La volaille est responsable de plus d’un cas sur cinq d’infection à la salmonelle aux États-Unis. Mais les méthodes traditionnelles de test du poulet que vous prenez sur l’étagère de l’épicerie peuvent ne pas être suffisantes pour détecter toutes les souches de bactéries, selon une nouvelle étude de l’Université. de Géorgie.
Publié dans Microbiologie appliquée et environnementalel’étude a analysé les données nationales sur les salmonelles du Service d’inspection de la sécurité alimentaire du Département américain de l’agriculture de 2016 à 2020.
Les chercheurs ont constaté que les cas globaux de contamination par la salmonelle dans le poulet étaient passés de 9 % en 2016 à 6,57 % en 2020. Mais à l’échelle nationale, les cas d’infection à la salmonelle chez l’homme sont restés stables au cours de cette même période.
Lorsque j’ai commencé à travailler au Poultry Diagnostic and Research Centre il y a quatre ans et que j’ai rencontré plusieurs entreprises avicoles différentes, l’une des choses qu’ils m’ont dit était que la salmonelle qu’ils trouvent dans les fermes n’est pas le même type de salmonelle qu’ils trouvent dans le usine de transformation. »
Nikki Shariat, auteur correspondant de l’étude et professeur adjoint au Collège de médecine vétérinaire
Cette déconnexion rend difficile pour l’industrie avicole de savoir quels types de salmonelles cibler avec de nouveaux vaccins et d’autres interventions qui peuvent réduire la quantité de types de salmonelles à haut risque chez les oiseaux.
Les chercheurs se sont associés au Georgia Poultry Lab Network à Gainesville, en Géorgie, pour examiner quelles souches de salmonelle, appelées sérotypes, étaient présentes chez les poulets reproducteurs par rapport aux souches présentes dans les produits à base de poulet.
Les technologies à haute résolution peuvent éclairer un contrôle efficace des salmonelles
La souche de bactérie la plus abondante et la plus facilement détectable à la ferme en Géorgie est le sérotype Kentucky, représentant 80 % de toutes les salmonelles trouvées.
Bien qu’aucune salmonelle ne soit « bonne », le Kentucky n’est pas couramment associé à une maladie humaine. Et les entreprises avicoles semblent être en mesure d’éliminer le Kentucky plus efficacement pendant la transformation, ce qui peut être l’une des raisons pour lesquelles les chercheurs n’ont pas vu la même quantité de souche dans le poulet transformé.
Ce qu’ils ont vu dans les échantillons des usines de transformation étaient trois autres types de salmonelles, dont certaines sont connues pour causer des maladies chez les humains : Infantis, Enteritidis et Schwarzengrund.
« La question était: » D’où viennent ces sérotypes non Kentucky? « », A déclaré Shariat. « Nous soupçonnions qu’ils étaient présents sur la ferme mais que nous n’étions pas en mesure de les détecter en utilisant la méthodologie traditionnelle. »
À l’aide de la technologie développée par Shariat en 2015, son équipe a trouvé plusieurs souches de salmonelles dans les échantillons d’oiseaux vivants que les méthodes traditionnelles n’avaient pas détectées.
Connue sous le nom de CRISPR-SeroSeq, la technologie identifie les signatures moléculaires dans les régions CRISPR de la salmonelle, une partie spécialisée de l’ADN de la bactérie, et aide les chercheurs à identifier les souches de bactéries les plus abondantes.
« Au cours des dernières années, l’industrie de la volaille a fait de grands progrès dans la réduction de la salmonelle dans ses installations de transformation », a déclaré Shariat. « Il n’y a pas de solution miracle qui puisse éliminer la salmonelle dans l’usine de transformation ou pendant la pré-récolte chez les oiseaux. »
Les vétérinaires avicoles vaccinent les oiseaux contre les types de salmonelle les plus souvent associés aux épidémies humaines. Mais pour le faire efficacement, les vétérinaires doivent savoir quels types de bactéries se trouvent dans les oiseaux de la ferme.
« La technologie à plus haute résolution utilisée dans cette recherche a révélé que plusieurs sérotypes de salmonelle étaient présents mais étaient généralement plus nombreux que le sérotype Kentucky », a déclaré Shariat. « Notre étude fournit maintenant un cadre sur la façon d’identifier ces sérotypes. Cette connaissance fournit aux producteurs de volaille de meilleures données pour pouvoir éclairer leurs pratiques de contrôle de la salmonelle. »
« Notre objectif principal est de nous assurer qu’en fin de compte, nous facilitons les améliorations dans l’industrie de la volaille », a déclaré Amy Siceloff, première auteure de l’étude et doctorante au département de microbiologie de l’UGA. « Maintenant que nous sommes conscients de cette augmentation progressive des sérotypes et qu’ils n’apparaissent pas du jour au lendemain, ce type de surveillance va être essentiel pour gérer la salmonelle à l’avenir. »
L’étude a été financée par un prix USDA-NIFA à Shariat. Doug Waltman du Georgia Poultry Laboratory Network est co-auteur de cette étude.
