La précision du dépistage de l’antigène spécifique de la prostate (PSA) pour le cancer de la prostate peut être améliorée en tenant compte des facteurs génétiques qui provoquent des changements dans les niveaux de PSA qui ne sont pas associés au cancer, selon une étude multicentrique menée par l’UC San Francisco et l’Université de Stanford .
Dans une étude publiée le 1er juin 2023 dans Médecine naturelle, les chercheurs de l’UCSF et leurs collaborateurs ont mené une vaste étude d’association à l’échelle du génome du PSA chez plus de 95 000 hommes sans cancer de la prostate diagnostiqué, qui a identifié plus de 80 nouvelles variantes associées au PSA. Ils ont tenté de découvrir si la prise en compte des facteurs génétiques qui provoquent des variations dans les niveaux de PSA qui ne sont pas attribuables au cancer pourrait aider à améliorer le dépistage du PSA.
Les taux de PSA représentent le principal biomarqueur diagnostique du cancer de la prostate. Ce test est largement utilisé mais n’est actuellement pas mis en œuvre dans le cadre d’un programme de dépistage formel. En raison de sa sensibilité et de sa spécificité médiocres, les tests PSA peuvent souvent conduire à détecter une maladie latente ou, dans certains cas, à manquer des tumeurs agressives. »
Linda Kachuri, PhD, MPH, ancienne chercheuse postdoctorale au Département d’épidémiologie et de biostatistique de l’UCSF et auteure principale de l’étude
Les chercheurs ont exploité ces nouvelles données pour construire un score polygénique à l’échelle du génome pour le PSA, mesurant la prédisposition génétique d’un individu en fonction des variations génétiques.
« Le score polygénique a capturé la prédisposition génétique de chaque individu à des niveaux élevés de PSA », a déclaré Rebecca Graff, ScD, professeure adjointe à l’UCSF au Département d’épidémiologie et de biostatistique et l’un des principaux auteurs de l’étude. « Le score polygénique était fortement associé aux niveaux de PSA dans les cohortes de validation et n’était pas associé au cancer de la prostate, confirmant qu’il reflète une variation bénigne du PSA. »
Pour examiner si le score polygénique pouvait améliorer la détection d’une maladie cliniquement significative et réduire le surdiagnostic, les chercheurs ont appliqué le facteur de correction du score polygénique à une cohorte Kaiser Permanente du monde réel et ont estimé les effets de cet ajustement sur les seuils de PSA utilisés pour les références de biopsie.
« Nous avons ajusté les valeurs PSA de chaque personne en fonction de son profil génétique unique », a expliqué Kachuri. « Les valeurs de PSA personnalisées de cette manière sont plus susceptibles de révéler des changements de PSA dus au cancer de la prostate car elles sont corrigées de l’influence de la génétique héréditaire. »
L’application d’une correction aux niveaux de PSA a amélioré la précision des décisions d’orientation des biopsies. Environ 30 % des hommes auraient pu éviter la biopsie, bien que les niveaux ajustés de PSA auraient manqué environ 9 % des biopsies positives. La plupart de ces derniers cancers étaient des maladies de bas grade qui ne nécessitaient pas de traitement, mais il reste encore de la place pour améliorer le score polygénique.
« Nous avons montré que la correction génétique des niveaux de PSA a le potentiel à la fois de réduire les biopsies inutiles et d’améliorer notre capacité à détecter les tumeurs avec un profil plus agressif », a commenté Kachuri. « Nous espérons que nos découvertes représentent un pas en avant dans l’élaboration de directives de dépistage informatives et dans la réduction de la zone grise diagnostique dans le dépistage de l’APS. »
Alors que l’étude était très vaste, près de 90% des participants étaient principalement d’ascendance européenne. Selon Kachuri, cela représente une limitation clé car la composition de l’étude ne reflète pas entièrement la population de patients touchés par le cancer de la prostate. « Nous espérons pouvoir partager bientôt les résultats de nos efforts pour mener des études plus vastes et plus diversifiées sur la génétique du PSA », a-t-elle déclaré.