Un article récent publié dans Maladie infectieuse de greffe ont examiné des rapports de cas sur l’évolution du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) dans des cohortes immunodéprimées.
Sommaire
Arrière plan
Avec une partie importante de la population déjà infectée par la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), la pandémie de SRAS-CoV-2 continue de faire des ravages dans le monde, malgré la disponibilité croissante du vaccin COVID-19. La poursuite de la pandémie de COVID-19 est principalement attribuable aux poussées récurrentes de nouvelles variantes du SRAS-CoV-2 telles que Beta, Alpha, Delta, Gamma et Omicron, qui ont amélioré l’évasion immunitaire et augmenté la transmissibilité. Sans intermédiaires évolutifs ni accumulation connue de mutations par étapes, ces nouvelles variantes émergent brusquement avec une vaste collection de mutations.
Étant donné que la machinerie de réplication du CoV comprend un mécanisme de relecture qui produit moins d’erreurs que celles des autres virus à acide ribonucléique (ARN), cela complique davantage ce paradoxe. Tous ces résultats indiquent une source d’évolution cryptique du SRAS-CoV-2 au niveau communautaire qui n’est actuellement pas détectée par les techniques de surveillance virale.
À propos de l’étude
Dans le présent travail, les chercheurs ont analysé des articles sur les tendances rares de l’infection par le SRAS-CoV-2 et l’évolution chez les patients immunodéprimés à partir de 2020.
Résultats
Les auteurs ont noté qu’un article existant a montré qu’un patient gravement immunodéprimé atteint d’une maladie auto-immune a connu cinq mois d’infection persistante par le SRAS-CoV-2 et une période prolongée d’évolution virale, en particulier à l’intérieur du domaine de liaison aux récepteurs (RBD) du pic ( Gène S). La découverte que plusieurs mutations du SRAS-CoV-2 chez cette personne étaient des mutations caractéristiques de variantes ultérieures d’intérêt ou de préoccupation (VOI/VOC) soulève l’idée que de nouvelles variantes virales peuvent avoir d’abord émergé chez une personne immunodéprimée avant de se propager au grand public.
Dans la recherche de Simons et ses collègues publiée dans la revue Transplant Infectious Diseases, les scientifiques ajoutent à la compréhension de l’évolution du SRAS-CoV-2 en décrivant deux cas de personnes immunodéprimées qui avaient une infection chronique par le SRAS-CoV-2 et des populations virales qui avait muté en corrélation avec les COV en circulation. Au cours de l’évolution de l’infection, les deux sujets ont eu des augmentations progressives de la variété de la population virale intra-hôte.
Fait intéressant, le patient B hébergeait une mutation S E484K également observée dans les COV bêta et gamma du SRAS-CoV-2 et surveillait auparavant les variantes Eta, Zeta, Iota et Theta plus de 106 jours après l’infection. De plus, le patient A avait une mutation S E484Q également trouvée dans la variante SARS-CoV-2 Kappa précédemment surveillée et la suppression de 241-243 résidus dans Beta VOC. Ces mutations étaient autrefois associées à une neutralisation virale réduite par le sérum de patient COVID-19 récupéré et l’évasion immunitaire humorale.
Les deux patients manquaient de niveaux d’anticorps mesurables traitant le RBD du S au point de prélèvement. Pendant ce temps, des titres d’anticorps modestes contre le domaine N-terminal de S ont été trouvés chez le patient A. Ces résultats étaient conformes aux découvertes précédemment rapportées selon lesquelles les déficits immunitaires humoraux étaient un motif commun dans ces cas et que la persistance du COVID-19 était associée à des signes de évolution virale rapide, en particulier dans le gène S.
Ces résultats montrent le potentiel d’évolution des COV chez les patients immunodéprimés atteints d’une infection chronique par le SRAS-CoV-2. Par conséquent, approuver une surveillance virale améliorée chez les patients immunodéprimés au cours de longues évolutions de la maladie. En outre, cela souligne l’importance des efforts continus pour découvrir de puissants médicaments antiviraux pour empêcher la réplication virale.
Le rapport de Simons et ses collègues a également montré que les deux patients ont été traités avec du bamlanivimab, l’anticorps monoclonal (mAb), à un stade précoce des infections. Les deux patients possédaient des mutations dans le RBD au niveau de la région des acides aminés E484, connue pour conférer une résistance au bamlanivimab.
De plus, le bamlanivimab n’était pas le seul mAb associé au développement d’une résistance. Un rapport récent a noté l’émergence d’une résistance au sotrovimab chez de nombreux patients immunodéprimés traités avec ce seul mAb. En outre, 5 % des volontaires traités par mAb dans l’étude BLAZE-4 présentaient une résistance au bebtélovimab liée au traitement.
Les présents auteurs ont mentionné que bien que la thérapie par anticorps monoclonaux combinés conduise généralement à des fréquences plus faibles d’émergence de résistance, les individus immunodéprimés continuent probablement à être à risque d’émergence de résistance même avec une double thérapie mAb. Par conséquent, les résultats soulignent la nécessité d’une surveillance étroite pour les indications de résistance aux médicaments et de persistance virale et la possibilité de l’émergence rapide d’une résistance pendant le traitement par mAb.
conclusion
Dans l’ensemble, l’équipe a mentionné que les rapports de cas analysés aident à comprendre l’évolution du SRAS-CoV-2 chez les patients immunodéprimés. Ces articles soulignent également la nécessité d’analyses approfondies de la persistance du SRAS-CoV-2 et des approches de traitement les plus efficaces dans cette population de patients sous-étudiée pour résoudre les problèmes urgents.
Néanmoins, combler ces lacunes en matière d’information nécessitera probablement une approche concertée au sein d’un groupe de scientifiques et de bailleurs de fonds dévoués en raison du large éventail de maladies immunosuppressives et des difficultés à identifier un volume adéquat de patients dans un seul centre clinique. Les solutions à ces questions faciliteront l’amélioration des soins pour les patients COVID-19 immunodéprimés. De plus, ils feront la lumière sur les déterminants immunitaires de la clairance virale et indiqueront peut-être des moyens d’arrêter la formation de nouvelles variantes du SRAS-CoV-2 qui continueront de propager la pandémie.
