Dans cet épisode du podcast omg OMx, Kate Stumpo de Bruker entre dans l’esprit d’une pionnière de l’immunopeptidomique, Nicola Ternette, pour discuter de la façon dont son travail a contribué à faire la lumière sur le rôle des peptides dans le système immunitaire. Regardez l’épisode complet ci-dessous ou poursuivez votre lecture pour découvrir certains moments forts.
Nicolas Ternette | mon Dieu Podcast OMx | Ép. 8
Sommaire
Où a commencé votre voyage ?
J’ai commencé mes études en Allemagne, en me concentrant sur la physique et la biochimie. Au cours de mes recherches, je me suis intéressé à la virologie et au développement de vaccins. Plus précisément, j’ai travaillé sur le développement d’un vaccin contre le virus respiratoire syncytial. Mes recherches ont montré les limites des approches vaccinales traditionnelles et la nécessité de modifier les gènes pour la production appropriée de protéines de surface virales. Cela m’a conduit à Oxford, où je me suis concentré sur la découverte d’antigènes et le développement de vaccins.
À Oxford, j’ai découvert la spectrométrie de masse et sa capacité à analyser de manière exhaustive des échantillons de protéines. En collaboration avec des experts en recherche sur le VIH, j’ai étudié la façon dont les cellules infectées sont perçues par le système immunitaire, ce qui a éclairé le développement de vaccins et fait progresser notre compréhension de l’immunologie.
Fort de cette expertise, j’ai créé mon groupe de recherche, spécialisé dans le profilage de molécules immuno-pertinentes dans diverses maladies, avec un accent particulier sur le cancer. Nous visons à utiliser ces informations pour améliorer les stratégies de développement de vaccins.
Mon parcours académique et professionnel a consisté à comprendre la réponse immunitaire aux infections virales et à exploiter ces connaissances pour développer des vaccins efficaces.
Pourriez-vous s’il vous plaît donner un aperçu de l’immunopeptidomique et de son importance dans le domaine de la recherche biologique ?
L’immunopeptidomique utilisant la spectrométrie de masse est un outil puissant pour étudier plusieurs questions biologiques. Traditionnellement, les extraits de protéines des cellules sont séparés en fonction de leur taille à l’aide d’une matrice, et des protéines spécifiques sont détectées à l’aide d’anticorps. Cependant, cette approche présente des limites en termes de profondeur d’analyse qu’elle peut fournir. Elle permet principalement de déterminer la présence ou l’absence de protéines spécifiques, comme la protéine APRT.
En revanche, la spectrométrie de masse révolutionne l’analyse des protéines en offrant une gamme d’outils plus large. Avec la spectrométrie de masse, même une petite partie de la matrice protéique peut être analysée, conduisant à l’identification de nombreuses protéines dans l’échantillon. Cette nouvelle capacité permet une comparaison facile entre les cellules infectées et non infectées, facilitant ainsi la compréhension des changements survenant au cours de l’infection. Par conséquent, l’immunopeptidomique élargit notre compréhension de la dynamique des protéines et contribue de manière significative au domaine de la recherche biologique.
Crédit image : Spectrométrie de masse Bruker Life Sciences
Vous souvenez-vous de ce moment « oh mon Dieu » qui a changé votre monde et vous a donné envie de bâtir une carrière scientifique ?
L’étude que j’ai menée visait à comprendre comment le virus interagit avec les cellules hôtes, notamment en ce qui concerne sa visibilité auprès du système immunitaire et ses mécanismes d’évasion. Notre approche mécaniste s’est concentrée sur le profilage d’antigènes spécifiques plutôt que sur le développement de vaccins.
Je n’ai pas eu un seul moment « oh mon dieu ». Au contraire, j’ai réalisé au fil du temps le potentiel de cette information pour identifier ce que le système immunitaire reconnaît dans les cellules malades, y compris les cellules cancéreuses.
Cela a conduit à des collaborations avec l’industrie pour fournir des informations précises pour le développement de thérapies cliniques. Ces collaborations se sont principalement concentrées sur le traitement du cancer et ont abouti à des partenariats visant à faire progresser les molécules vers les essais cliniques. Je trouve très enthousiaste à l’idée de contribuer au développement de thérapies contre le cancer de nouvelle génération.
Comment la pandémie a-t-elle influencé vos recherches (pour le meilleur ou pour le pire) avec l’attention désormais portée aux virus et aux vaccins ?
La pandémie a influencé mes recherches en mettant en évidence l’impact et l’efficacité des vaccins dans la prévention des maladies. Les efforts mondiaux de vaccination ont démontré la sécurité et l’efficacité des vaccins, ce qui est pertinent pour le développement de vaccins contre les tumeurs.
Les campagnes de vaccination généralisées ont inspiré la confiance de la communauté scientifique et de la population en général quant à l’efficacité des vaccins dans la protection contre les infections. Dans le domaine de la recherche sur le cancer, nous prévoyons de constater l’impact des vaccins alors que de nombreux essais cliniques sont en cours.
En outre, des évolutions positives ont été enregistrées dans la rationalisation des processus réglementaires pour l’application clinique des vaccins, ce qui a permis de raccourcir les délais de mise en pratique clinique. Cela présente d’importantes opportunités pour faire progresser notre compréhension et notre utilisation des vaccins.
Crédit image : Shutterstock/Alpha Tauri 3D Graphics
L’immunopeptidomique est actuellement un domaine en plein essor. Qu’espérez-vous voir dans les 10 à 15 prochaines années ?
Au cours des 10 à 15 prochaines années, nous prévoyons des développements et des progrès significatifs en immunopeptidomique. Il existe un optimisme quant au fait que l’immunopeptidomique et la spectrométrie de masse joueront un rôle majeur dans le développement d’immunothérapies de nouvelle génération, en particulier pour le traitement du cancer.
Les études en cours basées sur les résultats de la spectrométrie de masse devraient fournir des preuves cliniques de son efficacité d’ici dix ans. L’identification d’antigènes ciblables par spectrométrie de masse progresse peut-être plus lentement mais reste un sujet de discussion au sein de la communauté scientifique. Les efforts de collaboration visent à améliorer notre compréhension des protéines associées au cancer et à améliorer leur annotation.
Dans l’ensemble, les 10 à 15 prochaines années offrent des perspectives passionnantes en matière de ciblage clinique en immunopeptidomique, même s’il reste encore beaucoup à découvrir et à comprendre dans ce domaine.
À propos de l’orateur
Le Dr Nicola Ternette est un expert de premier plan dans le domaine de l’immunopeptidomique. Elle a obtenu son diplôme et son doctorat en biochimie de l’Université de Bochum en Allemagne. Elle est récipiendaire du prix de la Fondation Ruth et Gert Massenberg pour avoir été première de sa promotion, et elle a reçu des bourses du DAAD et de la DFG pour poursuivre ses travaux postdoctoraux à l’Université d’Oxford, où elle est maintenant professeure agrégée. Ses travaux ont été publiés dans des revues scientifiques de premier plan. Le Dr Ternette est passionné par l’utilisation de la spectrométrie de masse pour faire progresser notre compréhension du système immunitaire. Elle intervient fréquemment lors de conférences scientifiques et s’engage à former la prochaine génération de scientifiques à l’utilisation de cette technologie puissante.
À propos de la spectrométrie de masse Bruker Life Sciences
Découvrez de nouvelles façons d’appliquer la spectrométrie de masse aux défis analytiques les plus urgents d’aujourd’hui. Des innovations telles que la mobilité ionique piégée (TIMS), les lasers à faisceau intelligent et à balayage pour l’imagerie MALDI-MS qui offrent une véritable fidélité des pixels, et la technologie FTMS (XR) à résolution extrême capable de révéler les signatures de structure fine isotopique (IFS) poussent l’exploration scientifique vers de nouveaux sommets. . Les solutions de spectrométrie de masse de Bruker permettent aux scientifiques de faire des découvertes révolutionnaires et d’acquérir des connaissances plus approfondies.
