Des chercheurs du Conseil national espagnol de la recherche (CSIC) et de l'Université de Valence (UV) ont développé un système d'analyse moléculaire qui peut avertir de la présence du SRAS-CoV-2 (qui cause la maladie de Covid-19) dans une communauté basée sur l'étude de ses eaux usées.
Le système d'analyse, qui pourrait être utilisé comme méthode de surveillance épidémiologique, a été testé à Murcie (Espagne) et dans trois stations d'épuration de la zone métropolitaine de Valence. Les analyses ont montré que les traitements de désinfection de ces plantes sont efficaces pour éliminer la présence du virus.
Le nouveau système d'analyse a été développé par des chercheurs de deux centres du CSIC et d'un centre mixte des UV et du CSIC. À Valence, les analyses ont été menées par des chercheurs de l'Institut d'agrochimie et de technologie alimentaire (IATA, CSIC), dirigé par Gloria Sánchez et Walter Randazzo, et l'UV, dirigé par Pilar Domingo-Calap et Rafael Sanjuán.
Les analyses à Murcie ont été menées par l'équipe de Sánchez et Randazzo, l'IATA, aux côtés d'une équipe dirigée par Ana Allende et Pilar Truchado, du Centre de science des sols et de biologie appliquée du Segura (CEBAS, CSIC).
À Murcie, l'étude a été lancée par l'entité de traitement et d'épuration des eaux usées de la région de Murcie (ESAMUR) en collaboration avec d'autres centres de recherche de l'IATA et du CEBAS.
« Les groupes de recherche prélèvent des échantillons depuis le 12 mars et plus de 60 échantillons ont été analysés à cette époque en différents points des six stations de traitement de la région, y compris les effluents et l'eau issue du traitement secondaire », explique la chercheuse Ana Allende , du CEBAS.
En premier lieu, l'objectif était de déterminer s'il y avait présence de SARS-CoV-2 dans les eaux usées et de vérifier l'efficacité des traitements de désinfection mis en place dans les stations d'épuration », ajoute-t-elle.
À Valence, ces études ont été menées en collaboration avec les usines de traitement des eaux usées de Pinedo 1 et 2 et de Quart-Benàger, qui dépendent du Département régional de l'agriculture, du développement rural, de l'urgence climatique et de la transition écologique. Les chercheurs analysent davantage d'usines de traitement de la Communauté de Valence, ainsi que des échantillons prélevés à différentes dates avant que les premiers patients ne descendent avec Covid-19 en Espagne.
L'objectif est d'établir ce type d'analyse comme méthode de surveillance épidémiologique. Détecter l'évolution de la présence du matériel génétique du virus dans les eaux usées urbaines au cours du temps et en différents points de la Communauté nous fournira des informations sur la prévalence du virus dans la population. «
Pilar Domingo-Calap, chercheur, I2SysBio
Afin de mener l'étude, les chercheurs ont appliqué des méthodes qui avaient été précédemment développées par le groupe IATA pour détecter le virus d'origine alimentaire.
« Les résultats obtenus avec les techniques moléculaires à ce jour, à l'aide d'échantillons récents, ont détecté des concentrations d'environ 100 000 copies de matériel génétique du virus par litre d'eaux usées », souligne la chercheuse Gloria Sánchez, de l'IATA. Ces niveaux sont comparables à ceux des USA.
D'autres études récentes publiées aux Pays-Bas et en Chine ont également détecté la présence de SARS-CoV-2 dans les eaux usées. L'étude a vérifié que le traitement de désinfection réussit à éliminer la présence du virus.