Un récent rapport publié sur le medRxiv* Le serveur de préimpression a présenté l’épidémiologie des infections de la sous-lignée Omicron BA.2 du syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2 (SARS-CoV-2) à Hong Kong.
Sommaire
Arrière-plan
Suite à l’émergence de la souche originale du SRAS-CoV-2 au début de 2020, de nombreuses variantes préoccupantes du SRAS-CoV-2 ont entraîné de grandes épidémies et des décès importants. La variante SARS-CoV-2 Omicron détectée pour la première fois en Afrique du Sud et au Botswana fin novembre 2021 est la dernière variante SARS-CoV-2 à se propager à l’échelle internationale.
Au cours des deux premières années de la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), Hong Kong a enregistré 12 631 cas confirmés de SRAS-CoV-2 et 213 décès associés au SRAS-CoV-2. Au 31 décembre 2021, 70 % des citoyens de Hong Kong avaient reçu deux doses de vaccin contre le COVID-19. Pourtant, au début de 2022, Hong Kong a connu une grande vague de COVID-19, principalement provoquée par la variante SARS-CoV-2 Omicron BA.2.2, avec plus de 1,1 million d’infections par le SARS-CoV-2 signalées et plus de 7900 décès.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les scientifiques ont dressé le profil des caractéristiques épidémiologiques des infections par le SRAS-CoV-2 lors de la cinquième vague de la pandémie de COVID-19 (janvier à mars 2022) à Hong Kong.
Les auteurs ont estimé la période d’incubation de 80 personnes infectées par la variante Omicron du SRAS-CoV-2 avec apparition de symptômes connus et exposition au cours de la cinquième vague de COVID-19 à Hong Kong. L’équipe a évalué l’intervalle périodique de COVID-19 utilisant des détails de 43 infecteurs symptomatiques SARS-CoV-2 aux paires d’infectee. En outre, le temps de génération de la variante Omicron BA.1 a été calculé à l’aide d’ensembles de données provenant de 45 appariements infecteur-infecté avec un temps d’exposition à l’infection défini. De plus, les distributions d’intervalle de série et de temps de génération de la variante Omicron ont été évaluées à l’aide de la distribution de Weibull.
L’équipe a stratifié les cas de COVID-19 comme vaccinés avec les vaccins SARS-CoV-2 de la série primaire si les patients avaient reçu deux injections du vaccin inactivé CoronaVac ou de l’acide ribonucléique messager (ARNm) BNT162b2, avec une dose la plus récente environ deux semaines auparavant. Les chercheurs ont prédit que le risque de létalité (CFR) spécifique à l’âge sans l’achèvement de la série principale d’immunisation dans la cinquième vague de COVID-19 était similaire à ceux vérifiés dans la pandémie de SRAS-CoV-2 une à quatre vagues dans tous les cas. groupes d’âge après ajustement pour les résultats non résolus chez certaines personnes.
Résultats
Les résultats de l’étude ont démontré que la variante SARS-CoV-2 Omicron BA.2.2 s’est propagée rapidement avec un temps de doublement de 3,4 jours à Hong Kong, dépassant rapidement la capacité de test et de traçage, d’isolement et de quarantaine, entraînant un nombre important de COVID -19 patients nécessitant une hospitalisation avec des ressources limitées. Et ce, malgré de strictes mesures de santé publique et des précautions sociales. Le temps de génération et l’intervalle de série relativement plus courts de la sous-lignée Omicron BA.2 par rapport aux variantes précédentes du SRAS-CoV-2 et la transmissibilité inhérente améliorée ont conduit à la propagation virale rapide dans la population.
Les décès drastiques liés au COVID-19 à Hong Kong au cours de la cinquième vague pourraient être attribués à la propagation rapide de l’infection et à la faible couverture vaccinale chez les personnes âgées. Alors que la couverture vaccinale totale était de 70 % au début de la cinquième vague, seuls 50 % et 20 % des personnes âgées de ≥ 65 ans et ≥ 80 ans avaient terminé la principale série de vaccinations, respectivement. Jusqu’au 23 mars 2021, 92,5 % de tous les décès liés au SRAS-CoV-2 avec l’âge enregistrés sont survenus chez les personnes âgées de ≥ 65 ans et 70,8 % chez les personnes âgées de ≥ 80 ans.
Dans la première partie de la cinquième vague, les chercheurs ont découvert un risque de décès identique pour les patients COVID-19 non vaccinés par rapport aux vagues précédentes, ce qui implique que la gravité inhérente de BA.2 peut ne pas être significativement inférieure à la souche SARS-CoV-2 d’origine. De plus, les auteurs ont rapporté que l’infection par Omicron BA.2 chez les personnes âgées de 65 à 79 ans ou de plus de 80 ans avec un statut de primo-vaccination complet avait une probabilité de décès considérablement réduite.
Compte tenu du manque d’informations sur le type de variant du SRAS-CoV-2 pour tous les cas individuels et de la possibilité qu’un petit nombre de cas de COVID-19, y compris la mortalité due à des grappes d’infections SARS-CoV-2 Delta, aient été inclus dans le étude, les estimations actuelles du CFR peuvent légèrement surestimer le risque de décès d’Omicron à Hong Kong.
conclusion
Les résultats de l’étude ont suggéré que la souche SARS-CoV-2 Omicron BA.2.2 présentait un temps de génération, une période d’incubation et un intervalle de série plus courts que les autres variantes virales. À Hong Kong, les variantes d’Omicron, notamment la sous-lignée BA.2, se sont avérées avoir un potentiel de transmission supérieur. Les personnes dont le schéma de primo-vaccination était incomplet, lorsqu’elles étaient infectées par Omicron, présentaient un risque de mortalité équivalent à celles qui avaient été infectées par la souche ancestrale du SRAS-CoV-2 lors des précédentes vagues pandémiques de COVID-19.
Dans l’ensemble, les données actuelles ont souligné la nécessité d’une couverture vaccinale élevée contre le SRAS-CoV-2, en particulier chez les personnes âgées, et la nécessité de réévaluer les stratégies de santé publique et sociales dans la gestion de l’épidémie en réponse à une variante virale essentiellement transmissible à l’avenir.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
