Avec la montée en flèche des cas de maladie à coronavirus (COVID-19) à travers le monde, il est d'une importance capitale de comprendre toute l'étendue de la pandémie. Cependant, c'est un défi permanent pour les responsables de la santé publique.
Actuellement, la capacité des tests diagnostiques peut être insuffisante et, dans certains hôpitaux, la notification des patients atteints de COVID-19 est retardée pendant des semaines. De plus, de nombreuses personnes infectées ne développent pas de symptômes, ce qui rend plus difficile l'identification des personnes qui doivent être isolées et mises en quarantaine.
Lors d'épidémies passées de maladies virales, les scientifiques surveillent les eaux usées ou les eaux usées à la recherche de traces d'un agent pathogène pour une surveillance efficace des populations.
Désormais, une équipe de chercheurs de l'Université Rice, du Baylor College of Medicine et du Houston Health Department montrent que les niveaux d'ARN du SRAS-CoV-2 sont un puissant prédicteur des tendances du taux de positivité nasale deux semaines à l'avance. Cela pourrait aider à suivre le taux de positivité des populations, en accélérant l'isolement et le traitement des personnes infectées.
L'étude
La surveillance ou la surveillance des eaux usées pour le SRAS-CoV-2 offre un moyen de suivre en temps réel l'infection communautaire. Bien que le COVID-19 soit considéré comme une maladie respiratoire, l'ARN viral peut être détecté dans les eaux usées car les personnes infectées excrètent également le SRAS-CoV-2 dans leurs selles.
Dans le monde entier, l'ARN du SRAS-CoV-2 a été détecté dans de nombreux échantillons d'eaux usées. La surveillance des eaux usées pour le SRAS-CoV2 présente de nombreux avantages, notamment sa rentabilité, en tant qu'outil complémentaire aux tests de diagnostic, et elle pourrait identifier les épidémies avant les tests de diagnostic. De plus, la surveillance des eaux usées évite les biais d'autres indicateurs épidémiologiques et recueille des informations auprès des personnes qui n'ont pas accès aux soins de santé de base.
Si la surveillance révèle avec succès la dynamique de l'infection avant les tests de diagnostic, le gouvernement et les responsables de la santé publique disposeront de données en temps quasi réel sur la prévalence de la maladie.
Pour arriver aux résultats de l'étude, publiés sur le serveur de pré-impression medRxiv *, les chercheurs ont mené un programme complet de surveillance des eaux usées pour le coronavirus à Houston, au Texas, une ville de 3,6 millions d'habitants. La ville a connu une augmentation des cas, des hospitalisations et des décès entre mai et octobre.
L'équipe a collecté des échantillons dans 39 usines de traitement des eaux usées de la ville. Ils ont détecté des niveaux d'ARN du SRAS-CoV-2 dans les eaux usées qui fournissent un avertissement de deux semaines pour les changements dans le taux de positivité.
De mai à octobre, l'équipe a collecté et analysé des échantillons d'influents composites pondérés sur 24 heures provenant de 16 à 39 usines de traitement des eaux usées une fois par semaine. L'équipe a collecté ces échantillons le même jour chaque semaine.
Résultats de l'étude
Les résultats de l'étude ont montré que les niveaux d'ARN du SRAS-CoV-2 étaient le meilleur indicateur prédictif des tendances du taux de positivité environ deux semaines à l'avance.
«Compte tenu de la forte relation prédictive des charges virales des eaux usées et des taux de positivité, la surveillance des eaux usées représente une approche viable pour tester simultanément l'ensemble de la population de Houston, et un moyen de fournir une surveillance hebdomadaire continue de l'ensemble de la population», ont conclu les chercheurs dans l'étude. .
En outre, les charges d'ARN viral des eaux usées ont montré un suivi robuste et puissant du taux de positivité pour ceux desservis par des usines de traitement individuelles. Ces résultats pourraient être utilisés en temps réel pour établir des interventions de santé publique.
L'équipe a noté que la surveillance des eaux usées est une approche rapide et abordable pour obtenir une couverture complète de grandes populations. Cependant, les chercheurs estiment également que des recherches supplémentaires sont importantes pour estimer la prévalence de la maladie des eaux usées.
L'équipe recommande également que la méthode soit utilisée non seulement dans les villes mais aussi dans la communauté nationale et mondiale. De cette façon, les zones où les tests de diagnostic sont coûteux et impossibles pourraient avoir les moyens de tester la propagation du COVID-19.
«Une fois qu'un vaccin est développé et administré, la surveillance des eaux usées peut faciliter la détection précoce de la réémergence du SRAS-CoV-2 dans les communautés et être utilisée pour diriger les ressources pour l'administration du vaccin, conformément aux travaux antérieurs effectués dans les années 1960 qui ont facilité la la livraison du vaccin antipoliomyélitique oral pour prévenir les flambées », ont ajouté les chercheurs.
Les États-Unis restent le pays avec le plus grand nombre de cas, atteignant plus de 10 millions de cas. Le bilan des morts dans le pays a dépassé 238 000 morts. À l'échelle mondiale, le nombre de cas a dépassé les 50,8 millions et le nombre devrait augmenter dans les semaines à venir, alors que de plus en plus de pays connaissent la deuxième vague de propagation du virus.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique / les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
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