Les scientifiques de l'Institut Van Andel ont développé une technique améliorée pour profiter de manière globale la méthylation de l'ADN dans les cellules uniques, une avance qui aidera les chercheurs à mieux étudier le rôle de l'épigénétique dans le cancer et d'autres maladies.
La méthylation de l'ADN est un mécanisme épigénétique qui influence comment et quand les instructions dans l'ADN sont utilisées sans changer la séquence d'ADN elle-même. En conséquence, la méthylation de l'ADN est un acteur clé dans de nombreux processus biologiques fondamentaux, notamment le développement, l'expression des gènes et la différenciation cellulaire. Les erreurs de méthylation sont des contributeurs bien connus au cancer et ont été impliqués dans une multitude d'autres troubles.
La nouvelle méthode, appelée SCDEEP-MC, fournit des cartes à très haute résolution de méthylation de l'ADN et est la technique de méthylation de l'ADN une seule cellule la plus efficace développée à ce jour. Les scientifiques peuvent utiliser SCDEEP-MC pour révéler de nouvelles perspectives puissantes sur la biologie unique et identifier les différences qui distinguent les types de cellules rares des autres cellules. SCDEEP-MC prend également en charge de nombreuses analyses de pointe dans les cellules uniques, notamment l'estimation de l'âge cellulaire en utilisant des horloges épigénétiques, l'analyse de l'hémiméthylation et la création de profils épigénétiques d'inactivation du chromosome entièrement chromosomique.
Une étude décrivant SCDEEP-MC a récemment été publiée dans la revue Communications de la nature. Peter W. Laird de Vai, Ph.D., et Hui Shen, Ph.D., sont des auteurs co-corrésideurs.
« SCDEEP-MC nous permet de voir la méthylation de l'ADN à différents stades de réplication de l'ADN dans les cellules individuelles – quelque chose qui n'a pas été possible jusqu'à présent,« Dit Nathan Spix, Ph.D., co-pri-premier auteur de l'étude et boursier postdoctoral dans le Laird Lab. »Par exemple, SCDEEP-MC peut nous aider à identifier les changements de méthylation de l'ADN précoce dans les cellules uniques qui deviennent cancéreuses. Si nous savons ce qui ne va pas dans les premiers stades de ce processus, nous pouvons utiliser ces informations pour développer de nouvelles façons de détecter et de traiter la maladie.«
En raison de limitations techniques, d'autres méthodes d'analyse de méthylation de l'ADN ne permettent pas de comparaisons directes entre les cellules. Au lieu de cela, ils exigent que les scientifiques moyennent des signaux de groupes de cellules, obscurcissant des différences importantes mais subtiles entre les cellules individuelles. Les données à haute résolution de SCDEEPEEP-MC permettent aux scientifiques d'identifier plus efficacement les sous-types cellulaires, les modèles de méthylation et d'autres caractéristiques importantes telles que les différences entre les cellules plus anciennes et les cellules nouvellement répliquées.
