Les scientifiques ont beaucoup travaillé pour comprendre la dynamique de transmission, la structure, l’interaction moléculaire et de nombreux autres aspects du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2), qui est le virus responsable du coronavirus 2019 (COVID-19) en cours. pandémie. Il est impératif de comprendre les paramètres épidémiologiques du virus afin de contenir la pandémie.
Étude : La corrélation entre les moments d’apparition des symptômes du SRAS-CoV-2 et la transmission secondaire sape les efforts de lutte contre l’épidémie. Crédit d’image : Menara Gravis/Shutterstock.com
Sommaire
Importance des paramètres épidémiologiques
Deux des paramètres épidémiologiques les plus importants des maladies infectieuses sont l’intervalle de génération et la période d’incubation, qui sont tous deux des paramètres utilisés pour décrire la réponse à l’épidémie. L’intervalle de génération, qui définit l’infectiosité d’un agent pathogène chez un hôte, est la période entre l’infection d’un hôte par un agent pathogène (infecteur) et la transmission de l’agent pathogène à un autre hôte (infecté).
Comparativement, la période d’incubation fait référence au temps qui s’écoule entre l’infection et l’apparition des symptômes résultant de la maladie. La période d’incubation détermine le taux de réplication d’un agent pathogène et indique la durée pendant laquelle une infection peut passer inaperçue chez un individu infecté.
Par conséquent, la période d’incubation joue un rôle important dans l’évaluation des périodes de quarantaine. Les scientifiques ont indiqué que ces deux paramètres donnent un aperçu de la dynamique fondamentale de l’infection. Des études de ces paramètres pourraient également aider les responsables de la santé publique à élaborer des politiques efficaces pour gérer les épidémies.
Paramètres épidémiologiques du SARS-CoV-2
Les scientifiques avaient précédemment estimé la période d’incubation moyenne du SRAS-CoV-2 au début de la pandémie. À cette époque, ils étaient confrontés à certaines difficultés pour déterminer les durées d’exposition suffisantes pour provoquer l’infection, ainsi que la direction de la transmission.
En règle générale, les scientifiques utilisent l’intervalle de série comme proxy pour estimer l’intervalle de génération. Ceci est également utilisé pour prédire le nombre de reproduction de base, qui est essentiellement la moyenne du nombre de personnes infectées par un seul infecteur, dans une population sensible.
Cependant, le nombre effectif de reproduction implique le nombre moyen de personnes infectées par un seul infecteur en présence de réponses immunitaires dues à des infections antérieures et à d’autres interventions telles que la vaccination. Les chercheurs ont déclaré que l’utilisation d’intervalles en série comme approximation du temps de génération peut entraîner des estimations biaisées du nombre de reproduction effectif. Cela est dû à plusieurs facteurs, tels que la présence d’infections asymptomatiques.
Des études antérieures ont révélé que les infections au SRAS-CoV-2 sont associées à une transmission présymptomatique importante, qui se produit lorsque l’intervalle de génération est plus court que la période d’incubation. Les scientifiques ont indiqué une corrélation entre l’intervalle de génération et la période d’incubation du SRAS-CoV-2.
Ceci est biologiquement plausible, car il existe des preuves qui montrent que la charge virale du SRAS-CoV-2 atteint un pic au moment de l’apparition des symptômes. Bien que des recherches antérieures aient indiqué l’existence d’une telle corrélation, elle n’a pas encore été estimée.
Une nouvelle étude
Une nouvelle étude publiée sur le serveur de préimpression medRxiv* fournit des preuves de la corrélation susmentionnée et a estimé la période entre l’intervalle de génération et la période d’incubation du SRAS-CoV-2.
Dans cette étude, les chercheurs ont obtenu un ensemble de données à partir de bases de données publiques contenant 257 paires de transmission SARS-CoV-2 au Japon et ont estimé l’intervalle de génération moyen et la période d’incubation moyenne. De plus, les chercheurs ont également mesuré la dépendance de ces périodes aux caractéristiques démographiques et épidémiologiques des paires.
Les auteurs se sont concentrés sur l’obtention de données avec une grande certitude sur la direction de transmission. Ils ont découvert que parmi de nombreux pays, le Japon appliquait des méthodes de recherche des contacts en amont depuis le début de la pandémie de COVID-19. En plus d’aider à la prévention de grands groupes de cas, cette approche était également une condition appropriée pour obtenir des données de paires de transmission.
La présente étude a révélé que la corrélation entre l’intervalle de génération et la période d’incubation aiderait à quantifier la transmission du SRAS-CoV-2 qui, à son tour, empêcherait la sous-estimation de la transmission présymptomatique qui se produit avant le développement des symptômes. Cette étude a également évalué l’effet de l’isolement des cas symptomatiques de COVID-19 sur le contrôle de l’épidémie.
Résultats de l’étude
Ici, les chercheurs ont estimé que l’intervalle de génération moyen se situe entre 3,7 et 5,1 jours, tandis que la période d’incubation moyenne se situe entre 4,4 et 5,7 jours. Par conséquent, l’intervalle de génération moyen s’est avéré systématiquement plus court que celui de la période d’incubation moyenne lorsqu’il est estimé conjointement. Cette observation suggérait une présence constante de transmission présymptomatique.
Les scientifiques ont également trouvé une corrélation positive entre l’intervalle de génération et la période d’incubation avec le tau de Kendall, allant de 0,4 à 0,6. Cette corrélation positive a indiqué que les cas symptomatiques dépendent de l’infectiosité du virus.
Des études antérieures ont révélé que même si les infections asymptomatiques du SRAS-CoV-2 sont moins infectieuses que les cas symptomatiques, elles jouent un rôle important dans la dynamique de l’épidémie.
Conclusion
L’émergence des variantes du SRAS-CoV-2 a provoqué une augmentation des cas de COVID-19 à travers le monde. Cependant, il n’est pas clair si la moyenne et la variance de l’intervalle de génération et de la période d’incubation de ces variantes seront similaires à celles de la souche d’origine.
À ce jour, un nombre limité d’études ont suggéré que la variante SARS-CoV-2 Alpha pourrait avoir une durée d’intervalle de génération plus longue ; cependant, ce n’est pas le cas pour la variante Delta. L’étude actuelle offre de nouvelles informations sur la corrélation entre l’intervalle de génération et la période d’incubation, ce qui devrait encourager les recherches futures dans ce domaine.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.
