*Avis important: medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs comparent la cinétique virale des infections successives au coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2).
Étude: Cinétique virale des infections séquentielles par le SRAS-CoV-2. Crédit d’image : Limbitech / Shutterstock.com
Sommaire
Le COVID-19 protège-t-il contre une future infection ?
Environ 65 % de la population des États-Unis a été infectée deux fois par le SRAS-CoV-2 en novembre 2022. Certaines preuves suggèrent qu’une infection antérieure réduit le risque de réinfection dans une certaine mesure, tandis que d’autres études rapportent que l’infection initiale limite la guérison du coronavirus maladie 2019 (COVID-19). Ces résultats différents peuvent être dus à des biais lorsque les différences de statut vaccinal, de conditions comorbides et d’antécédents d’exposition ne sont pas prises en compte.
Le contrôle de ces facteurs est difficile en raison des interventions hétérogènes ; cependant, l’évaluation de la dynamique virale au niveau individuel pourrait s’ajuster à ces biais. La cinétique virale offre une occasion unique de comprendre l’impact de l’infection initiale sur les infections ultérieures et de traduire ces résultats en conseils de santé publique/médicaux.
L’impact du type de variant et de la vaccination sur la cinétique virale est bien établi. Les infections delta sont caractérisées par des concentrations virales maximales plus élevées que les infections Alpha/Omicron. Néanmoins, l’impact de l’immunité induite par l’infection sur la prolifération virale, la clairance et la concentration maximale dans les réinfections reste mal compris.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs évaluent la cinétique virale des infections par le SRAS-CoV-2 parmi le personnel, les joueurs et les affiliés de la National Basketball Association (NBA). La NBA a mené une surveillance du COVID-19 du 11 mars 2020 au 28 juillet 2022, y compris des tests fréquents et une évaluation clinique, qui consistaient en un suivi des symptômes et un diagnostic des cas dans le cadre de son programme de santé.
Des tests d’amplification en chaîne par polymérase quantitative par transcription inverse (RT-qPCR) ont été effectués sur des écouvillons oropharyngés et antérieurs. Les lignées SARS-CoV-2 ont été attribuées après séquençage du génome entier.
Le statut vaccinal et l’âge des participants ont été enregistrés. Le statut vaccinal a été attribué au premier test positif pour chaque infection. Les auteurs ont identifié des infections bien documentées, qui ont été définies comme celles avec une valeur de seuil de cycle (Ct) inférieure à 32 dans au moins un test et inférieure à 40 dans trois tests.
Un modèle linéaire par morceaux hiérarchique a été adapté aux mesures de concentration de SARS-CoV-2 sur une échelle logarithmique. Ce modèle a capturé le temps de prolifération virale, le temps de clairance et la concentration maximale.
Les ajustements du modèle ont été ajustés pour l’âge en appliquant un algorithme hamiltonien de Monte Carlo. Les chercheurs ont également examiné si la cinétique de l’infection SARS-CoV-2 Omicron BA.1/BA.2 différait entre les première et deuxième infections.
Les différences de cinétique virale entre la première et la deuxième infection pour les sujets ayant une première infection non Omicron et une deuxième infection Omicron ont également été déterminées. En outre, les chercheurs ont examiné si la cinétique virale relative au niveau individuel persistait à travers les infections.
La corrélation de Spearman a été utilisée pour déterminer la persistance relative des attributs cinétiques viraux à travers les infections, tandis que la corrélation de Pearson a été utilisée pour l’analyse de sensibilité.
Résultats
Au total, 3 346 infections ont été signalées parmi 3 021 personnes. Parmi ceux-ci, il y avait 1 989 infections bien documentées, dont 193 étaient des deuxièmes infections.
Dans les infections à SARS-CoV-2 Omicron, une infection antérieure était corrélée à une clairance plus rapide à une moyenne de 4,9 jours contre 7,2 jours pour les infections à Omicron sans antécédents d’infection.
De plus, les temps d’élimination de l’infection étaient plus courts à environ 5,1 jours chez les participants précédemment infectés par le vaccin que chez ceux sans antécédents d’infection. La concentration virale maximale et les temps de prolifération n’étaient pas significativement différents entre la première et la deuxième infections non Omicron causées par le(s) variant(s) d’Omicron.
Notamment, les temps de clairance étaient plus courts pour les deuxièmes infections à environ 5,1 jours que pour les premières à environ 8,8 jours. Les participants à l’étude de ce groupe qui ont reçu une dose de vaccin entre les infections ont eu un taux de clairance légèrement plus rapide pour la deuxième infection que ceux qui n’ont pas été vaccinés entre les infections. Il n’y avait aucune preuve que la catégorie de variantes de la première/précédente infection ait influencé la cinétique virale de la dernière infection à Omicron.
Parmi les participants qui avaient deux infections bien documentées, ceux avec un taux de résolution relativement plus rapide lors de la première infection étaient plus susceptibles d’avoir un temps de résolution plus court lors de la deuxième infection et vice versa.
Il y avait peu de preuves que le temps de prolifération d’un individu était conservé; cependant, les concentrations virales maximales des individus n’ont pas été maintenues à travers les infections.
conclusion
L’étude actuelle a démontré que les deuxièmes infections disparaissaient beaucoup plus rapidement que les premières infections chez les personnes atteintes d’infections multiples, en particulier lorsqu’elles recevaient une dose de vaccin intermédiaire. De plus, la variante/lignée SARS-CoV-2 de la première infection n’a pas eu d’impact sur la cinétique virale des infections ultérieures à Omicron. Néanmoins, le taux de clairance relatif au niveau individuel a persisté à travers les infections.
Alors que les antécédents d’infection et la vaccination pourraient moduler la cinétique virale, certains mécanismes immunologiques supplémentaires conservés à travers les infections pourraient déterminer la force immunitaire d’une personne contre le virus. Cependant, il reste à élucider si cette capacité relative à éliminer l’infection est généralisable à d’autres coronavirus ou agents pathogènes.
*Avis important: medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
