étaient plus élevés dans les génotypes asiatiques B et C que dans les génotypes A et D, peut-être parce que les génotypes B et C étaient généralement acquis pendant ou peu après l’accouchement par rapport aux génotypes A et D, qui sont généralement acquis plus tard dans la vie.
Par rapport aux patients qui sont restés HBeAg positifs dans la cohorte de test G103, il n’y avait aucune différence dans les valeurs HN de base entre les patients qui ont perdu HBeAg pendant le traitement. Cependant, pendant le traitement, les patients de génotype A ou D présentant une perte d’AgHBs présentaient au départ un HN du VHB de longueur génomique inférieure.
Selon la modélisation de régression logistique simple (SLR), le biomarqueur HN de base était le prédicteur le plus puissant, tandis que l’analyse de régression logistique multivariable (MLR) indiquait que ce biomarqueur n’était pas affecté par d’autres variables cliniques. Ainsi, les biomarqueurs HN binaires étaient des biomarqueurs de base indépendants pour identifier les patients qui obtiendraient une guérison fonctionnelle (perte de l’HBsAg) ou resteraient positifs pour l’HBsAg pendant le traitement.
La méthodologie HN a une utilité clinique en identifiant les patients peu susceptibles d’obtenir une guérison fonctionnelle avec les thérapies antivirales actuelles et peut nécessiter une thérapie complémentaire supplémentaire à mesure que de nouveaux traitements sont développés. De plus, cette approche peut déterminer quels patients sont les plus susceptibles d’obtenir une guérison fonctionnelle ou une perte d’HBsAg s’ils présentaient un HN inférieur au départ. HN était également un meilleur biomarqueur que les niveaux d’ADN HBsAg ou HBV au départ.
Le Dr Margaret Littlejohn du Royal Melbourne Hospital, scientifique médicale principale au VIDRL à l’Institut Doherty, a déclaré qu’il s’agissait d’un grand pas en avant dans la fourniture d’outils permettant aux cliniciens de traiter leurs patients plus efficacement.
« La pandémie de SRAS-CoV-2 a normalisé l’utilisation du séquençage (profond) de nouvelle génération pour l’analyse rapide des isolats viraux à une échelle sans précédent, y compris les études d’haplotype », a expliqué le Dr Littlejohn.
« Pour les patients vivant avec une hépatite B chronique, nous pouvons désormais établir la population d’haplotypes du VHB à partir d’un échantillon de sérum sanguin de manière rapide et efficace, en prédisant quels patients peuvent ou non obtenir une guérison fonctionnelle sous traitement dans certains contextes, offrant ainsi aux cliniciens un biomarqueur efficace de la réponse au traitement.
conclusion
Les données NGS sur la longueur du génome et la reconstruction d’haplotypes fournissent un nouveau marqueur pour les résultats cliniquement souhaités sur les schémas thérapeutiques antiviraux actuels chez les patients infectés par le VHB de génotype A et D.
