L’ARN du SRAS-CoV-2 dans le sérum sanguin pourrait prédire la mortalité par COVID-19

Une équipe interdépartementale de l’hôpital Universitario La Princesa et de l’Universidad Autónoma de Madrid, en Espagne, a analysé le matériel génétique du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) – l’agent pathogène causal de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) – dans le sérum des patients positifs. Les résultats de l’équipe suggèrent que la détection de base de l’ARN du SRAS-CoV-2 dans le sang (CoVemia) est associée à de pires résultats chez les patients hospitalisés atteints de COVID-19.

Les résultats de l’étude récemment publiés sur le medRxiv * serveur de pré-impression.

Des observations exhaustives à travers le monde indiquent que le COVID-19 manifeste un tableau clinique hétérogène. Pour soulager les services de santé surchargés de travail partout et aider les patients à survivre, les chercheurs affirment qu’il est essentiel d’identifier les patients avec un mauvais pronostic dès le début. Les chercheurs suggèrent donc que la détection de l’ARN du SRAS-CoV-2 dans le sérum pourrait être un biomarqueur efficace pour prédire la mortalité par COVID-19.

Un mauvais pronostic peut être évalué comme une probabilité plus élevée de détérioration clinique, des niveaux plus élevés d’interleukine (IL) -6, IL-5 ou CXCL10, l’admission en unité de soins intensifs (USI), une maladie critique et la mort. Plusieurs biomarqueurs – faible numération lymphocytaire totale, taux sériques élevés de LDH, augmentation des réactifs de phase aiguë (protéine réactive C325, ferritine, fibrinogène, etc.) ou augmentation des taux sériques d’IL-6 – sont proposés dans ce contexte.

Dans cette étude, les chercheurs ont évalué la CoVemia avec la gravité du COVID-19 à l’aide de deux techniques différentes de réaction en chaîne par polymérase à transcription inverse en temps réel (rRT-PCR) et les ont comparées à d’autres biomarqueurs de gravité suggérés. Ils ont constaté que la CoVemia est associée aux décès liés au COVID-19 et ont présenté comment elle peut être utilisée pour prédire la mortalité chez les patients.

La cohorte de l’étude comprenait 193 patients admis pour COVID-19 à l’hôpital universitaire La Princesa (HUP) au cours des premières semaines de la première vague d’épidémie de COVID-19 en Espagne (4 mars au 17 avril 2020). Les échantillons ont été collectés à 48-72 heures d’admission par deux techniques de Roche et Thermo Fischer Scientific (TFS).

Les principales variables de résultat étaient la mortalité et la nécessité d’une admission aux soins intensifs pendant l’hospitalisation pour COVID-19. Seuls 14 patients sur les 89 admis en USI n’ont pas nécessité de ventilation mécanique invasive. Les chercheurs affirment avoir satisfait aux normes STROBE pour la recherche observationnelle.

Selon la technique utilisée dans l’étude – Roche et TFS – la CoVemia a été détectée chez 95 (48%; Roche) et 117 (59%; TFS) patients. Ils ont constaté que la corrélation entre le Ct (seuil de cycle) dans le sérum obtenu avec les deux techniques était très bonne. Ils ont également constaté que, à l’inverse, la corrélation du Ct entre les prélèvements nasopharyngés et de gorge (NPTS) et les échantillons de sérum était faible avec les techniques TFS ou Roche.

Cette étude confirme que les patients atteints de CoVémie détectable étaient plus âgés, avec un oxygène artériel plus mauvais, un nombre de lymphocytes inférieur et des taux sériques de LDH, d’IL-6, de protéine C-réactive et de procalcitonine plus élevés que les patients sans ARN viral dans leur sérum.

Les chercheurs ont ensuite analysé si un seuil de CoVemia (en Ct) pouvait aider à prédire la mortalité pendant l’hospitalisation. Le meilleur seuil pour prédire la mortalité était de 34 Ct pour Roche (sensibilité 91%, spécificité 38%) et 31 Ct pour TFS (sensibilité 93%, spécificité 32%).

Bien que la sensibilité de la technique TFS était légèrement meilleure pour la détection de l’ARN du SRAS-CoV-2 dans le sérum, les chercheurs ont observé que cette différence disparaissait lorsque les seuils de Ct spécifiques pour chaque kit étaient appliqués pour définir la CoVémie pertinente.

Pour valider davantage la CoVemia en tant que prédicteur de la mortalité dans le COVID-19, les chercheurs ont analysé son association avec des paramètres cliniques et de laboratoire liés à de pires résultats. Ils ont constaté qu’il était en corrélation avec plusieurs variables qui ont été proposées pour être associées à une mauvaise évolution du COVID-19, à savoir la vieillesse, la comorbidité, la qSOFA et la CURB-65, et avec des marqueurs tels que des taux sériques élevés d’IL-6 ou de LDH et sévères lymphopénie.

Les chercheurs ont constaté que les meilleurs prédicteurs incluaient toujours une «CoVémie pertinente» de base et des taux sériques élevés de LDH. Ils définissent la «CoVémie pertinente» comme la quantité de charge virale qui prédit mieux la mortalité avec une sensibilité de 95% et une spécificité de 35%.

Analyse complète de la CoVemia comme marqueur pronostique de la mortalité chez les patients hospitalisés pour COVID-19 sévère. Analyse de la courbe ROC pour la prédiction de la mortalité avec des valeurs Ct dans le sérum de tous les patients, selon Roche (A) et Thermo Fisher Scientific [TFS] (B) techniques. Proportion de patients décédés selon la CoVémie pertinente déterminée par les techniques Roche (C) et TFS (D). Analyse de survie avec l’estimateur de Kaplan-Meier des patients hospitalisés pour COVID-19 qui ont présenté (lignes pointillées) et des patients qui n’ont pas présenté (lignes pleines) une CoVémie pertinente selon les techniques Roche (E) et TFS (F).

Cette étude fournit le biomarqueur le plus utile dans un contexte clinique pour prédire la mortalité chez les patients COVID-19. La CoVemia pertinente fournit un rapport de risque trois fois plus élevé que celui de l’autre variable significative: un taux sérique de LDH élevé.

Les chercheurs mettent également en garde contre la nécessité d’une standardisation quantitative de la CoVémie pertinente. Ce que signifie CoVemia persistante, par exemple, doit être abordé et évalué dans d’autres études longitudinales.

Les résultats de cette étude renforcent les données précédentes avec une contribution principale à la prise en charge du COVID-19: nous avons déterminé un seuil semi-quantitatif pour la détection de l’ARN du SRAS-CoV-2 dans le sérum tôt après l’admission qui permet d’établir des valeurs d’ARN («CoVemia pertinent») associé à un risque de mortalité plus élevé. »

En résumé, les chercheurs pensent que leur étude présente des preuves que la détection de la CoVemia est le meilleur biomarqueur pour prédire la mort chez les patients COVID-19.

*Important Remarquer

medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique / le comportement lié à la santé ou être traités comme des informations établies.