Les derniers résultats de recherche montrent que les anticorps neutralisants induits par le vaccin contre le SRAS-CoV-2 sont principalement dirigés contre l’un des deux principaux domaines de la machinerie d’entrée virale.
Les résultats soulignent également un rôle clé du même domaine de la pointe dans l’obtention d’une large réponse anticorps contre de nombreuses variantes, ainsi que des virus apparentés.
Les deux résultats suggèrent des stratégies pour le développement clinique de vaccins résistants aux variants et de vaccins contre le sarbecovirus dans le cadre de la future préparation à une pandémie.
Les protéines de pointe, qui donnent au virus son apparence de couronne, permettent au virus de pénétrer dans les cellules hôtes. Une sous-unité de la protéine de pointe s’engage avec un récepteur sur la cellule hôte et reconnaît quand un atterrissage correct s’est produit.
La pointe adopte également une configuration à ressort. Sa forme change car elle force la fusion du virus à la cellule hôte, déclenchant ainsi l’infection.
Les anticorps tentent de conjurer une invasion de cellules par le SRAS-CoV-2 en se liant aux sites de la protéine de pointe virale. Un large éventail de vaccins actuellement disponibles, ou la propre réponse du système immunitaire à un accès de COVID-19, peut susciter de tels anticorps.
Une équipe de recherche internationale dirigée par David Veesler, professeur agrégé de biochimie à l’Université de Washington à Seattle et chercheur au Howard Hughes Medical Institute, a décidé d’examiner, à l’aide de la microscopie cryoélectronique et d’autres méthodes, la spécificité des réponses d’anticorps dirigées par les protéines de pointe. Ils voulaient évaluer la contribution relative du site de liaison de l’anticorps à l’activité neutralisante contre les variants du SRAS-COV-2.
Grâce à cela et à des travaux connexes, ils ont voulu comprendre l’influence des différentes conformations des protéines de pointe sur l’activité de neutralisation des anticorps du plasma sanguin. De telles informations pourraient aider à découvrir des moyens de moduler l’ampleur et l’étendue des anticorps contre le SRAS-CoV-2.
Les chercheurs ont étudié des échantillons de plasma d’individus qui n’avaient pas été exposés au COVID-19, mais qui avaient reçu la première série de doses de l’un des sept vaccins les plus administrés dans le monde. De plus, ils examinent des échantillons de sujets ayant des antécédents d’infection et de vaccination. Ils ont également examiné un plasma convalescent de personnes qui avaient contracté le COVID-19 avant janvier 2021, lorsque les programmes de vaccination ont commencé.
Leurs résultats sont publiés dans Science Immunology le 10 novembre. L’article s’intitule « La conformation du pic SARS-CoV-2 détermine l’activité neutralisante du plasma provoquée par un large panel de vaccins humains ». L’auteur principal de l’article est John E. Bowen du Veesler Lab.
Les scientifiques ont observé une forte corrélation entre l’activité inhibitrice du virus in vitro du plasma des participants et l’ampleur des réponses d’anticorps contre la forme de préfusion de la protéine de pointe. Cela était vrai pour tous les vaccins évalués et pour les anticorps induits par une infection antérieure.
« Nous avons observé une corrélation positive comparable entre l’activité de neutralisation des anticorps et les réponses des anticorps de liaison S1, suggérant un rôle clé des anticorps dirigés contre S1 pour la neutralisation du SRAS-CoV-2 », ont écrit les chercheurs. S1 est l’unité de protéine de pointe impliquée dans l’engagement des récepteurs de la cellule hôte, la première partie de l’attaque virale contre une cellule.
Les chercheurs ont également découvert que la neutralisation des échantillons de plasma d’anticorps correspondait également à la présence d’anticorps ciblant spécifiquement deux domaines sur l’unité de protéine de pointe S1. Des études antérieures avaient suggéré que ces deux domaines, nommés NTD et RBD, étaient les principales cibles des réponses d’anticorps neutralisants lors d’une infection ou après la vaccination.
Ces anticorps hôtes dirigés contre les NTD et les RBD peuvent également expliquer en partie la pression sélective évolutive sur ces parties du virus. Cette pression sélective peut avoir conduit à une accumulation rapide de mutations dans des variantes pour tenter de déjouer cette stratégie immunitaire, ont suggéré les scientifiques.
Les chercheurs ont également découvert que les anticorps contre le site RBD expliquent la plus grande étendue de la réponse des anticorps neutralisants croisés, contre un certain nombre de variantes du SRAS-CoV-2, par rapport à la concentration plus étroite des anticorps qui se sont concentrés sur le site NTD.
« Plusieurs anticorps largement neutralisants contre le sarbecovirus reconnaissent des sites antigéniques RBD distincts », ont noté les chercheurs. Le Sarbecovirus est le plus grand groupe de virus qui comprend le coronavirus pandémique.
D’autre part, le ciblage de la sous-unité S2, qui est la partie du pic impliquée dans la fusion membranaire, n’a pas beaucoup contribué à l’activité neutralisante induite par le vaccin. Ces anticorps étaient peu nombreux et de faible puissance.
Les résultats, ont conclu les chercheurs, suggèrent l’utilité potentielle du développement de vaccins à base de RBD contre le SRAS-CoV-2 et le groupe plus large de sarbecovirus apparentés dans le cadre de la future préparation à une pandémie.
