Dans une étude récente publiée dans Maladies infectieuses émergentesles chercheurs ont développé une méthode innovante pour diagnostiquer les infections virales respiratoires (IVR) chez les enfants à l’aide de mouchoirs en papier jetés.
Sommaire
Fond
Les IVR sont fréquents chez les enfants de tous les groupes d’âge, ce qui nécessite leur détection précoce. Ils se manifestent généralement par des rhumes et une rhinorrhée sans fièvre mais une détresse respiratoire aiguë (ARD) dans les cas graves, entraînant la mort. Outre leurs effets cliniques, les IVR représentent une charge économique majeure pour les soins de santé. Cependant, le pire est que les médecins prescrivent trop souvent des antibiotiques pour le traitement des RVI, ils sont donc devenus une raison d’augmenter la résistance aux antimicrobiens.
Avec l’avènement du coronavirus respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2), il semble que certains virus respiratoires pourraient circuler toute l’année. Cependant, la plupart circulent davantage en hiver lorsque la température et les comportements favorisent leur dissémination. Dans l’ensemble, la recherche n’a pas entièrement révélé le schéma de circulation des virus respiratoires.
Cependant, les avancées dans le domaine de la biologie moléculaire ont permis leur détection précoce. Plusieurs tests commerciaux avec des approches automatisées détectent facilement les virus respiratoires courants. Cependant, il est toujours difficile d’identifier correctement les agents pathogènes dans les IVR. Si cela devenait faisable, cela aurait plusieurs avantages; cela pourrait aider les médecins à limiter l’utilisation d’antibiotiques et à prévenir la transmission à la communauté et les infections nosocomiales.
La plupart des patients considèrent que l’échantillonnage par écouvillonnage nasal est invasif, bien qu’il permette d’obtenir des résultats précis de manière plus fiable. La seule limitation est que les techniciens ne testent pas de manière approfondie ces échantillons pour tous les virus respiratoires courants. Un autre problème est que ces échantillons sont difficiles à prélever auprès des enfants. Blaschke et al. a d’abord proposé d’utiliser des mouchoirs en papier pour diagnostiquer les IVR chez les enfants ; leur méthode a atteint une sensibilité de 84 % (satisfaisant) ; cependant, l’aspiration nasale, un type d’échantillon plus sensible, est encore largement utilisée pour les diagnostics d’IVR chez les enfants.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont recueilli des tissus usagés de deux communautés (garderie et préscolaire) d’enfants une fois par semaine pendant un an (données regroupées) pour documenter les IVR dans différents contextes. Dans la première étude, ils ont prélevé tous les tissus de la garderie auprès de 40 enfants âgés de moins de 19 mois à quatre ans. L’école maternelle comptait 20 élèves dans chaque classe, âgés de trois à quatre ans.
Les chercheurs ont également collecté des échantillons de 30 volontaires présentant des symptômes pseudo-grippaux ou un RVI confirmé, évalués via un test standard d’échantillon d’écouvillon nasal, qui ont servi de témoins positifs. L’équipe a collecté des conteneurs remplis de mouchoirs usagés (utilisés uniquement pour se moucher) chaque semaine et les a comptés. Ils ont utilisé des kits commerciaux pour détecter les génomes viraux dans ces tissus.
Résultats de l’étude
Les chercheurs ont recueilli une grande quantité de données mises en commun de la garderie et de la maternelle. La collecte des tissus usagés était non invasive, de sorte que les professionnels ou les parents n’ont soulevé aucune inquiétude. Au contraire, ils attendaient les résultats hebdomadaires.
Bien qu’ils soient restés à proximité dans les centres préscolaires et les garderies, les enfants plus âgés et plus jeunes n’ont pas attrapé d’infections respiratoires causées par les mêmes virus. Premièrement, il a indiqué que l’immunité des enfants variait avec l’âge, tout comme leur sensibilité aux IVR. De plus, cela a montré que les garderies respectaient strictement les règles d’hygiène par rapport aux écoles maternelles. Pourtant, les données regroupées recueillies tout au long de l’année ont aidé les chercheurs à évaluer la prédisposition de ces enfants aux IVR.
Comme prévu, le rhinovirus a circulé de manière constante parmi les enfants toute l’année, montrant que les enfants avaient une faible immunité contre ce virus, mais il a provoqué des symptômes relativement bénins chez les jeunes enfants. Au contraire, les chercheurs ont détecté le virus parainfluenza 3 en automne chez les enfants des deux communautés, ce qui concorde avec les découvertes de Horemheb-Rubio et al. La rentrée scolaire marque le premier rassemblement d’enfants. À partir de ce moment et même après les vacances de mars, les chercheurs ont détecté une activité du virus parainfluenza 3 de manière constante dans des échantillons de tissus utilisés pendant plusieurs semaines.
Fait intéressant, les chercheurs ont également détecté le cytomégalovirus (CMV) dans la garderie. Sa détection dans du matériel regroupé indiquait soit qu’il circulait perpétuellement parmi les enfants, soit qu’un ou quelques nourrissons infectés par le CMV avant ou à la naissance excrétaient continuellement le virus. L’équipe n’a pas effectué d’analyses individuelles pour des raisons éthiques, car même un enfant infecté par le CMV aurait entraîné une discrimination à son encontre ou son expulsion.
conclusion
Auparavant, la propagation du ou des virus en culture cellulaire était la référence pour le diagnostic. Les progrès récents ont rendu possible la détection moléculaire des génomes viraux, comme le démontre cette étude. Cependant, les informations obtenues par chaque méthode sont différentes. Ainsi, bien que les méthodes d’amplification des acides nucléiques soient globalement plus sensibles, elles ne donnent aucun aperçu de la viabilité ou de l’éventuelle infectiosité du virus détecté. Pourtant, les génomes viraux détectés dans des échantillons de tissus utilisés fournissent des informations utiles.
Ils fournissent une méthode de détection précoce de tout virus transmis par les voies respiratoires et interviennent pour empêcher sa transmission ultérieure. Les athlètes testés à plusieurs reprises lors d’événements pourraient également bénéficier de cette stratégie. Plus important encore, cette méthode aide le diagnostic RVI à distance. Quelqu’un pourrait envoyer un échantillon de tissu utilisé par courrier et connaître la propagation potentielle d’une infection dans une population.
De plus, les données de l’étude pourraient aider à prédire l’émergence de virus saisonniers hivernaux (par exemple, le virus de la grippe) car ceux-ci se propagent efficacement chez les jeunes enfants. La détection précoce donne le temps de mettre en garde les parents qui peuvent masquer leurs enfants pour les protéger de l’infection. Comme prévu, les chercheurs ont détecté la première collecte de tissus usagés positifs pour la grippe dans la garderie, six semaines avant le pic saisonnier.
Bien qu’il ne s’agisse maintenant que d’un travail de preuve de concept, selon les auteurs, l’accumulation de plus de données pourrait aider à intensifier l’utilisation de cette nouvelle méthode à plus grande échelle.
