L’alimentation joue un rôle clé dans le façonnage du microbiome intestinal et de la santé

Une alimentation variée et riche en légumes est reconnue pour être saine pour le bien-être. Une consommation excessive de viande, notamment de viande rouge, peut entraîner des maladies chroniques et cardiovasculaires. C’est également parce que ce que nous mangeons façonne le microbiome intestinal. Dans le même temps, exclure certains aliments, comme les produits laitiers ou d’origine animale, n’est pas nécessairement une solution générale pour atteindre l’équilibre microbien. Mais pouvons-nous découvrir quels produits alimentaires déterminent les différences dans le microbiome intestinal ? Partant de cette question, un groupe de chercheurs a analysé des échantillons biologiques provenant de 21 561 individus (végétaliens, végétariens et omnivores) vivant aux États-Unis, au Royaume-Uni et en Italie, et a découvert que le régime alimentaire a une forte influence sur le microbiome intestinal et sur microbes intestinaux spécifiques associés à une meilleure santé. Les données ont été publiées dans Microbiologie naturelle.

À propos de l'étude. Le microbiome intestinal, l'ensemble des micro-organismes qui habitent notre intestin, joue un rôle crucial dans la détermination de la santé d'une personne, car il influence de nombreux aspects, de la digestion à la réponse immunitaire. Jusqu’à présent, seules quelques études à grande échelle ont examiné l’impact de différents régimes alimentaires sur la composition des bactéries intestinales. Cette étude, qui a également bénéficié de fonds européens, s'est notamment intéressée aux différences et aux conséquences des différents régimes alimentaires sur le microbiome. Les résultats montrent que les habitudes alimentaires façonnent le microbiome intestinal, car elles déterminent non seulement les microbes nécessaires à la digestion, mais également l’acquisition de microbes directement à partir de la nourriture elle-même.

« Alors que de plus en plus de personnes adoptent des régimes végétaliens et végétariens, nous avons voulu découvrir à quel point leurs microbiomes sont différents et quels micro-organismes sont responsables de ces différences », explique Gloria Fackelmann, première auteure de l'étude et chercheuse au département Cibio. Le groupe qui a mené cette recherche, qui comprend également des chercheurs du King's College de Londres, a été coordonné par Nicola Segata, professeur de génétique et chef du laboratoire de métagénomique computationnelle du département Cibio.

Selon les résultats des analyses réalisées au Laboratoire de Métagénomique du Département Cibio, les végétaliens ont en moyenne l'alimentation la plus saine, suivis par les végétariens et les omnivores. Cependant, les données les plus intéressantes ont émergé de l’étude de la diversité du microbiome intestinal, c’est-à-dire de la mesure de la variété des bactéries qui habitent notre intestin. Dans l’ensemble, il y avait moins de diversité chez les végétariens et les végétaliens que chez les omnivores, mais les scientifiques soulignent que la diversité à elle seule n’est pas un aspect fiable pour déterminer la santé du microbiome, car elle ne prend pas en compte la qualité et la fonctionnalité des bactéries.

Les signatures microbiennes des régimes végétaliens, végétariens et omnivores. Un aspect clé de l’étude consistait à examiner les différences entre les microbiomes intestinaux. Les chercheurs ont pu voir comment chaque modèle alimentaire conduit à une signature microbienne unique. Les microbiomes des omnivores présentent une présence accrue de bactéries associées à la digestion de la viande, telles que Alistipes putredinisimpliqué dans la fermentation des protéines. Et les omnivores ont plus de bactéries associées aux maladies inflammatoires de l'intestin et à un risque accru de cancer du côlon, comme Couples de Ruminocoques et Bilophile Wadsworthia. Les microbiomes des végétaliens diffèrent par le nombre de bactéries impliquées dans la fermentation des fibres, comme plusieurs espèces dans le Phyla Bacteroides et Firmicutesqui aident à produire des acides gras à chaîne courte, comme le butyrate. Ces composés ont des effets bénéfiques sur la santé intestinale, car ils réduisent l’inflammation et maintiennent un meilleur équilibre homéostatique avec notre métabolisme et notre système immunitaire. Enfin, la principale différence entre les végétariens et les végétaliens est la présence de Streptocoque thermophilus dans le microbiome des végétariens, une bactérie présente principalement dans les produits laitiers et utilisée dans la fabrication du yaourt.

Alimentation saine et microbiome sain. L’étude a souligné que c’est la qualité de l’alimentation – plutôt que le modèle alimentaire lui-même – qui influence la composition du microbiome. Les personnes ayant des habitudes alimentaires plus saines, qu’elles soient végétaliennes, végétariennes ou omnivores, présentaient une composition microbiologique plus favorable. Cela suggère que, quel que soit le type de régime, manger davantage d’aliments d’origine végétale et moins d’aliments d’origine animale, surtout s’ils sont hautement transformés, peut être bon pour la santé intestinale. Un autre aspect innovant de la recherche a été l’étude de la manière dont les bactéries se transmettent des aliments au microbiome. Les scientifiques ont découvert que les végétaliens avaient le moins de bactéries associées à l’alimentation dans leur microbiome, à l’exception de celles dérivées des fruits et légumes, qui étaient les plus présentes. Les végétariens et les omnivores, en revanche, présentaient un plus grand nombre de bactéries liées aux produits laitiers, notamment fermentés.

Conclusions. « Nous avons observé – souligne Nicola Segata – que la quantité et la diversité des aliments d'origine végétale ont un impact très positif sur le microbiome. Éviter la viande ou les produits laitiers n'a pas nécessairement un effet positif s'il ne s'accompagne pas d'une variété de produits de qualité. produits à base de plantes. Du point de vue du microbiome, ce que nous pouvons généralement recommander, c'est qu'il est important de manger de nombreux aliments à base de plantes, notamment ceux riches en fibres. La recherche fait partie d'un projet plus vaste qui vise à identifier les avantages d'un certain régime basé sur le microbiome spécifique de chaque personne ou groupe de personnes, notamment en termes de santé cardiométabolique : la nutrition dite de précision.