De nouvelles recherches menées par le King's College de Londres, en collaboration avec l'Université de Westminster, ont mis en lumière la diversité et les caractéristiques des E. coli souches responsables des infections du pied diabétique.
Publié dans Spectre de microbiologiela recherche fournit la première caractérisation génomique complète de E. coli souches isolées directement des ulcères du pied diabétique sur plusieurs continents. Les résultats pourraient aider à expliquer pourquoi certaines infections deviennent particulièrement difficiles à traiter et pourquoi elles peuvent entraîner des conséquences graves, parfois mortelles.
Les infections du pied diabétique restent l’une des complications les plus graves du diabète et l’une des principales causes d’amputation des membres inférieurs dans le monde. Bien que les cliniciens reconnaissent que ces infections chroniques des plaies sont souvent complexes, on sait peu de choses sur les agents pathogènes spécifiques impliqués, en particulier E. colimalgré sa détection fréquente dans des échantillons cliniques.
Les chercheurs ont analysé les séquences du génome entier de 42 E. coli souches isolées d'ulcères du pied diabétique infectés chez des patients du Nigeria, du Royaume-Uni, du Ghana, de la Suède, de la Malaisie, de la Chine, de la Corée du Sud, du Brésil, de l'Inde et des États-Unis. En séquençant l'ADN complet de chaque souche bactérienne, l'équipe a pu examiner les tendances globales de la biologie de E. coli associée à la maladie du pied diabétique. Cette approche a permis aux chercheurs de comparer les différences génétiques entre les souches, d’identifier les gènes liés à la résistance aux antibiotiques et d’identifier les facteurs contribuant à la gravité de la maladie.
L'analyse génomique a montré que le E. coli les souches étaient très diverses. Les bactéries appartenaient à de nombreux groupes génétiques différents et portaient un large éventail de gènes liés à la résistance aux antibiotiques et aux maladies. Cela démontre qu’il n’existe pas un seul type de E. coli responsables des infections du pied diabétique, et des lignées distinctes étaient capables de s'adapter indépendamment à l'environnement du pied diabétique.
En analysant les liens entre les souches et en identifiant les mécanismes de résistance et les traits de virulence (les caractéristiques ou les outils qui rendent un microbe plus nocif) qu'elles transportent, la recherche aide à expliquer pourquoi certaines infections du pied diabétique sont particulièrement difficiles à traiter ou peuvent évoluer rapidement vers une maladie grave.
Notamment, environ 8 pour cent des souches ont été classées comme multirésistantes ou extrêmement résistantes aux médicaments, ce qui signifie qu’elles sont résistantes à plusieurs ou à presque tous les antibiotiques disponibles.
Comprendre ces bactéries au niveau génomique est une étape cruciale vers l’amélioration du diagnostic et la possibilité de traitements plus ciblés pour les personnes atteintes de diabète. En identifiant lequel E. coli Les souches sont les plus courantes et aux antibiotiques auxquels elles sont susceptibles de résister, les cliniciens peuvent choisir des thérapies plus susceptibles de fonctionner, contribuant ainsi à réduire les infections prolongées, les hospitalisations et le risque d'amputation.
Dr Vincenzo Torraca, maître de conférences en maladies infectieuses au King's College de Londres et auteur principal de l'article
Victor Ajumobi, étudiant en deuxième année de doctorat au King's College de Londres et à l'Université de Westminster, et premier auteur de l'article, a ajouté : « Ces informations seront particulièrement précieuses dans les contextes à faibles ressources, où E. coli les infections des ulcères du pied diabétique sont plus courantes et où les outils de diagnostic rapide de la résistance aux antimicrobiens ne sont pas toujours facilement disponibles.
Les recherches futures se concentreront sur la compréhension de la manière dont les facteurs de virulence spécifiques identifiés dans l'étude contribuent à la progression de la maladie. De nombreux isolats portent des gènes qui permettent E. coli pour s'attacher aux tissus de l'hôte ou échapper au système immunitaire. Étudier la façon dont ces caractéristiques fonctionnent dans l'environnement du pied diabétique pourrait révéler de nouvelles cibles thérapeutiques et soutenir le développement de stratégies de traitement améliorées.
