Une nouvelle étude publiée sur le serveur de pré-impression medRxiv* en juillet 2020 révèle la nature cruciale du temps en tant que facteur de contrôle du taux de mortalité dans la pandémie actuelle de COVID-19. Le contexte de l'article est l'épidémie suisse, dans laquelle environ 30000 personnes ont été infectées par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2), et plus de 1800 sont décédées de fin février à début mai 2020. L'étude suggère que le rapide L'introduction des INM en mars 2020 a évité des milliers de décès liés au virus en Suisse.
Étude: Le temps presse: endiguement de l'épidémie de SRAS-CoV-2 en Suisse de février à mai 2020. Crédit d'image: Roger Gantner / Shutterstock
Sommaire
L'évolution de l'épidémie en Suisse
Le premier cas dans ce pays est venu d'une région voisine d'une région touchée de l'Italie, mais la maladie s'est rapidement répandue dans le petit pays. En réponse à l'épidémie, une séquence d'interventions non pharmaceutiques (INP) a été rapidement introduite, notamment la fermeture d'écoles primaires, de magasins vendant des produits non essentiels et de restaurants, ainsi que la limitation du rassemblement de plus de cinq personnes le 20 mars. , 2020.
L'épidémie a accusé un recul après l'introduction de ces mesures en mars. Le 10 mai 2020, les restrictions ont été levées. L'article des chercheurs de l'Université de Berne vise à montrer comment le moment de la mise en œuvre des INM affecte le cours de l'épidémie et son issue.
Nombre modélisé de nouvelles infections, de patients hospitalisés, d'occupation des unités de soins intensifs (USI) et de décès lors de l'épidémie de SRAS-CoV-2 en Suisse. Les lignes pleines montrent l'estimation du maximum de vraisemblance du modèle et les zones ombrées correspondent aux intervalles de prédiction à 95%. Le modèle a été ajusté aux données représentées par des cercles blancs. Le nombre d'infections signalé (carrés gris) est indiqué à titre de comparaison. La ligne pointillée verticale indique le renforcement de la distanciation sociale le 17 mars 2020.
Effets potentiels des IPN antérieurs ou ultérieurs
Les chercheurs ont utilisé la modélisation pour estimer l'effet de différents scénarios sur l'épidémie suisse. À savoir, si les IPN avaient été mis en place une semaine plus tôt ou une semaine plus tard, comment l'incidence de l'infection, le nombre de cas hospitalisés et la mortalité auraient-ils changé?
La recherche était basée sur des modèles de transmission basés sur la population et comprenait l'introduction progressive des INM. Des recherches antérieures ont montré que celles-ci conduisaient à une forte réduction du nombre effectif de reproduction (Re) en Suisse.
Réduction du nombre effectif de reproduction Re lors de l'épidémie de SRAS-CoV-2 en Suisse. La ligne pleine montre l'estimation du maximum de vraisemblance du modèle et la zone grisée correspond à l'intervalle de compatibilité de 95%. Nous avons supposé que l'introduction séquentielle des NPI entraînait une réduction sigmoïde du taux de transmission sur une période d'environ 2 semaines. La ligne pointillée verticale indique le renforcement de la distanciation sociale le 17 mars 2020.
En utilisant des données publiques sur le nombre quotidien de cas confirmés, les hospitalisations, les admissions aux unités de soins intensifs (USI) et les décès liés au virus, les chercheurs ont constaté qu'au départ, les infections avaient augmenté de façon exponentielle.
Les chercheurs ont également estimé que le nombre total d'infections était environ dix fois supérieur au nombre de cas diagnostiqués et confirmés initialement. Plus tard, les cas diagnostiqués représentaient environ 20% du total, mais finalement, après la mise en place de tous les NPI, ils sont retombés à environ 10% du total. Le total estimé s'élevait donc à environ 264 000 cas.
En utilisant des simulations d'introduction antérieure de NPI, le modèle a montré qu'environ 2 000 décès se seraient produits si les NPI continuaient d'affecter négativement le nombre de décès après le 10 mai. S'ils avaient été mis en œuvre une semaine plus tôt, le modèle conclut que le nombre maximal d'hospitalisations aurait été beaucoup plus faible, à ~ 440, comme l'aurait été le pic d'occupation et de mortalité en USI, à ~ 88 et 400 respectivement.
Si les NPI avaient été introduits une semaine plus tard, ces chiffres auraient augmenté considérablement, avec un nombre maximal d'hospitalisations d'environ 10 200, un taux d'occupation maximal des unités de soins intensifs de 1 900 et une mortalité de plus de 8 000, respectivement.
Doubler les triples de temps avec les IPN
L'étude actuelle a montré que le nombre effectif de reproduction (Re) est passé d'environ 2,6 au début à 0,64, ce qui correspond à un temps de doublement d'environ 3 jours et 9 jours au début de l'épidémie et en phase post-lock-down, respectivement. Cela souligne l'urgence des IPN précoces pour contenir la propagation du virus.
Les chercheurs commentent: «Une semaine d’augmentation exponentielle des nouvelles infections au début de la propagation de l’épidémie a nécessité 3,1 semaines de« verrouillage »pour réduire le nombre d’infections au même niveau.»
Implications de l'étude
Il s'agit de la première étude à analyser les effets possibles des scénarios contrefactuels concernant les modifications du calendrier des implémentations NPI. Les résultats sont en partie corroborés par la baisse de la mortalité en Autriche, qui a signalé ses premiers cas en même temps que la Suisse, et qui a également été victime d'une propagation depuis la Lombardie voisine, en Italie. Cependant, l'introduction précoce et stricte des INM dans la semaine suivant le premier cas a entraîné une réduction du nombre de décès.
De plus, les chercheurs soulignent que le taux d'occupation de pointe élevé des USI de près de 2000 qui aurait pu résulter d'un retard d'une semaine dans les INM aurait probablement submergé le système de santé national, puisque la capacité effective des USI en Suisse n'était que d'environ 1275 Avril 2020.
En bref, l'étude conclut: «Notre étude montre que le temps presse pour répondre aux épidémies. Nous avons montré que si une mise en œuvre plus précoce des INM en Suisse aurait entraîné un nombre considérablement plus faible de cas d'hospitalisation et de décès, les mesures prises avec succès ont permis d'éviter une charge beaucoup plus élevée de morbidité et de mortalité liées au SRAS-CoV-2.
Puisqu'une semaine de propagation exponentielle du virus nécessite trois semaines de verrouillage pour ramener à nouveau le nombre de cas quotidiens au niveau d'origine, le retard augmente non seulement le nombre de décès, mais prolonge la période de verrouillage. Une imposition plus précoce de NPI stricts réduirait donc la charge sociale et économique de ces mesures. Deuxièmement, il existe des différences significatives dans le nombre d'infections selon les cantons, ce qui peut indiquer que les nouveaux foyers locaux vont probablement se limiter à des régions distinctes.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique / les comportements liés à la santé ou être traités comme des informations établies.
