Dans une étude de trois ans, des chercheurs de Skoltech, de l’Institut Vavilov de génétique générale de la RAS, de la clinique de santé mentale n ° 1 de Moscou nommée d’après NA Alexeev et du Centre fédéral de recherche médicale de psychiatrie et de narcologie de Serbsky ont examiné comment les microbes intestinaux dans les patients atteints d’un trouble dépressif majeur sont différents de ceux des personnes mentalement saines. Après avoir analysé tous les gènes présents dans le microbiome intestinal, l’équipe a identifié une bactérie particulière – Faecalibacterium prausnitzii — responsable du plus grand écart fonctionnel entre les ensembles de données sains et déprimés. Les résultats, qui sont prometteurs pour les diagnostics express de santé mentale et les médicaments «psychobiotiques», sont rapportés dans Biomédicaments.
Si vous savez quels gènes sont plus ou moins représentés chez les patients dépressifs par rapport à la population saine, et quelles bactéries en sont responsables, vous pouvez tenter de faire deux choses. Tout d’abord, vous pouvez utiliser l’analyse du microbiote fécal comme outil complémentaire au diagnostic du trouble mental. Deuxièmement, vous pouvez essayer de développer des médicaments qui « normaliseraient » le microbiome intestinal chez les patients déprimés. »
Alexey Kovtun, auteur principal de l’étude, stagiaire en recherche biologique, Skoltech
Pour identifier les germes intestinaux « déprimants », les chercheurs ont effectué une analyse dite du métagénome complet. C’est-à-dire qu’ils ont récupéré et séquencé l’intégralité de l’ADN bactérien à partir des échantillons de matières fécales d’une cohorte de patients diagnostiqués avec le trouble dépressif majeur et d’une cohorte d’individus en bonne santé mentale. « Le résultat est que nous savons à la fois quels gènes et quelles espèces bactériennes sont présents dans le microbiome de chaque groupe, et à quel point ils sont représentés », a déclaré Kovtun.
L’étape suivante consiste à identifier l’ensemble de gènes qui varient considérablement entre les individus en bonne santé et ceux atteints de troubles mentaux et à zoomer sur ces gènes particuliers pour savoir lesquelles des bactéries qui les portent sont réellement surreprésentées ou sous-représentées dans le microbiome des patients déprimés. .
Une bactérie particulière s’est vraiment démarquée. On l’appelle Faecalibacterium prausnitzii, et il est significativement moins abondant dans l’intestin des patients atteints du trouble dépressif majeur. Nous l’avons lié à trois groupes de gènes fortement sous-représentés dans le métagénome du microbiome de ces patients.
Alexeï Kovtun
Le premier des trois ensembles de gènes notables est impliqué dans la production de l’hormone mélatonine, qui régule le cycle veille-sommeil. Le second est associé à la formation des neurotransmetteurs classiques glutamate et acide gamma-aminobutyrique. Le troisième est composé de plusieurs gènes responsables de la synthèse d’acides à chaîne courte, dont la déficience a été liée à la dépression.
Selon les auteurs de l’article, le microbe dont l’étude met en évidence le rôle – Faecalibacterium prausnitzii — attire de plus en plus l’attention des chercheurs dans le cadre du développement d’options thérapeutiques et d’approches diagnostiques de diverses maladies basées sur certaines souches bactériennes. La communauté professionnelle est enthousiasmée par cette bactérie.
Espérons qu’il pourrait s’avérer utile comme cible pour les kits de test express pour le diagnostic des troubles mentaux et les médicaments psychobiotiques favorisant le bien-être mental en harmonisant le microbiome du patient. Nous entendons beaucoup parler de prébiotiques et de probiotiques – eh bien, les psychobiotiques pourraient être la prochaine grande chose, et notre équipe fait partie de l’effort mondial pour en faire une réalité.
Alexeï Kovtun
L’étude rapportée dans cet article mettait en vedette des chercheurs de l’Institut Vavilov de génétique générale de la RAS, de l’Institut des sciences et technologies de Skolkovo, de l’Institut de physique et de technologie de Moscou, de la clinique de santé mentale n ° 1 nommée d’après NA Alexeev, du Centre fédéral de recherche médicale en psychiatrie de Serbsky. et Narcologie, Université d’État de production alimentaire de Moscou et Université Caspienne.
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