Bien qu’il s’agisse d’un ancêtre proche, de nouvelles recherches sur des singes macaques suggèrent que les niveaux d’anticorps contre le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) diffèrent de ceux des humains dans leur capacité à reconnaître certains épitopes – la zone où l’anticorps se lie à l’antigène. De plus, les niveaux d’anticorps de Macaque ont montré un large éventail de réponses envers les épitopes avec des mutations du SRAS-CoV-2 qui favorisent l’évasion immunitaire.
Étude : Différences entre les macaques et les humains dans la réponse en anticorps SARS-CoV-2 Spike provoquée par la vaccination ou l’infection. Crédit d’image : exs_yori/Shutterstock
Brièvement, les anticorps d’humains vaccinés étaient les seuls à reconnaître les peptides d’épitopes sur le domaine N-terminal et C-terminal. Les humains avec des anticorps naturellement acquis avaient une faible reconnaissance du domaine C-terminal. De tous les groupes, les macaques avec des anticorps naturellement acquis ont eu une réponse plus forte aux régions en amont et en aval de l’épitope du peptide de fusion.
Étant donné que les études sur les animaux sont un moyen courant de tester des vaccins avant de les tester chez l’homme, les résultats suggèrent que les singes macaques peuvent ne pas être le modèle idéal pour tester le SRAS-CoV-2.
Cette nouvelle étude a récemment été publiée sur le bioRxiv* serveur de préimpression.
Sommaire
Fond
Les chercheurs ont utilisé une approche d’analyse mutationnelle profonde basée sur les phages pour examiner les types d’épitopes ciblés par les anticorps acquis lors de la vaccination ou après une infection par le SRAS-CoV-2. Ils ont également examiné les voies d’échappement des anticorps dans chaque épitope, ce qui indiquerait la force de la liaison des anticorps.
Il y avait quatre groupes impliqués dans l’étude : les macaques à queue de cochon vaccinés, les humains vaccinés, les macaques rhésus qui ont eu une réinfection par le SRAS-CoV-2 et les humains avec une immunité naturellement acquise.
Les macaques vaccinés ont reçu leur version d’un vaccin à ARNm. Des échantillons de plasma pour mesurer les taux d’anticorps ont été prélevés 42 jours après la première dose ou 14 jours après la deuxième dose.
De même, les personnes vaccinées avaient reçu deux doses du vaccin Moderna COVID-19. Des échantillons de sérum ont été donnés 36 jours après la première dose/une semaine après la deuxième dose.
Les macaques infectés se sont rétablis deux fois de l’infection par le SRAS-CoV-2. Les infections ont été induites à 6 semaines d’intervalle et des échantillons de sérum ont été prélevés 2 semaines après la seconde infection. De même, les personnes qui avaient reçu des anticorps après avoir récupéré d’une infection bénigne étaient malades pendant une durée médiane de 67 jours.
L’étude
Les peptides des anticorps de chaque individu ont été enrichis pour étudier la reconnaissance des anticorps de la protéine de pointe.
La plupart des anticorps n’ont pas reconnu le domaine de liaison au récepteur du SRAS-CoV-2 en raison des changements de conformation observés dans les épitopes de cette région particulière. Les chercheurs notent qu’il est plus difficile de capturer les réponses en anticorps car le Phage-DMS ne peut détecter que les épitopes avec des séquences linéaires.
Une exception a été observée chez les macaques à queue de cochon vaccinés. Certains présentaient une forte liaison d’anticorps à un épitope de domaine de liaison au récepteur. Cependant, bien que cela ne soit pas cohérent, quatre des cinq macaques vaccinés ont également montré une réponse en anticorps au même épitope. Les résultats suggèrent que la liaison de l’anticorps dans le domaine de liaison au récepteur n’était pas basée sur la vaccination.
Les humains vaccinés plus que les macaques vaccinés avaient des anticorps avec une préférence pour la reconnaissance du domaine N-terminal du SRAS-CoV-2, du domaine C-terminal et du peptide de fusion.
Les macaques avec une immunité naturellement acquise avaient plus d’anticorps que les humains avec une immunité naturellement acquise qui pouvaient reconnaître les régions d’épitopes sur le domaine C-terminal, le peptide de préfusion et le peptide de postfusion.
Chacun des quatre groupes avait des anticorps capables de détecter la région épitopique de la tige hélice-heptade répétée 2 (SH-H).
Les groupes avec des anticorps induits par le vaccin ont eu une réponse plus forte envers l’épitope HR2 que les groupes avec des anticorps naturellement acquis.
Ces résultats renforcent encore l’argument selon lequel les macaques sont un modèle animal peu fiable pour étudier les réponses des anticorps au SRAS-CoV-2 et traduire les résultats aux humains.
Différences dans la détection des protéines de pointe
Certaines protéines de pointe du SRAS-CoV-2 ont développé des mutations qui rendent plus difficile pour les anticorps d’identifier et de cibler les régions épitopiques. Les chercheurs se sont concentrés sur les profils d’échappement pour le domaine C-terminal, le peptide de fusion et la région d’épitope SH-H.
Les anticorps de macaques vaccinés, d’humains vaccinés et de macaques dotés d’une immunité naturelle ont réussi à détecter des peptides dans le domaine C-terminal. En revanche, les anticorps de l’immunité acquise naturellement chez l’homme n’ont pas reconnu la région de l’épitope. Cependant, il y avait une grande variabilité dans les taux de détection entre les groupes.
Dans la région de l’épitope du peptide de fusion, les réponses des anticorps variaient également. La plupart des anticorps dans tous les groupes n’ont pas détecté la région d’épitope du peptide de fusion AA 811-825.
Pour la région d’épitope SH-H, les quatre groupes ont identifié des peptides dans la région. De plus, les anticorps dans tous les groupes n’ont pas réussi à détecter la région d’épitope AA 1145-1158 muté.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.
