Dans une étude récente publiée dans le Journal de l’Institut national du cancerdes chercheurs ont évalué un nouveau score de méthylation du virus du papillome humain (VPH) et de l’acide désoxyribonucléique (ADN) de l’hôte pour l’adénocarcinome sur place (AIS) et le dépistage de l’adénocarcinome cervical (ADC).
Les tests de persistance et de progression du VPH (Pap) ont réduit de manière significative l’incidence du carcinome épidermoïde (CSC) dans les années 1960. Cependant, l’incidence de l’ADC est restée élevée en raison de la faible sensibilité des tests Pap pour l’AIS ainsi que pour l’ADC. Ces lésions, principalement dans le canal endocervical, sont plus difficiles à visualiser par colposcopie ou à capturer dans un échantillon Pap.
À propos de l’étude
Dans la présente étude cas-témoins, les chercheurs ont évalué la spécificité et la sensibilité d’un score combiné de virus du papillome humain et de méthylation humaine pour dépister l’adénocarcinome. sur place et adénocarcinome.
Le score de méthylation a été calculé en faisant la moyenne du pourcentage de méthylation sur 35 sites CpG prédéterminés différents dans les cadres de lecture ouverts (ORF) L2/L1 des HPV-16, 18 et 45, et des régions promotrices de deux loci génétiques humains, l’héparane sulfate de glucosamine. 3-O-sulfotransférase 2 (HS3ST2) et supprimée dans le cancer colorectal (DCC) sur les chromosomes 16 et 18, respectivement.
L’équipe a examiné les cellules exfoliées de la région cervico-vaginale des femmes du groupe HPV PaP qui ont montré une positivité au HPV-16/18/45, y compris (i) 353 patients atteints de néoplasie intraépithéliale cervicale-3 (CIN-3) ou de carcinome épidermoïde, (ii) 176 Patients AIS ou ADC, (iii) contrôles avec des infections HPV-16/18/45 éliminées (HPV-clearers ; 579 individus) ou des infections persistantes (HPV-Persisters ; 292 individus).
À l’aide de méthodes de nouvelle génération, les chercheurs ont calculé les pourcentages de méthylation de l’ADN spécifiques à la région CpG. Les scores de méthylation de l’ADN ont été calculés en calculant le pourcentage moyen de méthylation pour toutes les 35 régions CpG analysées.
À partir des dossiers de santé électroniques, des données anonymisées sur la race, l’origine ethnique, les habitudes tabagiques et l’âge, ainsi que des rapports histopathologiques et cytologiques de suivi, ont été obtenus, avec des résultats cliniques accessibles jusqu’en 2014.
L’identification des lésions au Kaiser Permanente Northern California (KPNC) était basée sur les résultats histopathologiques d’échantillons dirigés par colposcopie. Le génotypage du VPH a été réalisé sur des échantillons en banque. Les cas ont été choisis sur la base des données de génotypage des HPV-16, 18 et 45. Des tests de méthylation du site ADN CpG ont été effectués sur un échantillon prélevé peu de temps avant le diagnostic de CIN3/SCC ou d’AIS/ADC. Les lectures de séquençage ont été cartographiées sur des séquences de référence de l’hôte humain et du virus, qui ont ensuite été converties en bisulfite in silico pour déterminer l’état de méthylation des cytosines CpG et non-CpG.
En calculant le rapport des Cs méthylés dans le nombre total de molécules séquencées par échantillon, le résultat de l’alignement a été converti en pourcentages de méthylation pour chaque cytosine testée. Les rapports de cotes (OR) ont été calculés à l’aide d’un modèle de régression logistique multivariable. De plus, une modélisation linéaire généralisée (GLM) a été utilisée. Des données basées sur la surveillance, l’épidémiologie et les résultats finaux (SEER) ont été utilisées pour calculer les valeurs de l’aire sous la courbe (AUC).
Résultats
Les tumeurs AIS/ADC (55 %) et les tumeurs CIN3/SCC (54 %) présentaient une plus grande proportion de femmes blanches que celles dont les infections HPC avaient disparu (44 %). Sept à dix pour cent des individus étaient des fumeurs actuels et 10 à 15 % étaient d’anciens consommateurs de cigarettes.
Le VPH-16 a été le plus souvent détecté dans les cas de CIN3 et de SCC (66 %, 24 % et 10 % d’infections par les VPH-16, 18 et 45, respectivement), tandis que le VPH-18 a été le plus souvent détecté dans les cas d’AIS et d’ADC ( 39 %, 51 % et 10 % d’infections par les HPV-16, 18 et 45, respectivement). Le VPH-16 était également plus répandu chez les personnes présentant une infection persistante au VPH (48 %) que chez celles dont l’infection avait disparu (32 %).
Chaque site CpG a montré un pourcentage plus élevé de méthylation de l’ADN parmi les cellules exfoliées de la région cervico-vaginale des patients AIS/ADC et CIN3/SCC par rapport au groupe témoin. Le score de méthylation ADC/AIS a démontré une sensibilité de 74 %, une spécificité de 89 % et des valeurs d’ASC de 88 %.
Les proportions comparables pour CIN3/SCC étaient respectivement de 46 %, 82 % et 68 %. En utilisant les agents anti-HPV comme contrôles, le OR du score de méthylation de l’ADN (quatrième par rapport au premier quartile) pour l’AIS et l’ADC était de 49. Les patients CIN3 et SCC présentaient des relations similaires mais plus faibles avec les scores de méthylation de l’ADN.
Les forces de l’OR étaient équivalentes à celles d’un gène humain ou d’un sous-type de VPH. Les rapports de cotes pour chaque site CpG étaient tous extrêmement significatifs. De même, tous les rapports de cotes spécifiques à la région CpG pour CIN3 et SCC étaient très significatifs. Néanmoins, les relations CIN3 et SCC étaient plus faibles que celles de l’adénocarcinome et de l’adénocarcinome. sur place. Les comparaisons directes ont révélé que l’AIS et l’ADC étaient liés à des niveaux plus élevés de méthylation dans presque toutes les régions CpG.
Les personnes présentant une infection persistante au VPH présentaient des niveaux de méthylation de l’ADN plus élevés que les personnes dont l’infection au VPH était guérie. L’AIS/ADC a montré des niveaux de méthylation considérablement plus élevés que les contrôles pour chaque type de HPV et les deux sites humains HS3ST2 et DCC CpG évalués. Les connexions CIN3/SCC se sont révélées similaires. Des comparaisons directes de cas par cas par type de VPH individuel et par les deux gènes humains ont toutefois révélé que l’AIS/ADC présentait des niveaux de méthylation nettement supérieurs à ceux de CIN3/SCC dans tous les sites CpG étudiés, sauf six.
Conséquences
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont montré que les femmes infectées par les HPV 16, 18 ou 45 présentant des scores de méthylation élevés présentaient de fortes probabilités d’AIS/ADC, ce qui indique la nécessité d’un examen histopathologique minutieux de la zone de transition cervicale. Les techniques de dépistage régulières telles que la colposcopie et les tests Pap ont montré une faible sensibilité dans la détection des cas d’AIS et d’ADC. Comparé au SCC, l’ADC a des taux de survie plus faibles, ce qui rend les résultats cliniquement pertinents.
La méthylation de l’ADN de régions CpG L1/L2 spécifiques dans les régions HPV-16, 18 et 45 et CpG dans les sites promoteurs des gènes HS3ST2 et DCC pourrait être des déterminants moléculaires critiques pour les tumeurs cervicales et les biomarqueurs associés. La méthylation de l’ADN L2/L1 pourrait constituer une étape intermédiaire dans la formation d’une tumeur cervicale, mais pourrait ne pas jouer de rôle biologiquement significatif dans la persistance du VPH.
