Dans une étude récente publiée dans Le microbe Lancet, les chercheurs ont évalué l’exactitude diagnostique des échantillons des voies respiratoires supérieures pour la tuberculose pulmonaire (TB) active par rapport aux tests standard d’expectoration ou d’aspiration gastrique.
Étude: Précision des échantillons des voies respiratoires supérieures pour diagnostiquer Mycobacterium tuberculosis : une revue systématique et une méta-analyse. Crédit d’image : Gorodenkoff/Shutterstock.com
Arrière-plan
Diagnostiquer une maladie pulmonaire causée par Mycobacterium tuberculosis est difficile en raison de l’accès limité aux tests, des difficultés d’échantillonnage et des problèmes de sensibilité des tests.
En 2021, plus de 4 millions de patients tuberculeux sur un total estimé de 10,6 millions n’ont pas été diagnostiqués, avec seulement 63 % des personnes diagnostiquées avec une tuberculose pulmonaire confirmée bactériologiquement. La confirmation bactérienne est cruciale pour un diagnostic précis et un traitement efficace contre la résistance aux médicaments.
Alors que les adultes utilisent généralement les crachats pour le diagnostic mais peuvent également utiliser l’urine, les enfants, qui ne peuvent souvent pas produire de crachats, peuvent recourir à des alternatives telles que les crachats provoqués, l’aspiration nasopharyngée et le lavage gastrique.
L’Organisation mondiale de la santé (OMS) a récemment recommandé les selles comme échantillon pour le diagnostic de la tuberculose, mais il existe une demande pour des échantillons centrés sur le patient, facilement accessibles et compatibles avec divers tests.
Le prélèvement des voies respiratoires supérieures, rapide et peu invasif, pourrait améliorer l’accès au diagnostic, en particulier pour les personnes incapables de produire des crachats. Des recherches supplémentaires sont essentielles pour affiner ces méthodes de diagnostic afin de mieux répondre aux besoins des patients.
À propos de l’étude
La présente revue systématique et méta-analyse, suivant un protocole publié en ligne, a été réalisée en utilisant l’expertise de la bibliothèque de la Liverpool School of Tropical Medicine.
Des recherches approfondies ont été effectuées dans des bases de données telles que Medical Literature Analysis and Retrieval System Online (MEDLINE), Global Health, Cinahl, Web of Science et Global Health Archive jusqu’en décembre 2022.
Les critères de recherche englobaient divers termes liés à la tuberculose et aux méthodes d’échantillonnage des voies respiratoires supérieures.
Par rapport aux méthodes traditionnelles, la recherche a analysé des études sur l’exactitude de l’échantillonnage des voies respiratoires supérieures pour le diagnostic de la tuberculose. Elle comprenait des études de cohorte, transversales et contrôlées dans divers contextes sans barrière linguistique, à l’exclusion des études non axées sur la tuberculose active.
Lors de la collecte des titres et des résumés, ceux qui n’avaient aucun rapport ont été exclus et un sous-ensemble a été revérifié pour en assurer la cohérence par un autre évaluateur. Deux évaluateurs indépendants ont déterminé la pertinence des manuscrits sélectionnés et un troisième a réglé les éventuels désaccords.
Pour les études non anglophones, des traductions ont été effectuées et les données ont été extraites à l’aide d’un formulaire structuré ; lorsque les manuscrits comportaient plusieurs ensembles de données, chacun était traité comme un rapport distinct.
Pour l’analyse, les données ont été résumées et des parcelles forestières ont été créées pour différentes méthodologies d’échantillonnage. À l’aide d’un modèle hiérarchique à effets aléatoires, la sensibilité et la spécificité regroupées ont été déterminées.
Une méta-régression, tenant compte de deux normes de référence, a été réalisée et les rapports de cotes diagnostiques, ainsi que les rapports de vraisemblance positifs et négatifs, ont été calculés. Pour les études sur les enfants, des modèles distincts utilisant une norme de référence combinée ont été utilisés.
L’enregistrement de l’étude s’est fait auprès du Registre prospectif international des revues systématiques (PROSPERO) (CRD42021262392), et le risque de biais a été évalué à l’aide de l’outil d’évaluation de la qualité des études sur l’exactitude des diagnostics-2 (QUADAS-2).
Résultats de l’étude
Dans l’analyse complète de la recherche, 9 680 études ont été identifiées jusqu’en janvier 2021, et 1 364 autres ont été trouvées grâce à une recherche étendue jusqu’en décembre 2022. Après avoir supprimé les doublons, il restait 10 159 études, dont 71 ont été incluses dans la revue systématique.
Cette compilation comprenait des rapports sur les comparaisons de tests et un sous-ensemble a été inclus dans les méta-analyses. Ces études ont différencié l’échantillonnage des voies respiratoires supérieures en quatre catégories principales : aspiration nasopharyngée, écouvillons laryngés, écouvillons oraux et un groupe divers contenant des écouvillons nasaux, des bains de bouche, de la salive et d’autres échantillons de muqueuses ou dentaires.
Ces études s’étendent de mai 1933 à décembre 2022 et proviennent de divers pays, dont le Royaume-Uni, l’Afrique du Sud, la Norvège, etc., certains pays n’ayant contribué qu’à une seule étude.
Les données comprenaient 24 899 échantillons provenant de divers endroits comme des cliniques, des hôpitaux et des sanatoriums, certaines études ciblant spécifiquement les enfants et d’autres se concentrant sur les adultes. Parmi les données démographiques, 57,7 % des 3 173 participants étaient des hommes, 42,3 % des femmes et 19,5 % des 3 709 participants ont été testés séropositifs.
D’autres analyses révèlent que 41 rapports ont évalué l’exactitude des écouvillons laryngés. De mai 1941 à mars 1968, ces études ont présenté différentes méthodologies en fonction de la technologie disponible.
Utilisant des cultures d’expectorations ou de lavage gastrique comme test de référence principal, l’analyse a révélé un niveau spécifique de sensibilité et de spécificité ; cependant, la méta-régression a mis en évidence une variation notable de spécificité, indiquant une incohérence significative entre les études.
Neuf études menées entre novembre 1998 et mai 2021 ont évalué exclusivement l’exactitude de l’aspiration nasopharyngée chez les enfants. Différentes méthodologies ont été utilisées et une méta-régression ultérieure, prenant en compte les types de tests de référence utilisés, a montré une différence significative de spécificité.
De plus, 18 études ont comparé les prélèvements oraux par écouvillonnage aux normes de référence microbiologiques.
L’analyse de ces études entre 2015 et 2022 pointe vers un certain taux de sensibilité et de spécificité. Une méta-régression plus poussée a détecté un impact significatif sur la spécificité en fonction de la norme de référence choisie.
Certaines études ont analysé d’autres types d’échantillons, notamment des bains de bouche et de la salive, mais leur nombre était limité et n’a pas permis une méta-analyse complète.
Enfin, les études plus anciennes, en particulier celles antérieures à 1950, manquaient de données sur des domaines spécifiques permettant d’évaluer le risque de biais. Des études plus récentes ont également montré un risque élevé dans la sélection des participants en raison de conceptions diverses et de normes de référence variées.
