Sommaire
Contexte et objectifs
Sous-unité catalytique A de l'ADN polymérase epsilon (PÔLE) le gène joue un rôle crucial dans la réparation de l’ADN et la réplication chromosomique. Des mutations dans le PÔLE gène ont été associés au cancer, en particulier au carcinome colorectal (CRC). Cependant, le paysage génomique et la signification pathologique du CCR mutant POLE restent sous-estimés. Cette étude visait à caractériser les caractéristiques clinicopathologiques et le paysage génomique du CCR hébergeant PÔLE mutations et d’étudier les implications des altérations génétiques concomitantes.
Méthodes
Nous avons identifié trente-quatre cas de CCR avec PÔLE mutations de la base de données de notre institution en utilisant les panels de gènes de séquençage de nouvelle génération, y compris le panel de 161 gènes pour les cas de 2016-2021 et le panel de 505 gènes pour le cas de 2022-2023. Nous avons collecté des données clinicopathologiques (âge, sexe, site de la tumeur et classement) et effectué un séquençage complet de nouvelle génération. Les résultats de survie ont été évalués en examinant les dossiers médicaux des patients au moment de la collecte des données, le statut de survie étant déterminé sur la base du suivi clinique le plus récent disponible, avec la survie globale comme critère d'évaluation principal et une durée médiane de suivi de 20,5 mois. Les analyses statistiques, y compris les tests du chi carré et le tracé CoMutation, ont été réalisées à l'aide de Python.
Résultats
Les 34 patients inscrits avaient un âge médian de 60,5 ans (extrêmes : 37 à 84 ans) ; les tumeurs se trouvaient dans le côlon (26 cas, 77 %) et le rectum (8 cas, 23 %), avec un taux de déficit de réparation des mésappariements de 29 %. L'analyse de séquençage de nouvelle génération d'un panel de 505 gènes a révélé que PÔLE les mutations étaient majoritairement faux-sens (89 %). Les mutations étaient réparties dans divers domaines : 11,4 % dans le domaine exonucléase, 25,7 % dans le domaine catalytique, 20 % dans un domaine fonctionnel inconnu et 42,9 % dans un domaine non fonctionnel. Le nombre moyen de mutations génomiques par cas était de 12,1 ± 12,3. L'analyse de coMutation a identifié deux sous-ensembles : mutation génomique élevée (> 5 mutations, plage de 6 à 60 mutations, n = 22) et mutation faible (. Notamment, des mutations TP53 se sont produites dans 55 % des cas et des défauts dans les protéines de réparation de l'ADN double brin se sont produits dans 47 % des cas. PÔLE Le CRC mutant avec des mutations concomitantes de réparation de l'ADN présentait un nombre total de mutations génomiques significativement plus élevé (19,9 ± 14,4, plage de 7 à 60 mutations ; chi carré = 5,1, p-valeur = 0,02). Bien qu'une comparaison de survie entre les sous-groupes TP53 de type sauvage et mutants TP53 de PÔLE-le CRC mutant n'est pas statistiquement significatif (p = 0,37), il a montré une tendance vers une meilleure survie dans le groupe de type sauvage TP53.
Conclusions
PÔLE L'adénocarcinome mutant représente une entité moléculaire et clinicopathologique distincte avec deux sous-groupes. Un sous-groupe est caractérisé par des mutations traditionnelles du carcinome colorectal et des mutations secondaires. PÔLE mutations dont les résultats reflètent un carcinome colorectal plus traditionnel, et l'autre est motivé par PÔLE mutations avec un phénotype ultramutant correspondant et de meilleurs résultats. D'autres études de ces deux sous-groupes pourraient permettre d'améliorer le pronostic des patients atteints de PÔLE carcinome colorectal mutant et peut soutenir l'utilisation de l'immunothérapie pour les personnes atteintes du conducteur PÔLE mutations. De plus, ces données suggèrent que la classification des PÔLE Le carcinome colorectal mutant est incomplet et nécessite des investigations plus approfondies pour bien comprendre l'impact de PÔLE mutations.
