Dans une étude récente publiée sur le bioRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs évaluent la sensibilité de la sous-lignée Omicron BA.2.75 du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) à la neutralisation.
Étude: Sensibilité à la neutralisation de la sous-lignée SARS-CoV-2 Omicron BA.2.75. Crédit d’image : gan chaonan / Shutterstock.com
Sommaire
Arrière plan
Le 15 juillet 2022, le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) a classé la sous-lignée SARS-CoV-2 Omicron BA.2.75 comme une variante d’intérêt (VOI). La surveillance génétique de BA.2.75 a indiqué que ce variant était responsable d’une augmentation rapide du nombre d’infections séquencées.
Par rapport à la sous-lignée Omicron BA.2, la protéine de pointe de BA.2.75 variait de neuf résidus d’acides aminés du domaine N-terminal et du domaine de liaison au récepteur (RBD). Ces mutations ont conduit à une réduction significative de la sensibilité virale à la neutralisation par les anticorps.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs examinent l’effet des mutations de pointe du SRAS-CoV-2 sur l’activité des anticorps monoclonaux et polyclonaux en évaluant la sensibilité à la neutralisation du SRAS-CoV-2 Omicron BA.2.75.
Ici, les chercheurs ont collecté des échantillons de sérum de deux cohortes longitudinales composées de travailleurs de la santé (TS) et de personnes âgées éligibles à la vaccination Pfizer-BioNTech BNT162b2 COVID-19.
Tous les échantillons de sérum collectés ont été testés pour vérifier l’absence de tout anticorps ciblant la protéine de la nucléocapside (N) du SRAS-CoV-2, car cela suggérerait des antécédents d’infection antérieure par le SRAS-CoV-2. Les participants qui avaient déjà été infectés par le SRAS-CoV-2 ou qui avaient été testés positifs au test d’amplification des acides nucléiques du SRAS-CoV-2 ont été exclus de l’étude.
Les chercheurs ont estimé des dilutions inhibitrices de sérum à 50 % (IDannées 50) dans des échantillons prélevés quatre semaines après l’administration de la vaccination de rappel BNT162b2 dans un groupe de 30 travailleurs de la santé et participants âgés. Tous les participants éligibles avaient des antécédents de vaccination antérieure avec deux doses de BNT162b2 sans incidence d’infections intermittentes par le SRAS-CoV-2.
De plus, l’activité de 17 anticorps monoclonaux différents autorisés à traiter les infections par le SRAS-CoV-2 a été examinée en estimant leurs concentrations inhibitrices à 50 % (ICannées 50).
Résultats de l’étude
Bien que l’activité neutralisante contre les sous-lignées SARS-CoV-2 Omicron ait été significativement inférieure à la sous-lignée B.1, les variations entre les sous-lignées Omicron individuelles étaient moins remarquables. La moyenne géométrique ID50 les valeurs étaient de 6 429, 1 725, 615, 1 052 et 1 203 par rapport aux sous-lignées B.1, BA.2, BA.4/5, BA.2.12.1 et BA.2.75, respectivement. Par rapport aux autres sous-lignées Omicron, l’activité sérique anti-BA.2.75 était nettement inférieure à celle de BA.2 et supérieure à celle contre BA.4/5.
Sensibilité à la neutralisation de la sous-lignée BA.2.75. (UN) Dilutions inhibitrices à cinquante pour cent (ID50) contre les variants du SRAS-CoV-2 dans des échantillons prélevés quatre semaines après une vaccination de rappel BNT162b2 (n = 30) déterminées par un test de neutralisation du pseudovirus. Les cercles indiquent les ID50 moyens de deux expériences pour chaque variante et participant individuel. Les barres et les nombres indiquent la moyenne géométrique ID50. Les lignes pleines indiquent les intervalles de confiance à 95 % et la ligne pointillée indique la limite inférieure de quantification. (B) Concentrations inhibitrices à cinquante pour cent (CI50) d’anticorps monoclonaux contre les variants du SRAS-CoV-2 déterminées par un test de neutralisation du pseudovirus (CI50 moyenne de deux expériences pour chaque variant).
La plupart des 17 anticorps monoclonaux n’ont pas pu neutraliser efficacement BA.2.12.1, BA.2 ou BA.4/5.; cependant, la plupart de ces anticorps ont montré une activité significative contre BA.2.75. Par exemple, des anticorps comme le regdanvimab et le tixagevimab, qui sont autorisés pour le traitement et la prévention du SRAS-CoV-2 en Corée du Sud, ont montré une activité indétectable et médiocre, respectivement, contre les sous-lignées Omicron. Néanmoins, ces anticorps présentaient une puissante neutralisation contre BA.2.75.
De même, le bebtélovimab a également montré une activité de neutralisation significativement puissante contre BA.2.75. Pris ensemble, 30 à 35 % des anticorps neutralisaient efficacement les sous-lignées BA.2.12.1, BA.2 ou BA.4/5, tandis que 59 % des anticorps neutralisaient BA.2.75.
Activité neutralisante des anticorps monoclonaux. Courbes de neutralisation du pseudovirus SARS-CoV-2 ajustées des anticorps monoclonaux. Les cercles et les barres représentent les valeurs moyennes de deux expériences (chacune réalisée avec des doublons techniques) et l’écart type. Les lignes pointillées indiquent une neutralisation de 50 %.
conclusion
Les résultats de l’étude indiquent que les mutations détectées dans la protéine de pointe de la sous-lignée SARS-CoV-2 Omicron BA.2.75 ont réduit la sensibilité virale à l’activité neutralisante induite par les vaccins COVID-19 par rapport à BA.2. De plus, BA.2.75 était plus sensible aux anticorps monoclonaux neutralisants du SRAS-CoV-2, y compris ceux qui sont actuellement approuvés pour traiter le COVID-19.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
