Depuis le premier cas signalé de nouvelle maladie à coronavirus en décembre 2019, la maladie, désormais appelée maladie COVID-19, s'est propagée dans le monde entier et en mars 2020, elle a été déclarée pandémie. Alors que la Chine, d'où elle est originaire, a apparemment éteint l'incendie avec des restrictions draconiennes à la mobilité publique, d'autres pays ont connu des épidémies plus longues avec beaucoup plus de morts.
Actuellement, des centaines de milliers de cas sont signalés dans les Amériques, en Inde et en Russie, portant le nombre total de cas au-delà de 13,8 millions, avec un nombre de morts proche de 600 000. Maintenant, une étude publiée sur le serveur de préimpression medRxiv * en juillet 2020, des rapports sur la faible séroprévalence des anticorps dirigés contre le virus, désormais désigné coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2), chez les donneurs de sang de Wuhan, la ville chinoise où tout a commencé, et deux autres villes de même taille en Chine. Les auteurs soulignent qu'une gestion précoce efficace de l'infection semble avoir permis un contrôle efficace de la propagation virale.
Les tests pour le nouveau virus dépendent principalement des tests d'acides nucléiques utilisant des écouvillons des voies respiratoires supérieures, dans la plupart des cas. Un diagnostic précoce pourrait vraisemblablement empêcher le virus de se propager, mais la grande majorité des cas sont bénins ou asymptomatiques. Ceux-ci ne sont diagnostiqués que par un dépistage systématique à grande échelle des contacts ou simplement par des tests aléatoires dans une population spécifique.
Cependant, l'identification de l'infection asymptomatique est vitale pour réduire la charge de propagation virale et pour comprendre le nombre exact de cas, ce qui est essentiel pour calculer le véritable taux de létalité de l'infection. Cela ne semble possible que grâce à un dépistage sérologique généralisé utilisant des anticorps spécifiques.
Séroprévalence hebdomadaire de l'anticorps SARS-CoV-2 pendant différentes périodes de janvier à avril 2020 dans les villes de Wuhan, Shenzhen et Shijiazhuang. Le nombre de donneurs testés pour l'anticorps total (TAb) chaque semaine (les nombres noirs en haut de chaque histogramme) est indiqué sur les histogrammes. Le nombre de cas positifs confirmés est indiqué en chiffres rouges en haut de chaque histogramme. Le taux séropositif confirmé (nombre de donneurs confirmés par ppNAT / nombre de donneurs testés pour le TAb) au cours de chaque semaine est indiqué en lignes rouges. Le premier donneur confirmé positif par les tests de neutralisation basés sur le pseudotype des lentivirus à Wuhan a eu lieu le 20 janvier, la quatrième semaine de 2020. Le verrouillage de la ville de Wuhan a commencé le 23 janvier et le 8 avril, toutes les restrictions de voyage à Wuhan ont été levées. La période d'étude à Wuhan est divisée en trois étapes: pré-verrouillage (15 janvier-22 janvier), verrouillage (23 janvier-7 avril) et levée des restrictions (8 avril-30 avril). Les séroprévalences confirmées des trois stades variaient: deux des 2607 donneurs ont été confirmés au premier stade (0,08%, IC à 95%: 0,02% – 0,28%); 256 dons avec des preuves sérologiques confirmées de 185 donneurs ont été identifiés à partir de 7903 échantillons de 6004 donneurs, suggérant une séroprévalence de 3,08% (IC 95%: 2,67% -3,55%) au stade du verrouillage; Après le 8 avril, nous avons en outre testé un total de 10973 échantillons de 10708 donneurs et découvert que 257 échantillons de 249 donneurs étaient confirmés séropositifs pour le SRAS-CoV-2 (2,33%, IC à 95%: 2,06% -2,63%). Le pic de séroprévalence (4,63%, 12/259) s'est produit au stade du verrouillage.
Sommaire
Le modèle de production d'anticorps SARS-CoV-2
Le test sérologique le plus précoce et le plus sensible pour COVID-19 semble être l'anticorps total (Tab), qui revient positif à partir de la deuxième semaine après le début des symptômes. À deux semaines complètes, tous les cas confirmés ont un Tab positif. Au cours de la deuxième ou de la troisième semaine, des anticorps IgM et IgG apparaissent, le premier transitoire et le second se prolongeant.
Des études antérieures sur des groupes spécifiques d'individus asymptomatiques ont donné une séroprévalence de 1,6% à 4,1%. La présente étude examine les tests d'anticorps dans des groupes asymptomatiques en Chine.
L'étude: séroprévalence chez les donneurs de sang chinois
Les enquêteurs ont examiné les donneurs de trois villes, Wuhan, Shenzhen et Shijiazhuang, dans le centre, le sud et le nord de la Chine, avec des populations similaires mais des charges COVID-19 différentes. Tous les donneurs qui ont donné du sang au cours de la période d'étude de janvier à avril 2020 ont été inclus, à plus de 38 000.
Parmi ceux-ci, l'âge médian des quelque 18 000 donneurs de Wuhan était de 33 ans; des près de 7 000 habitants de Shenzhen était de 36 ans; et pour les 13.500 de Shijiazhuang, c'était 40 ans. La plupart étaient des hommes, à environ 70%.
Test d'anticorps
Les chercheurs ont testé plus de 43 000 échantillons du sang donné (certains donnés deux fois) pour «Tab», et ont trouvé environ 700 positifs. De ce nombre, environ 590 venaient de Wuhan, environ 30 et 60 de Shenzhen et Shijiazhuang, respectivement. Cela représente environ 2,7% pour Wuhan et 0,4% pour les deux autres villes.
Les échantillons positifs pour Tab ont été testés pour détecter les IgG-RBD spécifiques du SARS-CoV-2, IgG-N, IgM, et enfin, un test neutralisant contre un virus pseudotypé (ppNAT). La séroprévalence était respectivement de 2,3%, 0,03% et inférieure à 0,01% à Wuhan, Shenzhen et Shijiazhuang. Cette prévalence d'infection asymptomatique chez les donneurs de sang est inférieure à celle observée chez les donneurs de sang dans les pays européens, qui variait de 3% à plus de 5%.
La positivité des IgG-RBD est observée dans 96% des 519 échantillons de dons séropositifs confirmés; 78% étaient positifs pour l'IgG-N et 66% pour l'IgM.
Parmi les quelque 2600 échantillons collectés avant le verrouillage de Wuhan le 23 janvier 2020, il y avait environ 1600 et 1000 échantillons respectivement du 15 au 18 janvier et du 19 au 22 janvier. Seuls deux étaient séropositifs à ce moment, pour une séropositivité pour les donneurs de sang inférieure à 0,1%.
Une fois la mise en quarantaine de Wuhan commencée, la séroprévalence est passée à 3%, tandis qu'elle est tombée à 2,3% après le relâchement du verrouillage du 8 avril 2020. La séroprévalence la plus élevée a eu lieu à la sixième semaine de 2020, du 2 au 9 février 2020, chez les donneurs de sang de Wuhan, et a ensuite constamment diminué.
Cependant, la séropositivité était constamment faible dans les échantillons de dons de sang des deux autres villes, même pendant la période de quarantaine.
Marqueurs d'anticorps et marqueurs de dosage de neutralisation
Les chercheurs ont constaté que le titre ppNAT moyen augmentait à mesure que l'onglet augmentait. Le pourcentage d'échantillons avec un ppNAT ID50 supérieur à 20, qui est le niveau de confirmation, était de 38% à un titre Tab de 1-5. Il a augmenté progressivement à mesure que le titre d'onglet passait de 81% avec un titre d'onglet de 5-10 à 99% à un onglet supérieur à 15.
Le titre ppNAT a également augmenté à mesure que les IgG-RBD, IgG-N et IgM augmentaient. La corrélation la plus étroite était avec IgG-RBD. L'antigène N semble provoquer la réponse anticorps la plus faible.
La valeur prédictive positive (VPP) de l'onglet varie selon les différents niveaux de séropositivité. Alors qu'un onglet positif a correctement prédit l'infection dans 87% des échantillons de Wuhan, la valeur prédictive positive est tombée à 11% et 1,6% respectivement à Shenzhen et Shijiazhuang, où les cas étaient beaucoup moins nombreux. Cela souligne que les échantillons à tabulation positive doivent être confirmés par d'autres tests d'anticorps.
La valeur de confirmation la plus élevée a été obtenue avec l'ajout de tests IgG-RBD, qui ont amélioré le PPV à 99%, ne manquant que 2,3% de vrais positifs parmi les donneurs de Wuhan. Cependant, cet ajout ne peut toujours pas améliorer le VPP lorsque la charge de travail est très faible, comme dans les deux autres villes.
Facteurs de risque des infections asymptomatiques
Les chercheurs ont recherché des facteurs de risque parmi les donneurs de Wuhan puisque les deux autres villes n'ont fourni que trois résultats confirmés positifs pour les anticorps. Aucun des cas confirmés parmi les donneurs dans aucune ville n'avait d'antécédents de symptômes de COVID-19, ce qui en faisait des cas asymptomatiques.
Sexe
L'analyse montre que les facteurs de risque indépendants de séropositivité incluent le sexe féminin, qui a des cotes ajustées 80% plus élevées par rapport aux hommes, et l'âge. Cependant, il a été démontré que les hommes ont plus du double de la mortalité à 22% et 10%, respectivement, et ont une durée moyenne d'hospitalisation plus longue. Des recherches antérieures ont montré que le taux de létalité est 1,64 fois plus élevé chez les hommes.
Le titre IgG-RBD est également plus élevé chez les femmes dans leur ensemble. Tous ces résultats impliquent que peut-être les femmes sont susceptibles d'avoir plus de chances d'infection asymptomatique, tandis que les hommes sont plus à risque de maladie symptomatique. Cela est peut-être dû aux «protections médiées par la signalisation des récepteurs aux œstrogènes», couplées à la prévalence accrue du tabagisme chez les hommes chinois, qui peut avoir entraîné des lésions pulmonaires plus courantes.
Âge
La cote ajustée est passée de 10% plus élevée chez les personnes âgées de 26 à 35 ans à 40% dans le groupe d'âge de 36 à 45 ans, 60% dans le groupe de 46 à 55 ans et quatre fois plus élevée chez les personnes de plus de 55 ans.
Les anticorps IgG-N étaient plus élevés chez les patients âgés, tandis que les hommes ont tendance à produire moins d'anticorps IgG-RBD.
Implications
Les résultats suggèrent que Wuhan est resté largement non infecté lors de la première vague d'infection au COVID-19, en raison des mesures de confinement efficaces. Cela est également responsable, selon les chercheurs, de la faible prévalence d'anticorps chez les donneurs dans d'autres villes.
Le très faible taux de séropositivité avant le 23 janvier 2020 indique que, puisque Tab apparaît environ 10 jours après l'infection, il est peu probable que le virus soit apparu dans la population de donneurs de Wuhan avant le 10 janvier 2020. Ceci est confirmé par le pic de séropositivité deux semaines plus tard. , du 2 au 8 février 2020, suivie d'une chute pendant la quarantaine de la ville.
La séroprévalence est restée faible, à 2,3%, après le relâchement du verrouillage. Les chercheurs commentent: «Ces données ont fourni des preuves scientifiques qui ont démontré l'efficacité de bloquer la propagation de la communauté virale des mesures strictes de santé publique effectuées à Wuhan. » Il est à noter; cependant, que d'autres scientifiques n'ont pas toujours trouvé fiables les données chinoises concernant la première phase de l'épidémie.
L'étude met également en évidence la nécessité de confirmer les tests basés sur Tab en utilisant des tests de neutralisation. Le test PPV de Tab dépend de l'incidence des cas de la population dépistée. Lorsqu'il est combiné avec des résultats de neutralisation, les faux positifs de Tab sont d'environ 0,4%, tandis que la valeur PPV augmente de 87% sans test IgG-RBD supplémentaire à 99% avec. Cette combinaison n'a manqué que 2,3% des vrais positifs dans le groupe des donneurs.
Les enquêteurs commentent: « Des confirmations de neutralisation sont en effet nécessaires pour exclure la réaction faussement positive dérivée des immunodosages qui peuvent surestimer le statut réel de l'infection, en particulier pour les études sérologiques dans une zone à faible prévalence. » Le titre de neutralisation était également étroitement lié à l'IgG-RBD, de sorte que ce dernier peut être utilisé comme substitut si le premier n'est pas disponible.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique / les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.