Une nouvelle étude qui suscite la réflexion menée par des chercheurs aux Pays-Bas confirme l’hypothèse que pour l’infection par le coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère, un âge plus élevé est associé à une augmentation de la charge virale. Cela pourrait avoir des implications pour les interventions non pharmaceutiques (INP) et les stratégies d’atténuation pour gérer la pandémie, comme les fermetures d’écoles, ainsi que pour les stratégies de test.
Le début de la pandémie actuelle de coronavirus 2019 (COVID-19) a vu la réaction en chaîne de la transcriptase inverse polymérase (RT-PCR) devenir l’étalon-or pour diagnostiquer cette infection. Ce test est principalement utilisé pour fournir un résultat positif / négatif, mais peut également être utilisé pour estimer la charge virale dans l’échantillon testé si le seuil de cycle (Ct) ou le point de passage (Cp) est examiné.
Dans la plupart des cas d’infection par le SRAS-CoV-2, la cinétique de la charge virale montre d’abord une forte augmentation de la charge virale, avant l’apparition des symptômes, suivie d’une baisse lente. Les cultures virales ne réussissent que si l’échantillon a une faible valeur Ct (inférieure à 27) tandis que lorsqu’elle est supérieure à 35, le virus est difficilement cultivable, ce qui indique un faible risque de propagation. Cependant, il est difficile de comparer directement les charges virales dans différentes populations, en raison de l’utilisation de différents tests et méthodes, qui ont un impact sur le Ct.
L’étude actuelle s’est donc concentrée sur le Ct dans tous les échantillons d’une population d’échantillonnage de routine, tous testés dans un laboratoire régional néerlandais. L’objectif était de trouver une différence entre les différents groupes de patients, y compris les hospitalisés, les généralistes, les maisons de retraite, les travailleurs de la santé (TS) et les patients testés dans les centres de test de santé publique, ainsi qu’entre les groupes d’âge, en ce qui concerne la charge virale et le période pendant laquelle les symptômes ont existé.
L’étude a inclus plus de 270 000 patients, en utilisant uniquement le premier résultat. S’il y avait plusieurs résultats positifs, le premier était utilisé, qu’il soit positif ou négatif. Environ 9% étaient positifs. Dans la première vague, plus d’un quart des tests ont été effectués pour des patients hospitalisés, mais ce groupe ne représentait que moins de 1% dans la deuxième vague, avec plus de 80% provenant du système de dépistage néerlandais de la santé publique.
Sommaire
Modèles distincts de la population
Des valeurs Ct plus élevées (charges virales plus faibles) dans les échantillons respiratoires ont été associées aux échantillons obtenus lors de la première vague. Cependant, dans cette vague, les valeurs de Ct étaient plus faibles chez les patients de santé publique que chez les patients généralistes, chez les patients non hospitalisés et chez les travailleurs de la santé dans les maisons de retraite. Avec le début de la deuxième vague, les résidents des maisons de retraite et les patients généralistes ont montré des valeurs Ct plus faibles.
L’âge et le sexe comptent
Lorsqu’il est stratifié par âge dans les catégories suivantes, à savoir, 0 à 12 ans, 12 à 17 ans, 18 à 29 ans, 30 à 49 ans, 50 à 59 ans, 60 à 69 ans, 70 à 79 ans et plus de 79 ans , l’étude démontre que l’âge avancé est lié à un pourcentage plus élevé de positifs et à une charge virale plus élevée. Les patients plus jeunes étaient beaucoup plus susceptibles d’avoir des valeurs Ct supérieures à 30.
Environ un tiers des enfants de moins de 12 ans avaient un Ct supérieur à 30, mais seulement la moitié des autres patients. Les valeurs médianes de Ct étaient 4 fois plus élevées dans le groupe le plus jeune que dans le groupe le plus âgé, ce qui correspond à une réduction de 16 fois de la charge virale.
Lorsque le moment de l’apparition des symptômes et le test étaient connus, l’augmentation de l’âge était liée à des valeurs de Ct plus faibles, à tout intervalle entre l’apparition des symptômes et le test. Cela a été observé malgré le fait que la charge virale augmentait avec une augmentation de cet intervalle.
Distribution des valeurs de Cp PCR du SRAS-CoV-2 dans différents groupes d’âge (n = 18,290) Chaque couleur correspond à un groupe d’âge spécifique qui a été testé en routine au cours de la période du 1er janvier au 1er décembre. Pour chaque groupe, la fréquence des Cp- valeurs a été utilisé pour calculer un score de densité dont l’aire sous la courbe est égale à 1.
Quelles sont les implications?
Dans cette première étude sur la distribution de la charge virale chez un large éventail de patients, il est clair que la charge virale est toujours la plus élevée chez les patients plus âgés, indépendamment du sexe ou de l’apparition des symptômes. Encore une fois, la population testée pour cette infection était différente dans les première et deuxième vagues. Et troisièmement, les échantillons de la deuxième vague avaient une charge virale médiane plus élevée.
La raison du changement dans les populations testées est le changement dans la politique de dépistage, qui s’est concentrée sur les patients hospitalisés dans la première vague, mais est passée à des tests plus généraux à mesure que la capacité s’est améliorée, pendant la deuxième vague.
La découverte de faibles charges virales chez les patients plus jeunes n’est pas en accord avec les études antérieures, montrant l’importance unique de cette étude qui utilisait les données de plus de 2 600 patients de moins de 20 ans et d’environ 240 de moins de 12 ans. Cependant, ils offrent plusieurs avertissements. D’une part, la difficulté d’effectuer des prélèvements nasopharyngés ou oropharyngés sans douleur chez les enfants peut avoir conduit à un pourcentage plus élevé d’échantillons nasaux ou à mi-cornet, viciant les résultats.
Cet aspect doit être étudié de manière approfondie, car des études antérieures ont donné des résultats contradictoires quant à savoir si ces échantillons ont une charge virale réduite. Deuxièmement, la plupart des patients du groupe d’âge plus jeune étaient suffisamment âgés pour tolérer la procédure.
Les explications telles qu’un seuil de test plus élevé pour les enfants ou des tests restreints ne semblent pas tenir la route, car l’augmentation des charges virales avec l’âge se maintient au cours de l’année de l’étude. Au lieu de cela, il peut être important d’étudier la distribution et l’expression du récepteur de la cellule hôte, l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2), chez les enfants, l’immunité différentielle chez les enfants, les différences dans le microbiome et l’immunité préexistante aux coronavirus.
Enfin, la sensibilité relative du test d’antigène vis-à-vis des tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR) doit être explorée en relation avec les résultats de cette étude. Étant donné que près d’un tiers des enfants avaient des valeurs Ct supérieures à 30, la sensibilité du test antigénique pourrait bien être plus faible dans ce groupe.
L’étude met en évidence l’importance d’utiliser les données d’un large spectre de patients, en grand nombre, d’un seul laboratoire, afin de mieux découvrir l’évolution réelle de la population de patients testés et la distribution de la charge virale. Les faibles charges virales chez les enfants appuient l’affirmation selon laquelle ce groupe d’âge ne joue pas un rôle clé dans la propagation virale. Des recherches supplémentaires seront nécessaires pour comprendre comment cela est lié à la toux et à d’autres paramètres épidémiologiques qui affectent également la transmission.
*Avis important
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