Dans un récent Réseau JAMA ouvert étude, les chercheurs examinent systématiquement les données existantes pour évaluer les périodes d’incubation de différentes variantes préoccupantes (COV) du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2).
Des études antérieures ont estimé la période d’incubation moyenne de l’infection par le SRAS-CoV-2 ; cependant, les estimations d’incubation rapportées varient en fonction de la taille de l’échantillon, de la conception de l’étude, de la période d’extraction des données et des pays où les études ont été menées. De plus, les périodes d’incubation des COV SARS-CoV-2 Delta et Omicron diffèrent de celles causées par la souche ancestrale Wuhan-Hu-1 ou de type sauvage (WT).
Étude: Période d’incubation de COVID-19 causée par des souches uniques de SRAS-CoV-2 Une revue systématique et une méta-analyse. Crédit d’image : Kateryna Kon/Shutterstock.com
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont déterminé la période d’incubation globale du COVID-19 mise en commun, ainsi que les périodes d’incubation des infections par différents COV du SRAS-CoV-2. L’objectif de cette étude était d’obtenir des informations qui pourraient être utilisées pour guider les processus d’élaboration de stratégies et de politiques de prévention et de contrôle du COVID-19, ainsi que pour réduire la transmission du SRAS-CoV-2.
Les données ont été recherchées dans les bases de données EMBASE, ScienceDirect et PubMed entre le 1er décembre 2019 et le 10 février 2022, à l’aide de mots clés tels que SARS-CoV-2, nouveau coronavirus, COVID-19, 2019-nCoV, incubation ou période d’incubation. . Il n’y avait aucune restriction de langue ou de statut de publication, tant que les résumés étaient disponibles en anglais.
Le principal résultat de l’étude était les estimations moyennes des périodes d’incubation du SRAS-CoV-2 par différents COV du SRAS-CoV-2. Des études originales évaluant la période d’incubation du COVID-19, qui est définie comme la durée entre l’infection par le SRAS-CoV-2 et l’apparition des symptômes, ont été incluses dans l’analyse. Les enregistrements ont été exclus s’il s’agissait d’éditoriaux, de critiques, de lettres aux éditeurs, d’articles de perspective, de commentaires, d’articles en double et d’articles dont les populations d’échantillons se chevauchaient.
L’examen a été effectué conformément aux éléments de rapport préférés pour les revues systématiques et les lignes directrices des méta-analyses (PRISMA). Trois examinateurs ont effectué une extraction de données de manière indépendante en mars 2022.
Les données sur le nom du premier auteur, la région d’étude, la durée de collecte des données, les caractéristiques de la population de l’échantillon, le type de COV du SRAS-CoV-2 et les estimations de la période d’incubation du COVID-19 ont été obtenues à partir des études incluses.
La qualité des études incluses a été évaluée de manière indépendante par deux chercheurs à l’aide de l’échelle de Newcastle-Ottawa (NOS) et de la modélisation des effets aléatoires, avec la méthode d’estimation de DerSimonian et Laird utilisée pour la méta-analyse.
Résultats de l’étude
Un total de 5 012 enregistrements ont été identifiés dans les bases de données, dont seulement 142 études comprenant 8 112 patients COVID-19 ont été prises en compte pour l’analyse quantitative finale ou la méta-analyse. Les enregistrements en double, les enregistrements de titres et de résumés, les articles en texte intégral non éligibles, les enregistrements avec d’autres résultats principaux et les enregistrements avec des données statistiques non disponibles ont été exclus de l’analyse.
Parmi celles incluses, 45, 82 et 15 études étaient respectivement de qualité forte, modérée et faible. Environ 76 % des études incluses ont été menées en Chine, dont 66 % publiées entre janvier et mars 2020.
Six, quatre et trois études ont été menées respectivement en Corée du Sud, en France et au Japon, tandis que deux études ont été menées à Singapour, en Inde, au Vietnam et en Australie. Environ 84 % des études comprenaient des patients infectés par la souche ancestrale WT, 3,5 % incluaient des patients atteints d’infections de souche différente et 7,7 % incluaient des patients atteints d’infections de souche inconnue par le SRAS-CoV-2.
Les études incluses étaient substantiellement hétérogènes (I2 = 99%); cependant, les chercheurs n’ont signalé aucun biais de publication dans les études. L’erreur type était également très faible pour toutes les études incluses sauf une.
La période d’incubation globale de la COVID-19 regroupée était de 6,6 jours et variait de 1,8 à 18,9 jours. Comparativement, les périodes d’incubation des infections par le SARS-CoV-2 causées par les COV Alpha, Beta, Delta et Omicron ont été documentées dans une, une, six et cinq études, respectivement.
Les périodes d’incubation moyennes des infections par le SARS-CoV-2 étaient de cinq, 4,5, 4,4 et 3,4 jours pour celles causées par les COV Alpha, Beta, Delta et Omicron, respectivement. Les périodes d’incubation moyennes de COVID-19 étaient de 7,4 jours chez les personnes de plus de 60 ans et de 8,8 jours chez les enfants de moins de 18 ans, de 7,0 jours chez les personnes atteintes de COVID-19 non sévère et de 6,7 jours chez les patients atteints de COVID-19 sévère.
Les périodes d’incubation de la COVID-19 chez les personnes âgées peuvent être plus longues que la période d’incubation regroupée en raison de réponses immunologiques à l’interféron de type 1 (IFN) plus lentes et plus faibles chez les personnes âgées. De plus, l’absence de réponses à la fièvre, la non-spécificité des présentations de la maladie et la présence de multiples comorbidités peuvent contribuer à retarder la détection de la COVID-19 chez les personnes âgées.
Les périodes d’incubation du COVID-19 étaient plus courtes que la période d’incubation du COVID-19 regroupée chez les enfants. Cela peut être attribué au fait que les enfants infectés par le SRAS-CoV-2 présentent généralement des symptômes légers de COVID-19 sans phénotype de pneumonie pulmonaire classique. Ainsi, les symptômes du COVID-19 pourraient être confondus avec d’autres maladies, rendant ainsi le COVID-19 difficile à détecter chez les enfants.
Néanmoins, les enfants peuvent transmettre le SRAS-CoV-2 pendant la période d’incubation et peuvent ne pas exprimer avec précision les symptômes du COVID-19. Les périodes d’incubation du COVID-19 étaient plus courtes que la période d’incubation regroupée dans les infections graves au SRAS-CoV-2, ce qui peut être lié au nombre de cellules infectées par le SRAS-CoV-2 aux stades initiaux.
conclusion
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude mettent en évidence l’évolution du SRAS-CoV-2 et l’émergence de variants du SRAS-CoV-2 avec une virulence et une transmissibilité différemment améliorées. De plus, les périodes d’incubation du COVID-19 ont été progressivement réduites du COV Alpha au COV Omicron.
L’évaluation des périodes d’incubation de la COVID-19 causée par différents COV du SRAS-CoV-2 est essentielle pour déterminer les périodes de quarantaine appropriées.
