Les sarbecovirus, tels que le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2), sont un sous-genre de Coronaviridés qui infectent principalement les chauves-souris. La recherche a montré que ces virus ont également le potentiel d’infecter les humains. Les Sarbecovirus sont les plus susceptibles d’émerger dans les populations d’Asie du Sud-Est, qui n’ont pas été suffisamment étudiées à ce jour. Une nouvelle étude publiée dans le Journal international des maladies infectieuses ont interrogé des communautés rurales du Myanmar pour étudier leur exposition aux sarbecovirus et leur interaction avec la faune.
Étude : L’exposition à divers sarbecovirus indique un débordement zoonotique fréquent dans les communautés humaines en interaction avec la faune. Crédit d’image : jekjob/Shutterstock
Sommaire
Arrière-plan
La pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) a mis en évidence le besoin urgent de surveiller les retombées zoonotiques. En Asie, en Europe et en Afrique, Rhinolophus spp.. les chauves-souris sont considérées comme des réservoirs naturels de sarbecovirus. L’Asie du Sud et du Sud-Est est très importante pour la surveillance de la faune en raison du nombre concentré de coronavirus liés au SRAS (SARSr-CoV).
Les recherches sur les corrélations entre les infections à sarbecovirus chez l’homme et les activités qui les mettent en contact étroit avec les chauves-souris sont rares. Des études devraient caractériser les sarbecovirus actuellement non reconnus qui circulent et évaluer leur potentiel de propagation aux personnes.
Au Myanmar, en réponse à la pandémie, de nombreux programmes de surveillance humaine ont été utilisés pour analyser l’exposition aux sarbecovirus. L’objectif était de comprendre l’hétérogénéité entre les régions géographiques, les types de comportements humains et les espèces potentielles impliquées dans la propagation des sarbecovirus.
À propos de l’étude
Les communautés engagées dans la récolte du guano de chauve-souris et les industries extractives et des zones rurales du Myanmar ont été interrogées pour cette étude. Trois études de surveillance ont été menées entre juillet 2017 et février 2020. Pour les participants, leur interaction avec la faune et leur exposition aux sarbecovirus ont été évaluées afin de réduire les facteurs associés à l’exposition au virus.
Pour évaluer les associations entre le risque de contact avec les animaux et les facteurs démographiques humains, toutes les covariables ont d’abord été évaluées pour exclure toute confusion potentielle. Pour déterminer les associations entre les comportements de contact humain-animal à haut risque et la séropositivité pour les sarbecovirus, Pearsons 2 des tests ont été utilisés.
Principales conclusions
Les résultats de l’étude ont montré l’exposition des participants à divers sarbecovirus, qui n’ont pas encore infecté les humains. Les industries extractives et le contact avec les chauves-souris étaient les schémas d’exposition positivement corrélés à la séropositivité. Cela a mis en évidence l’importance de la transmission zoonotique par rapport à la transmission interhumaine.
L’absence de transmission interhumaine et la nature éloignée des virus (par exemple, B21065, LYRa11 et WIV-1) pourraient expliquer pourquoi nombre d’entre eux ne sont pas encore reconnus par la communauté mondiale. Les résultats font écho à l’importance d’une surveillance soutenue à l’interface entre la faune sauvage et l’homme en milieu rural en Asie du Sud-Est. Cette région géographique présente une grande diversité de mammifères et l’émergence future de maladies zoonotiques est tout à fait probable.
Le taux de séropositivité a été observé comme élevé chez les personnes engagées dans les industries extractives, en particulier l’exploitation forestière. Les humains sont rapprochés de la faune dans cette profession grâce à la chasse à la viande de brousse et à la proximité de la forêt, et par conséquent, le risque de transmission zoonotique augmente. Cela souligne l’importance de la vigilance et de l’accès aux diagnostics de maladies infectieuses dans ces communautés. Des résultats similaires ont été documentés dans d’autres études menées au Myanmar et dans le monde.
Un facteur de risque important d’exposition aux sarbecovirus était le contact direct avec les chauves-souris lors de l’abattage ou de la chasse. Des études similaires menées en Chine ont documenté une éventuelle infection humaine par les virus SARSr-CoV des chauves-souris chez les humains vivant à proximité de grottes connues pour avoir une grande diversité de SARSr-CoV des chauves-souris. De plus, les espèces de mammifères qui subissent une perte de qualité de l’habitat ont été responsables de plus de retombées zoonotiques. Ainsi, il est impératif de comprendre la perte d’habitat et les occupations rapprochant les chauves-souris des humains, ce qui devrait être essentiel pour éclairer les mesures d’atténuation de la santé publique.
Un anticorps sVNT réactif au SARS-CoV-2 a été détecté qui n’a pas neutralisé le SARS-CoV2 dans les tests PRNT. Cela indiquait que les participants pouvaient être exposés à d’autres virus du genre Sarbecovirus. Les anticorps contre RaTG13, le plus proche parent connu du SRAS-CoV-2, étaient les anticorps les plus identifiés dans cette étude. La réactivité croisée avec des sarbecovirus étroitement apparentés encore à découvrir ou connus pourrait expliquer les résultats.
L’analyse moléculaire et structurelle du domaine de liaison au récepteur (RBD) de RaTG13 a montré une affinité de liaison avec l’ACE2 humain, en plus des orthologues de l’ACE2 chez 24 autres espèces. Cela a fourni la preuve que RaTG13 avait le potentiel d’infecter les humains. Les données laissaient entendre que RaTG13 se répandait le plus souvent sur les habitants des régions étudiées. Ce résultat n’est pas inattendu, étant donné que RaTG13 a été découvert pour la première fois dans une grotte du Yunnan, en Chine, qui se trouve le long de la frontière chinoise avec le Myanmar.
Conclusion
Le fait que des retombées zoonotiques se produisent est prouvé par l’exposition documentée à divers sarbecovirus parmi les communautés humaines à haut risque. Ces résultats peuvent guider de manière appropriée les efforts d’atténuation des risques essentiels pour freiner la transmission de la maladie à l’interface homme-chauve-souris. De plus, ils peuvent également éclairer les futurs efforts de surveillance pour surveiller les virus susceptibles de provoquer une pandémie.
