Sommaire
Contexte et objectifs
Chlorelle vulgaris est une microalgue verte photosynthétique du phylum Chlorophyta. Le but de notre étude était d'effectuer une analyse bioinformatique de la chlorophylle et de l'apoprotéine A2 du photosystème I P700, l'une de ses protéines liées à la photosynthèse, et de rechercher de puissants peptides bioactifs.
Méthodes
Pour générer des peptides et estimer la sécurité et l'efficacité de chaque peptide bioactif, nous avons utilisé les outils BIOPEP-UWM™, PeptideRanker, DBAASP et ToxinPred. PepDraw a été utilisé pour comprendre les propriétés physicochimiques et les structures chimiques primaires des peptides bioactifs sélectionnés.
Résultats
Les peptides libérés présentent jusqu'à 17 bioactivités distinctes, comme le montre la in silico digestion de la protéine à l'aide de plusieurs enzymes protéolytiques. Les peptides ayant des bioactivités sont répertoriés comme inhibiteur de l'enzyme de conversion de l'angiotensine, inhibiteur de la dipeptidyl peptidase IV, inhibiteur de la dipeptidyl peptidase III, antioxydant, inhibiteur de la rénine, stimulateur de l'absorption du glucose, régulateur des neuropeptides (régulant l'activité de la muqueuse gastrique et le flux ionique), antithrombotique, anti-amnésique. , inhibiteur de CaMPDE, activateurs de la protéolyse médiée par l'ubiquitine, inhibiteur de l'alpha-glucosidase, agent immunomodulateur, liant le calcium, antibactérien, anti-inflammatoire et hypotenseur. À l’aide de la méthode de prédiction DBAASP (Base de données sur l’activité antimicrobienne et la structure des peptides), l’activité antibactérienne des peptides libérés a été prédite, mettant en évidence l’existence de peptides antibactériens puissants. Un examen de leurs propriétés physicochimiques a révélé que la plupart des peptides sont de faible poids moléculaire, légèrement acides et modérément solubles dans l’eau. Pour établir davantage le profil de non-toxicité des peptides libérés (longueur de séquence > 3), une analyse ToxinPred a été réalisée, qui a révélé que la plupart des peptides sont non toxiques. Selon l’analyse d’allergénicité, la plupart des peptides les mieux classés sont probablement non allergènes.
Conclusions
Ainsi, notre étude révèle une méthode moins exigeante en main-d'œuvre pour découvrir de nouvelles cibles thérapeutiques dérivées de C. vulgarisqui revêtent une importance à la fois pharmacologique et médicale.
