Burkholderia thailandensis est une bactérie gram-négative qui constitue une menace pour la santé publique en raison d’être un agent pathogène opportuniste, ainsi que son identification erronée potentielle comme la plus pathogène B. pseudomallei, qui est son parent phylogénétique le plus proche. Le Federal Select Agents Program des États-Unis a désigné B. pseudomallei comme a Sélectionnez l’agent et l’agent causal de la mélioïdose.
B. thaïlandensis ont été signalés dans certaines régions tropicales telles que le nord de l’Australie et l’Asie du Sud-Est. Il s’agit d’un organisme de niveau de biosécurité 2 qui n’a pas été classé comme agent sélectif. Il est utilisé par certains chercheurs comme substitut de B. pseudomallei dans certaines expériences car il peut être manipulé en dehors des laboratoires de niveau de sécurité biologique 3. Différenciation de B. thaïlandensis est difficile de B. pseudomallei en raison de leurs phénotypes biochimiques similaires, la seule différence étant l’assimilation du L-arabinose par B. thaïlandensis.
B. thaïlandensis les infections chez l’homme sont assez rares, en particulier dans l’hémisphère occidental. Trois cas cliniques antérieurs ont été signalés dans le sud des États-Unis, le Texas en 2003, la Louisiane en 1997 et l’Arkansas en 2017. L’échantillonnage environnemental associé au cas du Texas de 2003 ainsi que l’échantillonnage précédent pour B. pseudomallei les membres complexes n’ont pas pu récupérer B. thaïlandensis. Occurrences de B. thaïlandensis ont été principalement signalés en Australie, en Asie du Sud-Est et en Afrique. Cependant, sa présence dans l’hémisphère occidental n’est toujours pas claire.
Une nouvelle étude en Maladies infectieuses émergentes visant à détecter et à isoler B. thaïlandensis à partir d’échantillons d’eau et de sol prélevés à Porto Rico entre décembre 2018 et mars 2020, ainsi qu’au Texas entre novembre 2019 et novembre 2020.
À propos de l’étude
L’étude impliquait la collecte d’échantillons d’eau et de sol en obtenant la permission des propriétaires fonciers ainsi que des permis de collecte sur les terres réservées. De 10 à 100 échantillons de sol ont été prélevés sur chaque site à une profondeur de 30 cm, où deux trous étaient espacés de 2,5 mètres. Environ 150 ml d’échantillon d’eau ont été prélevés sur chaque site avec 2,5 mètres entre chaque emplacement d’échantillonnage. Le filtrage de tous les échantillons d’eau a été effectué le jour de la collecte en utilisant une méthode de filtration d’eau Sartorius. De plus, des déchets environnementaux ont été collectés dans un réservoir d’eau résidentiel partiellement vide de 500 gallons au Texas. De plus, un échantillonnage environnemental a également été effectué dans le Mississippi en juillet 2022.
Tous les échantillons ont été protégés de l’exposition aux UV et ont été préparés pour l’extraction de l’ADN. Le test TaqMan a été utilisé pour détecter B. thaïlandensis Signal d’ADN dans les extractions d’ADN. Le séquençage du génome entier a été effectué, suivi d’une analyse de type de séquence multi-locus (MLST) et d’analyses phylogénétiques. Enfin, une génomique comparative a été réalisée pour identifier les différences génétiques dans les génomes séquencés.
Résultats de l’étude
Les résultats ont indiqué qu’un total de 2540 échantillons environnementaux ont été collectés, dont 370 provenaient du Texas et 2170 de Porto Rico. B. thaïlandensis L’ADN a été détecté dans 4 échantillons du Texas et 6 échantillons de Porto Rico. B. thaïlandensis des isolats ont été détectés dans 1 échantillon du Texas et 4 de Puerto Rico. B. thaïlandensis a également été identifié à partir d’un échantillon de sol prélevé dans le Mississippi. De plus, B. thaïlandensis une infection a également été identifiée chez un patient dans l’Oklahoma en 2021 lors d’un accident de voiture.
Environnement B. thaïlandensis les isolats du Mississippi et du Texas appartenaient au même clade que les isolats cliniques de Louisiane et du Texas ainsi que 2 isolats environnementaux d’Asie. L’isolat clinique de l’Oklahoma a été signalé comme étant étroitement lié à l’isolat du cas du Texas de 2003. On a observé que les isolats environnementaux du Mississippi et du Texas différaient davantage par rapport aux isolats d’Australie et de Thaïlande. Peu de diversité a été observée parmi les 4 isolats de Porto Rico. Roman as l’allèle 106 a été signalé dans l’isolat de l’Oklahoma ainsi que dans les 4 isolats de Porto Rico, qui ont tous été attribués au nouveau type de séquence (ST) 1772. gltb l’allèle 175 a été signalé dans l’isolat du Texas attribué au roman ST1785, tandis que l’isolat du Mississippi a été attribué au roman ST2019.
Par conséquent, l’étude actuelle indique que l’eau peut servir de réservoir et de source d’infection pour B. thaïlandensis à Porto Rico et dans le sud des États-Unis, en particulier lors d’inondations. Les cliniciens doivent également être conscients de l’identification erronée des B. thaïlandensis comme B. pseudomallei en raison de leurs propriétés morphologiques et biochimiques similaires.