SHENZHEN, Chine, 10 mai 2023 – MGI Tech Co. Ltd. (MGI), une entreprise engagée dans la construction d’outils et de technologies de base pour diriger les sciences de la vie, a annoncé aujourd’hui qu’un total de près de 60 000 échantillons ont été séquencés dans 21 instituts et plus de 10 nations participantes à travers l’Europe, dans le cadre du projet Million Microbiome of Humans (MMHP) qui a été officiellement lancé en 2019.
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Le projet a été lancé dans le cadre d’un effort conjoint par l’Institut Karolinska de Suède, le Centre national de recherche clinique de Shanghai sur les maladies métaboliques en Chine, l’Université de Copenhague au Danemark, l’Université technique du Danemark, MetaGenoPolis de l’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement. (INRAE) en France, et le Centre letton de recherche et d’études biomédicales. S’appuyant sur la technologie de base DNBSEQ™ de MGI, MMHP vise à séquencer et analyser l’ADN microbien d’un million d’échantillons humains pour construire une carte du microbiome du corps humain et construire la plus grande base de données sur le microbiome humain au monde.
« D’innombrables études ont mis en évidence l’importance du microbiome dans la santé et la maladie humaines. Pourtant, notre connaissance de la composition du microbiome dans différentes parties du corps selon les pays, les âges, les sexes et en relation avec la santé et la maladie humaines reste limitée », a déclaré Duncan Yu, président de MGI. « Grâce au MMHP, nous faisons avancer la recherche métagénomique microbienne tout en permettant aux chercheurs de la communauté microbiologique d’accéder à la technologie de séquençage innovante de MGI. Malgré une brève interruption due à la pandémie de COVID-19, nous sommes ravis de voir une étape aussi monumentale à peine quatre ans après le début du projet. »
Sommaire
L’essor du séquençage métagénomique microbien
Depuis la publication de la première description du microbiome humain en 2010, le domaine du microbiome humain est passé rapidement de l’échantillonnage de centaines d’individus à des milliers. Les progrès du séquençage du génome ont permis aux chercheurs de mieux caractériser la composition du microbiome grâce à l’identification de microbes incultivables. Cela leur a également permis d’étudier comment le microbiome influence le développement de certains cancers et les réponses aux médicaments.
La métagénomique, associée aux technologies de séquençage à haut débit, a révolutionné l’écologie microbienne. Aujourd’hui, le séquençage métagénomique est devenu un outil à la fois puissant et populaire pour identifier et classer les communautés microbiennes complexes. Il facilite la découverte accélérée de nouveaux marqueurs qui se traduisent par la virulence ou la résistance aux antibiotiques, ainsi que la découverte et la caractérisation de novo de nouvelles espèces et l’assemblage de nouveaux génomes. Outre le microbiome humain, il est hautement applicable dans les études sur le microbiome agricole, les études sur le microbiome environnemental, la surveillance et l’identification des agents pathogènes et la surveillance des gènes de résistance aux antimicrobiens.
En effet, le marché mondial du séquençage métagénomique était estimé à 1,86 milliard USD de revenus en 2022 et devrait atteindre 4,33 milliards USD d’ici 2027, avec une croissance à un TCAC de 18,4 % au cours de la période de prévision. En particulier, l’Europe et l’Afrique représentent environ 29,7 % de part de marché dans le monde, se classant au deuxième rang après l’Amérique du Nord à 45,6 %. Grâce aux innovations technologiques continues dans les plates-formes de séquençage à haut débit, le marché du séquençage métagénomique en Europe et en Afrique devrait passer de 551,7 millions USD en 2022 à 1,29 milliard d’ici 2027, offrant d’énormes opportunités de marché et donnant aux institutions locales l’impulsion nécessaire pour investir et être impliqué.
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Un flux de travail optimisé avec la technologie de pointe de MGI
Équipé des systèmes de laboratoire innovants de MGI, le consortium MMHP garantit des processus à haut débit, une précision extrême et une sortie de données de haute qualité. Le flux de travail dédié à guichet unique commence par le transfert d’échantillons sur le système de traitement de transfert d’échantillons automatisé à haut débit MGISTP-7000*. Il passe ensuite par l’extraction des acides nucléiques et la préparation de la bibliothèque sur le système de préparation d’échantillons automatisé à haut débit MGISP-960, un poste de travail flexible et entièrement automatisé capable de traiter 96 échantillons par cycle. La conception de fonctionnement entièrement automatique du MGISP-960 permet l’extraction d’ADN de 50 000 échantillons par an et la préparation d’une bibliothèque de 25 000 échantillons par an. MGISP-Smart 8, le robot de pipetage automatisé professionnel, équipé d’un canal de pipetage 8 indépendant peut être utilisé pour la mise en commun, la normalisation et la fabrication de DNB. Enfin, le séquenceur ultra-haut débit DNBSEQ-T7* et le séquenceur de paillasse polyvalent DNBSEQ-G400* permettent une expérience de séquençage efficace, productive et rationalisée.
« Nous sommes très concentrés sur la qualité des données, le coût et le temps. Après avoir comparé la technologie DNBSEQ™ de MGI avec d’autres technologies de séquençage, nous sommes convaincus que les produits de MGI répondent aux normes élevées de l’industrie et offrent une très bonne expérience utilisateur », a commenté le professeur Lars Engstrand, Directeur de recherche du Centre de recherche translationnelle microbienne (CMTR) du Karolinska Institutet. « Les plateformes de MGI ont permis à notre équipe de mettre à niveau notre recherche microbiologique originale, du séquençage de l’amplicon du gène 16SrRNA au séquençage métagénomique shotgun. J’ai hâte d’introduire plus d’équipements et de très grands projets alors que le microbiome humain émerge comme une méthode cruciale de diagnostic et de traitement en médecine de précision.
Le prochain chapitre de la microbiomique
« La microbiomique fera partie de la médecine de précision à l’avenir, et les données de la biobanque de microbiomes qui résulteront du MMHP seront exploitées pour la R&D thérapeutique », a déclaré le professeur Stanislav Dusko Ehrlich de l’University College de Londres, au Royaume-Uni. «Avec 21 institutions publiques et privées et plus de 10 pays actuellement impliqués dans le MMHP, nous recherchons activement davantage de groupes de recherche pour participer à ce partenariat international de recherche microbiologique historique et aider à générer la plus grande base de données sur le microbiome humain en libre accès au monde.»
Depuis la création de MMHP, MGI a joué un rôle important en fournissant au programme des plateformes et des technologies de recherche de pointe. Entrant maintenant dans sa deuxième phase de séquençage et d’analyse d’un total final d’un million d’échantillons, le projet accueille de nouveaux échanges et la participation d’organisations compétentes pour promouvoir conjointement la recherche et les applications de la médecine translationnelle de pointe dans le domaine du microbiome. Les personnes intéressées peuvent remplir le formulaire de candidature sur www.mgi-tech.eu/mmhp.
À propos de MGI
MGI Tech Co. Ltd. (MGI), dont le siège est à Shenzhen, s’engage à créer des outils et des technologies de base pour diriger les sciences de la vie grâce à l’innovation intelligente. Sur la base de sa technologie exclusive, MGI se concentre sur la recherche et le développement, la production et la vente d’instruments de séquençage, de réactifs et de produits connexes pour soutenir la recherche en sciences de la vie, l’agriculture, la médecine de précision et les soins de santé. MGI est l’un des principaux producteurs de séquenceurs de gènes cliniques à haut débit*, et ses plateformes multi-omiques incluent le séquençage génétique*, l’imagerie médicale et l’automatisation des laboratoires. La mission de MGI est de développer et de promouvoir des outils avancés des sciences de la vie pour les soins de santé futurs. Pour plus d’informations, visitez le site Web de MGI ou contactez-nous sur TwitterLinkedIn ou YouTube.
*Sauf avis contraire, les réactifs de séquençage StandardMPS et CoolMPS et les séquenceurs à utiliser avec ces réactifs ne sont pas disponibles en Allemagne, en Espagne, au Royaume-Uni, en Suède, en Italie, en République tchèque, en Suisse et à Hong Kong (CoolMPS est disponible à Hong Kong).
*À des fins de recherche uniquement. Ne pas utiliser dans les procédures de diagnostic (sauf indication contraire).
