L’épidémie massive et continue de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), causée par le syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2 (SRAS-CoV-2), dans le monde entier, a entraîné un nombre effarant de plus de 549000 décès aux États-Unis, parmi plus de 30 millions de cas. Un nouveau document de recherche préimprimé publié sur le medRxiv* le serveur discute des facteurs liés aux chances de tester positif pour ce virus.
Sommaire
L’importance des tests
La propagation du virus est étroitement liée à la capacité de tester sa présence et de séparer les individus infectieux. Ainsi, la capacité et la fiabilité des tests, ainsi que l’accessibilité, ont été essentielles pour surveiller l’épidémie et traiter les patients.
Cela nécessite une meilleure compréhension de ce qui affecte les résultats des tests, car cela pourrait façonner les stratégies de test et influencer le poids attaché à un résultat de test positif. Les tests COVID-19 comprennent à la fois des tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR) pour l’acide nucléique viral ou des tests d’antigènes rapides pour détecter les antigènes viraux, ainsi que des tests d’anticorps pour des anticorps spécifiques du SRAS-CoV-2.
Objectifs de l’étude
L’étude actuelle a utilisé les données des dossiers de santé électroniques (DSE) aux États-Unis pour explorer les caractéristiques des patients qui ont subi un test du SRAS-CoV-2 dans la pratique clinique, ainsi que les tendances des taux de test et de positivité au fil du temps. Troisièmement, les chercheurs tentent d’examiner le degré de concordance entre les tests viraux et les tests d’anticorps.
Tests viraux
Cette étude comprenait des données sur plus de 800 000 patients qui avaient été testés pour l’infection dans le contexte réel de la pandémie.
Les tests viraux avaient un taux de positivité de 9% et les tests d’anticorps ont abouti à une positivité de 12%. Dans l’ensemble, il y avait une concordance de 90% à 93% entre les résultats des tests d’anticorps et viraux parmi ceux qui ont reçu les deux.
Les taux de positivité ont montré une corrélation inverse avec le nombre de personnes testées dans n’importe quel groupe et ont diminué au fil du temps, quelle que soit la région ou la race.
Les facteurs de risque d’être positif comprenaient le fait d’être un homme (augmentation des chances de positivité de 20%), hispanique ou non hispanique noir et asiatique, et avoir une assurance maladie inadéquate.
Faire partie de ces groupes ethniques a multiplié par deux à trois les probabilités de positivité virale. Les populations du nord-est des États-Unis, la présence de diabète, d’obésité et de démence ont également été associées à une positivité des tests plus élevée.
Nombre de patients et positivité par cohorte, date d’index, région et race / origine ethnique
Les résultats des tests chez les enfants semblent être un peu moins prévisibles, montrant plus de divergences entre les tests viraux et les tests d’anticorps, les tests d’anticorps ayant un taux de positivité plus élevé dans ce groupe. Les chances d’être positif étaient de 40% inférieures à celles des jeunes adultes jusqu’à 34 ans lorsque les deux présentaient le même nombre de symptômes.
La présence d’anosmie / dysgueusie était associée à un risque sept fois plus élevé de test positif. Dans le même temps, avec une détresse respiratoire aiguë, il était de six et quatre fois si le patient avait une pneumonie. De plus petites augmentations ont été notées avec des infections pulmonaires, une perte d’appétit et une toux.
Tel que mesuré par une semaine d’étude, la région du Nord-Est a montré un rapport de cotes initial élevé pour le taux de test positif, qui a diminué au fil du temps, contrairement à l’Ouest, qui a montré les cotes les plus élevées pour la positivité du test au cours de la dernière semaine d’étude. Des probabilités plus élevées de positivité avec le temps ont également été observées dans le sud des États-Unis.
Nombre de patients de la cohorte 2 (test viral) et taux de positivité par date d’indexation par région
Nombre de patients de la cohorte 2 (test viral) et taux de positivité par date d’indexation par race / origine ethnique
Tests d’anticorps
Les tests d’anticorps étaient positifs dans 12% des cas et étaient deux fois plus susceptibles d’être positifs chez les enfants et ceux dont l’assurance était insuffisante (sept fois les taux observés chez les patients sous régime d’assurance commerciale). Le taux de positivité a augmenté de 2,5 à 3 fois chez les Noirs ou les Hispaniques.
Chez les résidents du Nord-Est, les tests d’anticorps étaient quatre fois plus susceptibles d’être positifs. Les patients avec un test viral positif antérieur avaient 44 fois plus de chances d’avoir un test d’anticorps positif, tandis qu’un test viral négatif précédent réduisait les chances de moitié, par rapport à ceux sans test viral antérieur.
Parmi ceux qui ont reçu des tests d’anticorps, 17% avaient des symptômes suggérant le COVID-19 au cours des six semaines précédant le test, la grande majorité (60%) se situant dans la semaine précédant immédiatement le test. Environ 16% d’entre eux ont subi un test viral avant le test d’anticorps, un cinquième d’entre eux étant positif aux anticorps.
Environ 90% de ceux qui ont reçu un test viral suivi d’un test d’anticorps le même jour ont montré des résultats concordants. Des résultats discordants se produisaient plus fréquemment si le test viral était positif et si le test d’anticorps était effectué dans les deux semaines suivantes.
Nombre de patients testés et pourcentage de positifs pour le test viral initial du SRAS-CoV-2 par âge
Quelles sont les implications?
Les résultats montrent que les populations minoritaires sont moins testées que la population dans son ensemble, bien que leurs taux de test de positivité (PR) soient plus élevés. Les personnes ayant un indice de maladie sous-jacent plus élevé, tel que mesuré par l’indice de comorbidité de Charlson, avaient des taux de positivité inférieurs.
Une positivité accrue au test est également liée à une assurance maladie inadéquate. Ces résultats concordent avec la présence d’inégalités sociales et économiques aux États-Unis. Les taux de positivité des tests sont également déterminés par le fait que différents groupes ont des niveaux d’exposition variables au virus et différents niveaux d’accès aux tests.
La comparaison des résultats des tests viraux et anticorps montre qu’ils sont pour la plupart en accord. Cependant, pour nuancer cela, il semble que l’intervalle entre un test viral et un test d’anticorps devrait être d’au moins deux semaines pour obtenir des résultats hautement concordants.
Cet intervalle reflète probablement le temps nécessaire à la séroconversion. Ce qui est intéressant, c’est la forte concordance entre ces tests car les tests sont assez différents. Il s’agit d’une constatation bienvenue car les résultats des tests disponibles dans les différents DSE ne peuvent pas être directement évalués quant à leur sensibilité ou leur spécificité.
Le taux de positivité chez les enfants dépend plus fortement du type de test, avec des cotes de positivité plus élevées avec les tests d’anticorps. Les facteurs sous-jacents ici peuvent inclure l’état clinique au moment du test, la gravité de la maladie et la réponse immunitaire. Cela reflète les données de surveillance nationales antérieures.
Les données du DSE montrent l’importance du dysfonctionnement chimiosensoriel en tant que prédicteur de la positivité du test, ainsi que de la fièvre, de la toux et des infections pulmonaires. Dans le même temps, certains symptômes semblent avoir une faible association avec la positivité du test. Cela pourrait être une fausse association, peut-être en raison des faibles taux de dépistage chez les patients à haut risque d’infection.
Alternativement, il se peut que les symptômes soient trop non spécifiques et diluent ainsi la positivité du test. Ou ces symptômes peuvent être présents au début de la maladie lorsque les tests sont moins sensibles.
Comme pour les études précédentes, la positivité du test est plus faible chez les personnes à haut risque d’infection en raison de multiples maladies chroniques sous-jacentes. Cela peut sembler contre-intuitif mais est attribuable à un comportement d’autoprotection ou à une tendance accrue à tester de tels groupes.
Dans ce groupe, cependant, l’obésité, le diabète et la démence continuent de démontrer de fortes associations positives avec une maladie grave.
« Nos résultats identifient le besoin de tests supplémentaires chez les patients minoritaires et fournissent de nouveaux résultats liés aux tests d’anticorps. »
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique / les comportements liés à la santé ou être traités comme des informations établies.
