Annoncer une nouvelle publication d'article pour Innovations et applications cardiovasculaires journal. Cette étude visait à explorer les gènes immunitaires et leurs changements d'expression dans l'infarctus du myocarde (IM) grâce à des méthodes de bioinformatique complètes et à valider ces gènes en tant que cibles diagnostiques et thérapeutiques potentielles.
Les données d'expression des gènes ont été analysées à partir de trois ensembles de données: GSE29111 et GSE66360, qui ont été combinés comme un ensemble de formation, et GSE48060, qui a servi de jeu de validation. Nous avons effectué une analyse de l'expression des gènes différentielle, une analyse d'enrichissement GO / KEGG, une analyse du réseau d'interaction protéine-protéine (PPI), une analyse de réseau de co-expression des gènes pondérées (WGCNA), une analyse d'enrichissement des ensembles de gènes et des études d'infiltration immunitaire pour identifier les gènes de base à l'immuno associé à Mi. Les capacités de diagnostic de ces gènes ont été évaluées avec des courbes caractéristiques de fonctionnement du récepteur, et la RT-PCR a été utilisée pour vérifier leurs niveaux d'expression entre les patients atteints d'IM et les témoins. Les relations de BCL6 avec la réponse inflammatoire et le stress oxydatif ont été explorées par la détection des facteurs inflammatoires TNF-α, IL-1 et IL-6; Sous-unités NADPH oxydase P67 et GP91; Activité SOD; et le contenu MDA.
Quatre-vingt-dix gènes exprimés différentiellement ont été identifiés. Des analyses d'enrichissement ont mis en évidence leur implication dans la réponse au lipopolysaccharide et à la voie de signalisation IL-17. À partir du réseau PPI de ces gènes, quatre gènes centraux ont été initialement reconnus et WGCNA a également identifié 13 gènes. L'analyse d'intersection a finalisé l'identification de S100A12 et BCL6 en tant que biomarqueurs clés. Les deux gènes ont montré une expression différentielle significative entre les groupes MI et témoins (p <0,01), avec des AUC diagnostiques de 0,809 et 0,837, respectivement. Ces résultats ont été corroborés dans la validation définie par des AUC similaires favorables. De plus, l'analyse de l'infiltration immunitaire a révélé une corrélation positive entre ces gènes et les marqueurs des cellules immunitaires. Après le knockdown BCL6, une réponse inflammatoire exacerbée et un stress oxydatif ont été observés, comme l'indiquent une expression plus élevée de facteurs inflammatoires et de sous-unités de NADPH oxydase, et une activité SOD plus faible, dans le groupe MI que le groupe témoin (P <0,01).
S100A12 et BCL6 pourraient servir de biomarqueurs candidats pour la détection précoce de l'IM et se promettre comme de nouvelles cibles thérapeutiques.
