Une étude prédit la propagation du COVID-19 en Inde

Le Dr Shinjini Ghosh et ses collègues du Massachusetts Institute of Technology (MIT), aux États-Unis, ont mis au point un modèle prédictif qui analyse la propagation de l'infection au COVID-19 en Inde. Leur étude intitulée «Modèle prédictif avec analyse de la propagation initiale de COVID-19 en Inde» a été publiée avant l'examen par les pairs sur le serveur de préimpression Medrxiv *.

New Delhi, Inde – 30 mars 2020: Désert Connaught Place au moment du verrouillage en raison de la mise en quarantaine de Covid 19, l'un des plus grands centres commerciaux, commerciaux et financiers de New Delhi, en Inde. Crédit d'image: Prabhsas Roy / Shutterstock

Sur quoi portait cette étude?

Le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) qui cause la maladie COVID-19 a infecté plus de 3,85 millions de personnes à travers le monde et a causé plus de 269 000 décès. Déclaré pandémie le 11 mars de cette année, le virus a mis le monde à genoux, les économies vacillant dans le monde. Les voyages ont cessé, les fermetures et les distanciations sociales ont interrompu la plupart des grandes villes, car plus de 3,9 milliards de personnes, soit la moitié de la population mondiale, ont maintenant été invitées ou obligées de rester chez elles.

L'Inde est le deuxième pays le plus peuplé du monde après la Chine et possède l'une des populations les plus denses. L'infection a ainsi la propension à se propager rapidement dans le pays. Le premier cas de SRAS CoV-2 ou de la nouvelle infection à coronavirus a été détecté dans l'État indien du Kerala le 30 janvier 2020, chez un étudiant qui était revenu de l'épicentre de l'infection à Wuhan, en Chine. À ce jour, l'Inde a signalé 56 351 cas de COVID-19 et 1 889 décès dus à la maladie. Le nombre de cas depuis la fin janvier est en constante augmentation et l'Inde a pris des mesures pour rompre la chaîne de transmission à travers le pays.

Le 25 mars 2020, une interdiction de 21 jours à travers le pays a été annoncée avec tous les services non essentiels, et le transport entre les États a été arrêté. Les avions de passagers et les vols intérieurs et internationaux ont été arrêtés depuis le 22 mars 2020. Ce verrouillage a été prolongé jusqu'au 3 mai 2020, qui a de nouveau été prolongé jusqu'au 17 mai 2020.

Les auteurs de l'étude ont écrit que cette étude visait à analyser la propagation du COVID-19 en Inde à l'aide de statistiques sur les patients et d'un modèle de prédiction mathématique qui a réussi à prédire le nombre de cas le lendemain avec une précision de 83% depuis le premier cas. détecté en Inde.

Qu'est-ce qui a été fait et qu'est-ce qui a été trouvé?

L'analyse au niveau du patient a montré la répartition démographique des cas selon l'âge. Cela a été comparé aux tendances observées dans le monde. Cela a montré que la moyenne des patients détectés en Inde était de 38,54 (soit 17,22 ans de chaque côté). Cette étude a analysé la répartition par âge de 2 339 patients. Sur les 5 313 ​​patients étudiés, il y avait 66,76% d'hommes. Dans le monde, un peu plus de la moitié des cas touchés sont des hommes, ont noté les chercheurs.

Taux de récupération et délai de récupération et de décès

L'évaluation est jusqu'au 26 avril 2020, il y avait 26917 cas d'infection, et ces 5,914 ou 21,97% s'étaient rétablis de l'infection avec 3,07% de décès (826 cas) et 74,96% de cas actifs (20177 cas). Le taux de récupération en Inde a écrit que les chercheurs se trouvaient à 87,74% par rapport à la moyenne mondiale de 81%, a déclaré Ghosh.

Le délai moyen de rétablissement chez les patients indiens était de 14,47 jours (entre l'hospitalisation et le rétablissement officiel). L'étude a révélé que le délai moyen avant le décès (entre l'hospitalisation et le décès) était de 3,18 jours. Les chercheurs ont déclaré que cela était similaire aux suggestions de l'OMS et des CDC selon lesquelles le temps de récupération moyen était de deux semaines et le temps de récupération pouvait atteindre 6 semaines dans les cas graves. Entre-temps, la mort dans le monde, selon l'OMS, est de 2 à 8 semaines.Cependant, cela est nettement inférieur en Inde.

Comparaison du nombre réel et prévu de cas confirmés quotidiennement

Transmission de l'infection

Les chercheurs ont suivi les premiers cas en Inde, en examinant 3 273 cas, dont 712 patients avaient voyagé d'un endroit où il y avait des cas actifs, 194 patients avaient un membre de la famille infecté et 578 patients qui avaient été en contact avec un autre infecté. la personne. Ils ont écrit que 911 de ces patients avaient assisté à des rassemblements de masse avec des personnes infectées et ont contracté l'infection à partir de là.

Répartition par âge

Il a été noté qu'en Italie, 71% des cas avaient plus de 50 ans, en Inde, seuls 27,53% avaient plus de 50 ans. L'équipe a écrit que « le plus grand nombre d'adultes infectés étaient les plus jeunes – un changement par rapport à la tendance mondiale ».

Modèles prédictifs

L'auteur de l'étude a écrit que plusieurs modèles pouvaient prédire la propagation de l'infection à coronavirus. Parmi les plus importants, on peut citer « le modèle UPenn CHIME, une modélisation SIR (Susceptible-Infected-Recovered) en temps discret des infections / récupération. » D'autres incluent le catalyseur de santé, la fonction d'erreur de Gauss et la simulation de Monte Carlo.

L'un des modèles, a déclaré Ghosh, prévoyait que le nombre de cas en Inde à la fin du mois de mai serait de 13 000. Cependant, le scénario actuel montre plus de 35 000 cas au début du mois de mai, ce qui est le triple de ce qui était prévu à la fin du mois. Encore un autre modèle avait prédit 10 000 cas fin avril. C'était également un tiers de ce qui a été réellement vu.

Cette étude a donc utilisé un modèle mathématique différent pour prédire les nombres. Ils ont défini ce qu'on appelle un «facteur de changement». Le facteur de changement est défini comme «une mesure du rapport de l'augmentation quotidienne par rapport aux N derniers jours».

À l'aide de ce modèle, ils ont tenté de voir les chiffres prévus au cours des 74 des 90 prochains jours. Leurs calculs ont révélé qu'il y a un écart de 61 cas par rapport à la valeur réelle. Ils ont écrit: « Ceci ne représente que 3,21% du nombre maximal de cas quotidiens signalés au cours de cette période, et seulement 3,39% des cas signalés le plus tard le 30 avril 2020 ».

Conclusions et orientations futures

L'auteur a écrit qu'il y a « une augmentation alarmante du nombre de cas en Inde au cours du dernier mois ». Cependant, il existe également une « doublure argentée dans la nature » stabilisante « actuelle des facteurs de tendance, peut-être en raison des mesures de verrouillage mises en œuvre, ainsi que des tests généralisés, de la recherche des contacts et des mesures générales d'hygiène. » Ils écrivent qu'il y a une distribution d'âge différente observée en Inde avec la population plus jeune plus affectée. Ils ajoutent, cependant, « Le redressement rapide de la récupération chez les patients infectés en Inde est une autre lueur d'espoir. » Ils prévoient de modifier ce modèle pour prédire les chiffres réels observés en Inde. « Une brève enquête sur la liste des facteurs de changement montre qu'un facteur qui reste aux alentours de 1,0 indique une » stabilisation « du nombre quotidien de cas confirmés », écrit l'auteur en conclusion.

*Avis important

medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique / les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.