Une nouvelle analyse systématique des cellules cancéreuses identifie 370 cibles médicamenteuses prioritaires dans 27 types de cancer, notamment les cancers du sein, du poumon et des ovaires.
En examinant plusieurs couches d’informations fonctionnelles et génomiques, les chercheurs ont pu créer une vue panoramique impartiale de ce qui permet aux cellules cancéreuses de se développer et de survivre. Ils identifient de nouvelles opportunités pour les thérapies contre le cancer, ce qui constitue un pas significatif vers une nouvelle génération de traitements contre le cancer plus intelligents et plus efficaces.
Dans l’étude la plus complète du genre, des chercheurs du Wellcome Sanger Institute, d’Open Targets et de leurs collaborateurs, ont regroupé les données de 930 lignées de cellules cancéreuses. Ils ont ensuite utilisé des méthodes d’apprentissage automatique pour trouver les cibles médicamenteuses les plus prometteuses pour le développement de nouveaux traitements, ainsi que les patients qui bénéficieraient le plus de ces traitements. Cela impliquait d’évaluer l’apparition de ces cibles dans les tumeurs réelles des patients et de les relier à des marqueurs biologiques spécifiques et à des caractéristiques génétiques et moléculaires trouvées dans les tumeurs.
Les résultats, publiés aujourd’hui (11 janvier) dans Cellule cancéreusenon seulement rapprochent les chercheurs de la production d’une carte complète de la dépendance au cancer1 de chaque vulnérabilité dans chaque type de cancer, mais aident à orienter les efforts ciblés pour accélérer le développement de traitements ciblés contre le cancer.
Il existe de nombreux types de cancer pour lesquels il manque actuellement des traitements efficaces, comme les cancers du foie et des ovaires. La chimiothérapie et la radiothérapie sont des traitements efficaces, mais incapables de distinguer les cellules normales des cellules cancéreuses. Elles peuvent donc causer des dommages dans tout le corps avec des effets secondaires graves, tels qu’une fatigue extrême, des nausées et une perte de cheveux.
De nouveaux médicaments de précision basés sur les mutations génétiques exactes à l’origine du cancer sont nécessaires pour aider les millions de patients diagnostiqués chaque année avec une forme de cancer, responsable d’un décès sur six dans le monde.2. Cependant, le développement de médicaments connaît un taux d’échec de 90 %3ce qui le rend à la fois coûteux et inefficace.
Avec plus de 20 000 cibles anticancéreuses potentielles dans le génome, déterminer celles qui conviennent à des types spécifiques de cancer et de patients constitue un défi de taille.
Dans cette nouvelle étude, des chercheurs du Wellcome Sanger Institute et leurs collaborateurs ont entrepris de réduire les cibles potentielles des médicaments. En analysant les données disponibles du projet Cancer Dependency Map, qui impliquait la technologie CRISPR4 En perturbant un par un chaque gène présent dans 930 lignées de cancer humain, ils ont pu produire à ce jour la vision la plus complète des nouvelles cibles potentielles du cancer.
Les chercheurs ont d’abord identifié des faiblesses au sein de différents types de cancer – ce qu’on appelle les dépendances génétiques, c’est-à-dire les gènes, les protéines ou les processus cellulaires sur lesquels les cellules cancéreuses dépendent pour survivre – qui pourraient être exploitées pour créer de nouvelles thérapies. Ils ont ensuite lié ces faiblesses à des marqueurs cliniques pour identifier les patients chez lesquels ces thérapies seraient les plus efficaces. Enfin, ils ont exploré comment les paires de marqueurs de dépendance s’intègrent dans les réseaux connus d’interactions moléculaires au sein des cellules, fournissant des indices sur la manière dont la biologie cellulaire est perturbée par le cancer et sur les cibles susceptibles de donner lieu aux thérapies les plus efficaces.
Les travaux permettent de mieux comprendre quels types de cancer peuvent éventuellement être traités par les stratégies existantes de découverte de médicaments et d’identifier les domaines dans lesquels des approches nouvelles et innovantes sont nécessaires.
Les résultats soulignent l’importance d’adapter les traitements aux caractéristiques uniques de chaque cancer, promettant des soins plus personnalisés pour les patients avec moins d’effets secondaires à l’avenir.
Le Dr Francesco Iorio, co-auteur principal de l’étude du Centre de recherche en biologie computationnelle de Human Technopole, a déclaré : «En analysant le plus grand ensemble de données jamais réalisé sur la dépendance au cancer, nous présentons la carte la plus complète à ce jour des vulnérabilités des cancers humains – leur « talon d’Achille ». Nous identifions une nouvelle liste de cibles prioritaires pour des traitements potentiels, ainsi que des indices sur les patients qui pourraient en bénéficier le plus – le tout rendu possible grâce à la conception et à l’utilisation de méthodologies informatiques et d’intelligence artificielle innovantes..»
Le Dr Mathew Garnett, co-auteur principal de l’étude au Wellcome Sanger Institute et Open Targets, a déclaré : «Nos travaux révèlent 370 cibles prioritaires potentielles pour lutter contre les cancers les plus répandus, notamment les cancers du sein, du poumon et du côlon. Ce travail exploite les dernières avancées en matière de génomique et de biologie computationnelle pour comprendre comment cibler au mieux les cellules cancéreuses. Cela aidera les développeurs de médicaments à concentrer leurs efforts sur les cibles à plus forte valeur ajoutée afin de proposer plus rapidement de nouveaux médicaments aux patients..»
Deux personnes peuvent avoir le même type de cancer, mais leurs maladies peuvent se comporter différemment. C’est pourquoi nous avons besoin d’une médecine de précision. Ce travail ambitieux est un exemple convaincant de recherche qui éclaire dès le départ la découverte de médicaments, ouvrant la voie à des thérapies de précision plus efficaces contre le cancer. Donner aux gens des traitements pour leur cancer unique peut améliorer les chances de succès et aider davantage de personnes touchées par le cancer à vivre plus longtemps et mieux..»
Dr Marianne Baker, responsable de l’engagement scientifique, Cancer Research UK
