Dans le dernier épisode du podcast OMG Omx, Kate Stumpo de Bruker parle à Nikolai Slavov de l’incroyable potentiel de la protéomique par spectrométrie de masse dans la recherche biomédicale. Regardez le podcast complet ou lisez les faits saillants sélectionnés ci-dessous.
Nikolaï Slavov | mon Dieu Podcast OMx | Ép. 7
Sommaire
Pouvez-vous donner un aperçu de vos initiatives récentes, en particulier de votre entreprise dérivée et de votre institut de recherche, et de leur lien avec vos travaux universitaires ?
Nous avons créé le Parallel Squared Technology Institute, un organisme de recherche à but non lucratif, pour libérer le potentiel de la protéomique par spectrométrie de masse dans la recherche biomédicale.
Il est né de discussions avec Schmidt Futures, qui a remarqué notre travail d’analyse des protéines unicellulaires et a proposé des ressources supplémentaires. Historiquement, les ressources n’ont pas été notre force, mais j’ai reconnu leur importance.
Notre proposition se concentre sur l’avancement de la technologie pour un débit, une évolutivité et un prix plus élevés tout en maintenant la qualité. Nous appliquons également cette technologie pour étudier la maladie d’Alzheimer, une pathologie centrée sur les protéines, ainsi que les modifications des cellules immunitaires liées au vieillissement et aux conditions physiopathologiques. Nos recherches pourraient s’étendre au cancer à mesure que nous progressons.
Quelles difficultés rencontrez-vous pour obtenir des données et des informations utilisables ? Pourriez-vous préciser le niveau d’analyse requis ?
Une interprétation efficace des données commence par une conception expérimentale méticuleuse. Cela inclut la définition d’expériences pour maximiser l’interprétation des données et l’obtention de mesures moléculaires et de métadonnées pertinentes tout en minimisant les artefacts techniques.
Les stratégies d’interprétation peuvent varier. Ils peuvent impliquer de se concentrer sur des hypothèses initiales ou d’explorer ouvertement des données, en particulier des données omiques, pour découvrir de nouvelles tendances et perspectives. Des expériences de suivi sont conçues pour tester ces hypothèses.
Le travail d’équipe et la diversité des perspectives sont également essentiels à l’interprétation créative des données, et constituer la bonne équipe est un défi mais crucial. Il est essentiel de motiver ses collègues à faire preuve d’audace dans l’exploration et de les encourager à aller au-delà des questions prescrites. Trouver un équilibre entre audace et rigueur scientifique est essentiel pour faire des découvertes significatives.
Si nous n’essayons pas vraiment de repousser les limites, nous n’atteindrons pas la grandeur.
Crédit d’image : Spectrométrie de masse Bruker Life Sciences
Pourriez-vous s’il vous plaît partager un moment charnière de votre parcours scientifique, un « moment OMG », si vous voulez, qui a profondément influencé votre carrière ?
Il y a eu de nombreux moments tout au long de ma carrière qui ont laissé un impact durable. Il est difficile d’en identifier un seul, mais je vais partager un exemple qui me vient à l’esprit. Je me souviens très bien de la première fois où j’ai compris comment le calcul pouvait être appliqué pour dériver certaines des équations thermodynamiques fondamentales que j’avais auparavant vénérées en tant qu’étudiant.
Ces équations me paraissaient presque mystiques et je tenais en haute estime ceux qui les avaient formulées. Comprendre la dérivation de ces équations grâce au calcul de base et à des principes intuitifs a été une expérience transformatrice.
Cela m’a donné du pouvoir et m’a donné un sentiment d’émerveillement quant à la façon dont la simplicité pouvait expliquer les complexités du monde physique. Ce moment reste gravé dans ma mémoire comme source d’inspiration et de motivation dans mes démarches scientifiques.
Vous avez souligné le rôle essentiel du travail d’équipe dans votre cheminement vers votre poste actuel. Pourriez-vous s’il vous plaît partager les noms des personnes que vous aimeriez remercier ou à qui vous aimeriez exprimer votre gratitude pour leurs contributions substantielles à votre carrière ?
De nombreuses personnes ont considérablement façonné ma carrière ; même si je ne peux pas nommer tout le monde, je souhaite en souligner quelques-uns.
Mon professeur de chimie au lycée a été l’une des premières personnes à encourager ma passion pour les sciences. Elle m’a laissé une impression durable et a soutenu ma participation à des concours scientifiques.
Pendant mon doctorat. en Irlande, j’ai également vécu une expérience transformatrice en travaillant avec le professeur Kenneth Dawson de l’University College Dublin. Il s’est engagé avec moi dans de longues discussions en tête-à-tête sur des sujets scientifiques et philosophiques, un style de mentorat que je n’avais jamais rencontré auparavant. Le professeur Dawson m’a également appris l’art de réviser des articles scientifiques et la capacité de faire la distinction entre la connaissance et l’ignorance.
Mon doctorat. mon mentor, David Botstein, a également laissé une marque indélébile sur mon parcours scientifique. Connu pour son approche volontaire et critique, il m’a mis au défi de penser de manière critique et m’a fourni des commentaires directs et constructifs. Son style de mentorat a grandement influencé mon développement scientifique.
Enfin, je dois une grande partie du succès de ma carrière indépendante à mon premier doctorat. étudiants de la Northeastern University, notamment Harrison Specht et Andrew Leduc, entre autres. Les contributions de ces personnes ont été déterminantes dans mes efforts de recherche.
Bien que ce ne soient là que quelques noms que je voudrais mentionner, il y en a bien d’autres qui méritent d’être reconnus pour leur soutien et leurs conseils tout au long de ma carrière. Ma gratitude s’étend à une communauté plus large de mentors et de collaborateurs.
À propos du conférencier
Nikolai Slavov a reçu une formation de premier cycle du MIT et un doctorat de l’Université de Princeton pour caractériser la coordination de la croissance cellulaire avec l’expression des gènes et le métabolisme.
Le laboratoire Slavov a été pionnier dans les méthodes expérimentales et informatiques de protéomique unicellulaire et les a utilisées pour relier la covariation des protéines à travers des cellules uniques à des phénotypes fonctionnels, notamment la polarisation des macrophages, l’émergence d’une résistance aux médicaments, le développement précoce des mammifères et la différenciation des cellules souches. Ces technologies ont servi de base à la création du Parallel Squared Technology Institute (PTI).
Le professeur Slavov organise la conférence annuelle sur la protéomique unicellulaire et contribue à l’organisation d’autres conférences de premier plan, dont NeurIPS.
omg OMx hôte : Kate Stumpo, directrice principale du marché chez Bruker
À propos de la spectrométrie de masse Bruker Life Sciences
Découvrez de nouvelles façons d’appliquer la spectrométrie de masse aux défis analytiques les plus urgents d’aujourd’hui. Des innovations telles que la mobilité ionique piégée (TIMS), les lasers à faisceau intelligent et à balayage pour l’imagerie MALDI-MS qui offrent une véritable fidélité des pixels, et la technologie FTMS (XR) à résolution extrême capable de révéler les signatures de structure fine isotopique (IFS) poussent l’exploration scientifique vers de nouveaux sommets. . Les solutions de spectrométrie de masse de Bruker permettent aux scientifiques de faire des découvertes révolutionnaires et d’acquérir des connaissances plus approfondies.
