Dans une étude récente publiée dans le Journal de la résistance antimicrobienne mondialeles chercheurs ont comparé les tendances de la résistance aux antimicrobiens (RAM) chez les Escherichia coli souches d’un laboratoire communautaire (CB) privé et commercial [Southern.IML Pathology (S.IML)] et un laboratoire public HB (en milieu hospitalier) [part of the New South Wales Health Pathology (NSWHP) network] dans la région d’Illawarra Shoalhaven située à NSW, Australie.
Sommaire
Arrière plan
Les antibiotiques sont couramment prescrits pour les infections urinaires (infections des voies urinaires), dont la plupart sont causées par E. coli. En Australie, la prévalence de la résistance aux antimicrobiens dans l’urine Escherichia coli souches a considérablement augmenté au cours de la décennie précédente, soulevant d’importantes préoccupations de santé publique. En Australie, les données sur la RAM proviennent principalement des hôpitaux. Cependant, la plupart des tests de laboratoire sont effectués et des ordonnances d’antibiotiques sont émises pour les infections des voies urinaires dans les milieux communautaires.
Les enquêtes AGAR (groupe australien sur la résistance aux antimicrobiens) ont documenté une plus grande résistance aux antimicrobiens dans les isolats d’HB ; cependant, les tendances ou les volumes entre les laboratoires CB et HB n’ont pas été comparés. Depuis lors, les stratégies nationales de surveillance australiennes ont mis l’accent sur les isolats sérologiques, dont la plupart sont à apparition de CB.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont évalué les tendances et les niveaux de résistance aux antimicrobiens parmi les souches de Escherichia coli sur 12 ans en comparant les données des laboratoires HB et CB situés dans la région d’Illawarra Shoalhaven en Australie.
Au total, 108 262 urinaires Escherichia coli souches ont été analysées, dont 34 103 isolats et 74 159 isolats ont été obtenus du laboratoire public HB et du laboratoire privé CB, respectivement, entre le 1er janvier 2007 et le 31 décembre 2019. Une modélisation de régression linéaire a été effectuée pour évaluer de manière indépendante les changements dans la résistance aux antimicrobiens taux parmi les deux ensembles de données de laboratoire et identifier les interactions significatives de chaque environnement de laboratoire dans les changements proportionnels au cours de l’étude.
Les différences entre la résistance à chaque antibiotique dans les laboratoires HB et CB ont été évaluées. Pour tester la sensibilité aux antimicrobiens, des techniques de diffusion sur disque telles que le CDS (sensibilité dichotomique calibrée) et l’EUCAST (comité européen sur les tests de sensibilité aux antimicrobiens) ont été réalisées pour la période allant jusqu’en 2014 et de 2015 à 2019, respectivement. L’isolat initialement obtenu pour chaque patient de plus de 12 ans a été analysé. Les données obtenues entre le 30 novembre 2013 et le 31 janvier 2015, englobant le changement de méthode de test, ont été exclues de l’étude.
Les informations, y compris les numéros d’identification des patients, les numéros d’accès, les dates d’isolement, la sensibilité aux antimicrobiens et les sites de détection des organismes, ont été récupérées auprès des deux fournisseurs de pathologie. Les agents antimicrobiens analysés comprenaient l’ampicilline (représentative de l’amoxicilline), la céphalexine, l’acide clavulanique d’amoxicilline, le triméthoprime et la norfloxacine.
Résultats
Les schémas antimicrobiens étaient comparables pour l’urine Escherichia coli souches analysées dans les deux laboratoires au cours des 12 années. Les taux de résistance aux antimicrobiens étaient attendus et systématiquement plus élevés dans les milieux HB, alors que les volumes de résistance Escherichia coli souches pour les antibiotiques couramment prescrits tels que l’ampicilline et le triméthoprime était considérablement plus élevée dans le laboratoire CB.
Le seul antimicrobien inclus, pour lequel les tendances de la RAM parmi Escherichia coli n’a pas changé de manière significative, était l’ampicilline sur 12 ans dans les laboratoires HB ou CB, et des taux de RAM significativement élevés ont été observés pour tous les autres antibiotiques au cours de la période dans les deux laboratoires. Cependant, les taux de changement différaient significativement entre les deux laboratoires, avec une convergence pour le triméthoprime et une divergence pour la norfloxacine et la céphalexine.
L’amoxicilline-clavulanate et l’ampicilline n’ont pas montré d’interactions significatives entre les deux laboratoires pour les différences dans les taux de changement au cours de la durée de 12 ans de l’étude. Les données sur l’HB étaient biaisées en faveur des personnes présentant des taux élevés de RAM en raison de l’échec du traitement dans les milieux communautaires, des réadmissions à l’hôpital et des durées prolongées de séjour à l’hôpital. Le résultat s’est affiché dans la moindre résistance de E. coli triméthoprime (15 %) documenté dans les données CB, par rapport aux données de l’enquête AGAR pour les E. coli isolats en Australie (23 %) et NSW (24 %).
La différence dans les taux de résistance pourrait probablement être généralisée à la population de l’Australie sur la base des données de recensement pour la région d’Illawarra en tant qu’indicateur de la population du pays. Les données de laboratoire basées sur la communauté ont montré un plus grand nombre E. coli isolats par rapport aux données de laboratoire HB pour la norfloxacine, le triméthoprime et l’ampicilline.
De plus, les taux élevés de résistance au triméthoprime sur 12 ans étaient plus élevés dans l’ensemble de données de laboratoire communautaire. La plupart E. coli isolats dans l’ensemble de données de laboratoire HB, et un peu plus de 40,0 % des isolats dans l’ensemble de données de laboratoire CB présentaient une résistance à l’ampicilline. D’autre part, les tendances à l’augmentation des taux de résistance à la norfloxacine et à la céfalexine étaient plus importantes dans l’ensemble de données de laboratoire HB.
Conclusion
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont montré que les taux de RAM dans le laboratoire privé CB et le laboratoire public HB augmentaient avec le temps et étaient systématiquement plus élevés dans l’ensemble de données HB. Étant donné que les volumes les plus importants ont été signalés en milieu ambulatoire et que la plupart des antibiotiques sont prescrits dans les établissements de soins de santé primaires, les interventions intégrant des données en milieu ambulatoire sont essentielles pour lutter contre la résistance aux antimicrobiens.
