Le neuroblastome (NB), la tumeur solide extracrânienne la plus répandue chez les enfants, pose un défi thérapeutique important en raison de ses métastases et de sa forte hétérogénéité. Une étude récente utilisant le séquençage d'ARN unicellulaire (scRNA-seq) a découvert des mécanismes moléculaires vitaux qui sous-tendent la progression et les métastases du NB, mettant ainsi en lumière des cibles thérapeutiques potentielles.
La recherche a analysé les tumeurs primaires et les métastases appariées des patients du Nouveau-Brunswick, révélant une sous-population « de départ » de cellules tumorales responsables du déclenchement des métastases. En appliquant diverses approches analytiques, notamment l’analyse de la trajectoire évolutive et la prédiction de la différenciation de l’état cellulaire, l’étude a délimité le paysage transcriptionnel du Nouveau-Brunswick et identifié une signature associée à un mauvais pronostic.
L'enquête impliquait la collecte d'échantillons de tumeurs auprès de six patients du Nouveau-Brunswick, englobant à la fois les sites primaires et métastatiques. Ces échantillons ont été soumis à scRNA-seq pour générer un atlas complet d’expression unicellulaire. L'analyse a révélé 11 groupes distincts, chacun présentant des caractéristiques transcriptionnelles uniques, soulignant l'hétérogénéité du Nouveau-Brunswick. Grâce à l'analyse de la variation du nombre de copies déduite (CNV) et au séquençage génomique entier (WGS), les cellules malignes ont été distinguées des cellules non malignes, facilitant ainsi une compréhension plus approfondie des populations de cellules tumorales.
L'analyse de la trajectoire de l'étude a identifié un groupe spécifique, appelé cellules « starter », comme initiateurs probables de la propagation métastatique du Nouveau-Brunswick. Ces cellules, identifiées à la fois dans les tumeurs primaires et les métastases, présentaient une capacité proliférative élevée et étaient caractérisées par un cycle cellulaire actif et des voies de réparation de l'ADN. Les cellules « starter » ont également démontré une transition épithéliale-mésenchymateuse partielle (EMT), un processus associé à des propriétés migratoires et invasives améliorées des cellules cancéreuses, suggérant un rôle dans la propagation métastatique du Nouveau-Brunswick.
Pour sonder davantage les interactions entre les cellules NB et leur microenvironnement, les chercheurs ont analysé les données scRNA-seq provenant de cellules non malignes au sein de l'écosystème tumoral. Ils ont découvert des interactions robustes, notamment médiées par la voie de signalisation TGFβ, entre les cellules « starter » et diverses cellules immunitaires et stromales. Cette découverte met en évidence une diaphonie complexe susceptible d’influencer la progression tumorale et l’évasion immunitaire.
Dans le cadre d'une découverte importante, l'étude a identifié une signature cellulaire « de départ » de 150 gènes associée à de mauvais résultats cliniques dans plusieurs ensembles de données. Le pouvoir prédictif de la signature en cas de pronostic défavorable était robuste sur différentes plates-formes de séquençage et cohortes de patients, soulignant son utilité potentielle en milieu clinique.
Malgré l'approche globale de l'étude, elle a reconnu certaines limites, notamment la taille relativement petite de l'échantillon en raison des défis liés à la collecte d'échantillons primaires et métastatiques appariés du Nouveau-Brunswick. Cependant, les résultats ont été validés à l'aide d'ensembles de données publics et d'approches expérimentales indépendantes, renforçant ainsi les conclusions de l'étude.
En conclusion, cette étude fournit une feuille de route moléculaire détaillée du parcours métastatique du Nouveau-Brunswick, identifiant une sous-population cellulaire clé et la signature génétique associée qui pourraient éclairer les futures stratégies thérapeutiques. Les connaissances sur la dynamique cellulaire et moléculaire du Nouveau-Brunswick ont le potentiel d’améliorer le pronostic et de guider les interventions ciblées contre ce cancer pédiatrique agressif.
