Une équipe de scientifiques des États-Unis a récemment examiné le risque d’hospitalisation chez les patients infectés par des variantes plus mortelles du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2).
Les résultats révèlent que les patients infectés par les variantes alpha, bêta, gamma et delta ont un risque d’hospitalisation plus élevé que ceux infectés par la souche virale d’origine qui a émergé à Wuhan, en Chine, fin décembre 2019. L’étude est actuellement disponible sur le medRxiv* serveur de préimpression en attendant l’examen par les pairs.
Sommaire
Fond
La pandémie de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) causée par le SRAS-CoV-2 a fait peser un lourd fardeau sur l’humanité, avec plus de 234 millions d’infections et 4,8 millions de décès enregistrés dans le monde. De plus, avec l’émergence de variantes virales plus mortelles, de nombreux pays à travers le monde ont connu des deuxième, troisième et quatrième vagues de la pandémie avec des taux d’infection et de mortalité plus élevés.
Compte tenu de l’infectiosité, de la transmissibilité, de la pathogénicité et de la capacité d’échappement immunitaire considérablement accrues, certaines des nouvelles variantes ont été désignées comme variantes préoccupantes (COV) ou variantes d’intérêt (VOI) par l’Organisation mondiale de la santé.
Peu de temps après l’émergence, chacun de ces COV (variantes alpha, bêta, gamma et delta) a acquis une domination mondiale en remplaçant progressivement les variantes qui circulaient auparavant. Par exemple, dans l’État de Washington, la variante delta est associée à 70 % des cas de COVID-19 identifiés entre juin et juillet 2021.
Dans la présente étude, les scientifiques ont analysé les cas de COVID-19 causés par neuf COV/VOI différents dans l’État de Washington pour déterminer le risque d’hospitalisation associé à ces variantes.
Étudier le design
L’étude a été menée sur des patients COVID-19 confirmés en laboratoire dans l’État de Washington pour lesquels les données de séquençage génomique viral sont disponibles. Dans l’ensemble, l’étude a pris en compte les cas identifiés entre décembre 2020 et juillet 2021.
Un total de neuf variantes virales (alpha, bêta, gamma, delta, kappa, Iota, epsilon, eta et lambda) ont été inclus dans l’analyse pour déterminer le risque d’hospitalisation spécifique à la variante.
Remarques importantes
Un total de 23 170 cas avec des données de séquençage du génome viral disponibles ont été analysés dans l’étude. L’analyse de séquençage a révélé que les non-COV/VOI circulaient principalement dans l’État de Washington au début de la pandémie. Cependant, en mars 2021, les principaux COV/VOI ont pris le dessus en remplaçant les variantes qui circulaient auparavant.
Parmi tous les cas de COVID-19 infectés par des COV, 38,4 % étaient associés à la variante alpha, 1 % à la variante bêta, 8,8 % à la variante gamma et 8,7 % à la variante delta. Parmi tous les cas infectés par le VOI, 16 % étaient associés à la variante epsilon et 3 % à d’autres VOI testés. Hormis les cas de COV/VOI, environ 24 % des cas inscrits étaient associés à la souche originale du SRAS-CoV-2.
En ce qui concerne la démographie, environ 91 % des cas inscrits étaient âgés de moins de 60 ans et 94 % n’étaient pas vaccinés.
Risque d’hospitalisation
Un total de 726 cas hospitalisés ont été identifiés dans l’analyse (3,1%). Parmi ces cas, 247 étaient atteints d’une infection alpha, 12 d’une infection bêta, 127 d’une infection gamma et 74 d’une infection delta. Le risque d’hospitalisation le plus élevé a été observé pour les infections gamma, suivies des infections bêta, delta et alpha. Les autres variantes testées n’ont pas montré d’impact significatif sur le risque d’hospitalisation.
Proportion changeante des infections dues à des lignées variantes à Washington au cours de la période d’étude. La fraction de variante est calculée à partir d’une moyenne mobile de 21 jours à partir de notre ensemble de données séquencé complet s’étendant du 1er décembre 2020 au 30 juin 2021 et normalisée à 100 % pour mieux observer les changements dans la proportion d’infections provenant de lignées variantes par rapport aux infections totales.
Statut vaccinal et risque d’hospitalisation
Un ensemble distinct d’analyses a été mené dans l’étude pour comparer le risque d’hospitalisation parmi les cas de COVID-19 spécifiques à une variante stratifiés par le statut vaccinal.
L’analyse ne considérant que les cas non vaccinés a révélé que par rapport aux patients infectés par le SRAS-CoV-2 d’origine, les patients infectés par le gamma ont le risque d’hospitalisation le plus élevé, suivis des patients infectés par le delta et l’alpha.
En revanche, aucun impact significatif des COV sur le risque d’hospitalisation n’a été observé dans l’analyse qui n’a considéré que les cas vaccinés. Dans une analyse distincte tenant compte de tous les cas de COVID-19 indépendamment des variantes virales, il a été observé que les patients vaccinés ont un risque d’hospitalisation comparativement plus faible que les patients non vaccinés.
Risque relatif d’hospitalisation par lignée de variante. Le risque d’hospitalisation est comparé aux individus infectés par une lignée ancestrale. Les barres d’erreur représentent 95% CI. Les estimations sont ajustées en fonction de l’âge, du sexe attribué à la naissance et du statut vaccinal.
Importance de l’étude
L’étude indique que les patients infectés par les COV du SRAS-CoV-2 ont un risque plus élevé d’hospitalisation. Cependant, le risque peut être réduit par la vaccination COVID-19. Ces résultats soulignent la nécessité d’une préparation hospitalière et d’une vaccination de masse pour contrôler la morbidité et la mortalité liées au COVID-19.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.
