Mémoire immunitaire protectrice – à travers les cellules B, qui fabriquent des anticorps, et / ou les cellules T, qui dans le cas du CD8+ Les cellules T peuvent tuer les cellules infectées par des virus – peuvent être induites par des virus identiques mais aussi par des virus apparentés.
En ce qui concerne le virus COVID-19 SARS-CoV-2, il existe quatre coronavirus du rhume communs (CCCoV) qui, ensemble, causent environ 20% des infections courantes par le rhume: OC43, HKU1, 229E et NL63. La plupart des adultes ont été infectés par des CCCoV à plusieurs reprises dans leur vie.
L’existence ou non d’anticorps neutralisants anti-SRAS-CoV-2 induits par CCCoV reste un sujet de débat. Pendant ce temps, la génération de la mémoire des lymphocytes T devrait dépendre de la constitution génétique de l’individu infecté.
A savoir, la reconnaissance immunitaire par les cellules T dépend de la présentation des peptides («épitopes») par des molécules polymorphes du complexe majeur d’histocompatibilité (CMH), et différents allèles du CMH (variantes entre individus) présentent différents peptides du même pathogène.
Dans leur récente publication dans F1000Recherche, Dijkstra, Frenette et Dixon ont fourni la première recherche systématique de séquences d’épitopes de cellules T du SRAS-CoV-2 qui ont été déterminées expérimentalement dans une ou plusieurs études sur plus de 15 et sont identiques à au moins l’un des quatre CCCoV.
Ils ont constaté que ces épitopes sont rares. Le seul épitope de ce type qui a été identifié à plusieurs reprises comme immunogène par des groupes de recherche indépendants était le peptide VYIGDPAQL, qui est également appelé « VYI » après ses trois premiers acides aminés. Ce peptide est un fragment de l’hélicase virale et identique entre le SARS-CoV-2 et les CCCoV OC43 et HKU1.
Le peptide VYI s’est avéré se lier à l’allèle HLA-A * 24: 02 du CMH de classe I et stimuler efficacement CD8+ Cellules T d’au moins certains – et parfois de la majorité – des HLA-A étudiés * 24: 02+ Patients COVID-19 (convalescents) dans chaque étude traitant de cette question. Cette découverte a été confirmée dans deux études récentes qui ne faisaient pas partie de la Dijkstra.
Pour expliquer ces résultats, Dijkstra a supposé de manière conservatrice que les infections avec OC43 ou HKU1 avaient amorcé les cellules T anti-VYI, qui ont ensuite été restimulées lors de l’infection par le SRAS-CoV-2.
Les auteurs ont également émis l’hypothèse que la prévalence étonnamment faible du COVID-19 au Japon pourrait en partie être expliquée par une telle mémoire immunitaire des cellules T anti-VYI, puisque dans ce pays ~ 60% des individus portent l’allèle HLA-A * 24: 02 et ces dernières années, il y a eu des éclosions d’OC43.
Cependant, il est important de réaliser que, pour l’instant, cela reste uniquement une spéculation, car (i) des preuves expérimentales de la mémoire anti-VYI induite par CCCoV doivent encore être fournies, et (ii) la mémoire immunitaire ne signifie pas nécessairement une protection immunitaire.
Néanmoins, actuellement, l’hypothèse VYI / HLA-A * 24: 02 / Japon avancée par les auteurs est l’un des modèles les plus plausibles pour expliquer génétiquement les différences de résistance au COVID-19 entre les populations. Dijkstra et coll. décrit comment même un faible impact sur les niveaux de réplication du virus peut avoir un impact significatif sur la propagation du virus à travers une population. Leur article est également une lecture intéressante sur la situation du COVID-19 au Japon.
En outre, Dijkstra et coll. [1] a souligné que la similitude entre les protéines de pointe (S) du SRAS-CoV-2 et des CCCoV est faible, ce qui suggère que la conservation de la séquence de cette protéine est relâchée. En conséquence, les auteurs souscrivent à la crainte exprimée par d’autres selon laquelle le SRAS-CoV-2 pourrait muter sa protéine S pour échapper à la protection immunitaire induite par la génération actuelle de vaccins S uniquement.
L’inclusion dans les futurs vaccins de parties du virus qui sont plus hautement conservées entre le SRAS-CoV-2 et les CCCoV peut réduire le risque d’une telle fuite. Pour les populations dans lesquelles HLA-A * 24: 02 est répandu, comme au Japon, le peptide VYI est un candidat de choix pour une telle inclusion.
La source:
Référence du journal:
Dijkstra, JM, et al. (2021) La plupart des Japonais sont génétiquement prédisposés à reconnaître un fragment de protéine immunogène partagé entre le COVID-19 et les coronavirus du rhume commun [version 1; peer review: 2 approved, 1 approved with reservations]. Recherche F1000. doi.org/10.12688/f1000research.51479.1.
