Dans un article récent publié dans le Lancette journal, les chercheurs ont quantifié le fardeau mondial de la résistance bactérienne aux antimicrobiens (RAM) pour présenter les décès et les années de vie ajustées sur l’incapacité (DALY) attribuables et associés à 23 agents pathogènes, 12 syndromes infectieux majeurs, 18 catégories de médicaments et 88 combinaisons agent pathogène-médicament.
Ils ont considéré deux scénarios contrefactuels et ont utilisé des méthodes cohérentes pour arriver aux estimations de l’étude car ils n’avaient aucune idée de la mesure dans laquelle une infection sensible ou aucune infection remplacerait les infections résistantes aux médicaments dans un scénario où il n’y avait pas de résistance aux médicaments.
Étude : Fardeau mondial de la résistance bactérienne aux antimicrobiens en 2019 : une analyse systématique. Crédit d’image : Tatiana Shepeleva/Shutterstock
Sommaire
Arrière-plan
La résistance aux antimicrobiens bactérienne, une menace émergente pour la santé publique, rend l’utilisation des antibiotiques vaine ou moins efficace contre de nombreuses maladies bactériennes courantes affectant les animaux et les humains. Un examen de la RAM commandé par le gouvernement du Royaume-Uni (Royaume-Uni) a déclaré qu’il pourrait faire 10 millions de morts par an d’ici 2050.
L’Organisation mondiale de la santé (OMS) et de nombreux autres chercheurs ont également souligné que la propagation de la RAM est un problème urgent qui nécessite une attention immédiate ; si elle n’est pas traitée, l’augmentation de la résistance aux antimicrobiens rendra plusieurs agents pathogènes bactériens hautement mortels dans un proche avenir. Le défi consiste à rassembler des données actuelles sur les combinaisons agent pathogène-médicament contribuant à la charge réelle de la RAM bactérienne pour toutes les régions du monde, même celles où la surveillance est minimale.
Selon les auteurs, les études n’ont rapporté que des données liées à la RAM pour des régions spécifiques et un nombre limité d’agents pathogènes et de combinaisons pathogènes-médicaments. Par exemple, les Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis (US-CDC) ont publié un rapport en 2019 sur les décès liés à la RAM pour 18 menaces liées à la RAM à l’aide de données de surveillance.
De même, Cassini et al. ont estimé la charge de huit et 16 agents pathogènes et combinaisons agent pathogène-médicament, respectivement, pour la région européenne entre 2007 et 2015. , tous les agents pathogènes et toutes les combinaisons agent pathogène-médicament contribuant au fardeau croissant de la résistance aux antimicrobiens bactérienne.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont utilisé une modélisation statistique prédictive pour générer des estimations mondiales de la charge bactérienne de la RAM pour tous les sites du monde, couvrant 204 pays pour lesquels ils ont utilisé toutes les données disponibles de l’étude Global Burden of Diseases (GBD), Injuries, and Risk Factors. L’étude GBD a rassemblé des estimations par âge et par sexe pour 369 blessures et maladies dans 204 pays et territoires entre 1990 et 2019.
Ils ont extrait des données de la littérature scientifique publiée, de collaborations de recherche multisites, d’essais cliniques, d’instituts de recherche basés dans des pays à revenu faible et intermédiaire (PRFI), de dossiers hospitaliers publics et privés, de données de tests de diagnostic, de systèmes de surveillance de sociétés pharmaceutiques, mondiaux, nationaux. , et des systèmes de surveillance améliorés, et d’autres sources pertinentes, englobant 471 millions (MN) de dossiers de patients ou d’isolats et 7 585 années de localisation d’étude, qu’ils ont rassemblés à l’aide de stratégies variées et utilisés pour les estimations d’études.
Les chercheurs ont modélisé les décès et les DALY pour 204 pays et territoires afin de présenter des estimations cumulées du fardeau de la RAM dans le monde et pour 21 régions GBD, dont sept super-régions GBD.
Pour le premier scénario contrefactuel, où les infections sensibles ont remplacé toutes les infections résistantes aux médicaments, ils n’ont estimé que les décès et les DALY directement dus à la RAM. Pour le deuxième scénario contrefactuel, où aucune infection n’a remplacé toutes les infections résistantes aux médicaments, ils ont estimé tous les décès et les DALY liés aux infections résistantes. Les deux estimations avaient des utilités différentes; cependant, les deux pourraient éclairer le développement de stratégies d’intermédiation pour réguler la propagation de la RAM.
L’approche de l’étude comprenait dix étapes d’estimation dans cinq composantes de modélisation globales, chacune avec des exigences de données variées ; par conséquent, les données d’entrée pour chaque composante de modélisation variaient également.
Résultats de l’étude
Le remplacement des infections résistantes aux médicaments par l’absence d’infection (premier scénario contrefactuel) et les infections sensibles (deuxième scénario contrefactuel) aurait évité respectivement 4,95 MN et 1,27 MN de décès en 2019, ce qui implique qu’en 2019, la charge mondiale liée à la résistance aux antimicrobiens les infections pour 88 combinaisons agent pathogène-médicament étaient d’environ 4,95 MN de décès (95 % d’UI), dont la résistance aux médicaments à elle seule a causé 1,27 MN de décès. De plus, après les cardiopathies ischémiques et les accidents vasculaires cérébraux, la RAM a représenté la plupart des décès en 2019.
De plus, l’analyse de l’étude a révélé que les taux de mortalité tous âges liés à la RAM étaient les plus élevés dans certains PRITI, contrairement à la notion courante selon laquelle le fardeau de la RAM bactérienne serait plus élevé dans les milieux à ressources élevées avec une consommation d’antibiotiques plus élevée. En effet, la résistance aux antimicrobiens apparaît comme un problème plus grave pour certains des pays les plus pauvres du monde. Les auteurs ont noté les taux de mortalité liés à la RAM les plus élevés en Afrique subsaharienne et en Asie du Sud en fonction de la prévalence de la résistance et des infections critiques des voies respiratoires inférieures, de la circulation sanguine et intra-abdominales, dans ces régions.
L’étude a également mis en évidence que dans les PRITI, il existe d’autres facteurs du fardeau plus élevé de la RAM, comme la rareté des infrastructures de laboratoire pour les tests microbiologiques nécessaires pour réduire l’utilisation des antibiotiques ou la rendre plus ciblée. Entre autres facteurs, les antibiotiques contrefaits, le manque d’assainissement et d’hygiène, les mauvaises réglementations sur l’utilisation des antibiotiques, etc., favorisent également la résistance.
En outre, les chercheurs ont identifié six agents pathogènes, E. coli, K. pneumoniae, S. pneumoniae, A. baumannii, S. aureus et P. aeruginosa, qui a le plus contribué au fardeau de la RAM en 2019 ; ils représentaient 73,4 % (intervalle d’incertitude de 95 %) des décès attribuables à la RAM bactérienne. L’OMS a reconnu les six agents pathogènes prioritaires ; cependant, sauf S. pneumoniaeciblés principalement par la vaccination contre le pneumocoque, aucun ne fait l’objet de programmes d’intervention en santé mondiale.
Sept combinaisons pathogène-médicament ont causé plus de 50 000 décès, soulignant la nécessité d’étendre les politiques de prévention et de contrôle des infections (PCI) ciblant les combinaisons les plus meurtrières, de renforcer le développement de vaccins et d’antibiotiques et d’améliorer l’accès aux antibiotiques essentiels de deuxième ligne si nécessaire. De plus, la résistance aux antibiotiques β-lactamines, par exemple les pénicillines et les céphalosporines, et les fluoroquinolones représentaient plus de 70 % des décès attribuables à la RAM parmi les agents pathogènes. Ces antibiotiques sont la première ligne de traitement empirique des infections graves.
En 2017, l’OMS a publié une liste de priorités pour éclairer les priorités de recherche liées aux nouveaux antibiotiques pour les agents pathogènes à résistance multiple qui ont causé des infections mortelles. Cependant, cette liste ne couvrait que cinq des sept combinaisons agent pathogène-médicament estimées avoir causé le plus de décès en 2019 ; par exemple, cette liste ne comportait pas de résistance aux fluoroquinolones E. coli et résistant à la méticilline S. aureus seulement comme une priorité « élevée » mais pas « critique ».
Selon les estimations de l’étude, l’ampleur de la RAM bactérienne en tant que problème de santé publique mondial est autant que le virus de l’immunodéficience humaine (VIH) et le paludisme, peut-être beaucoup plus élevé. De plus, le modèle de RAM variait selon la localisation géographique, les agents pathogènes et les combinaisons agent pathogène-médicament. Ainsi, les estimations régionales faites dans cette étude pourraient aider à adapter les réponses locales car l’approche « One Size Fits All » pourrait ne pas être appropriée.
Malgré des efforts concertés de collecte de données, des données de haute qualité sur la RAM étaient rares pour de nombreux PRITI. Néanmoins, une meilleure compréhension scientifique de cette menace pour la santé qui émerge rapidement devrait être la plus haute priorité pour les décideurs mondiaux en matière de santé.
conclusion
La présente étude a utilisé des innovations méthodologiques majeures, deux scénarios contrefactuels de RAM variés et des données complètes pour obtenir de nouvelles informations sur le fardeau mondial de la RAM. Plus important encore, il incorporait des modèles testés et itérés au fil des années lors de l’analyse de l’étude GBD. Ainsi, lorsqu’ils sont utilisés collectivement, ces modèles fournissent une estimation complète du fardeau de la RAM avec une couverture géographique solide.
En outre, les chercheurs ont comparé les résultats avec d’autres causes de décès, offrant un contexte indispensable sur l’ampleur du fardeau de ce problème de santé publique en croissance rapide. L’analyse de l’étude a confirmé que la RAM bactérienne constituait la plus grande menace pour la santé humaine en Afrique subsaharienne et en Asie du Sud, impliquait un ensemble diversifié d’agents pathogènes et était exceptionnellement élevée pour plusieurs classes d’antibiotiques essentiels, y compris les β-lactamines et les fluoroquinolones.
En outre, les efforts visant à construire et à améliorer les infrastructures de laboratoire et à renforcer les plans d’action nationaux et mondiaux sur la résistance aux antimicrobiens sont essentiels pour faire face au fardeau universel de la résistance aux antimicrobiens. Les études futures devraient également évaluer les effets indirects de la RAM, tels que son effet sur la prophylaxie des infections chez les receveurs de greffe d’organe.
À l’avenir, les estimations de l’étude pourraient éclairer les directives de traitement contre de nombreux agents pathogènes bactériens prédominants pour un syndrome infectieux donné, qui, avec les estimations de la charge pathogène-médicament, pourraient éclairer leurs directives de traitement personnalisées pour un emplacement spécifique.
