Une étude récente publiée sur bioRxiv* Le serveur de préimpression a décrit la capacité d’évasion des anticorps des sous-lignées Omicron prévalentes du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2).
Sommaire
Contexte
La thérapie et la protection contre la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) sont basées sur des anticorps qui neutralisent le SRAS-CoV-2. En conséquence, les variantes du SRAS-CoV-2 présentant une évasion des anticorps mettent en péril les approches préventives et thérapeutiques vitales du COVID-19.
La sensibilité à la neutralisation de la sous-lignée SARS-CoV-2 Omicron BA.1 suite au COVID-19 ou à sa vaccination est faible en raison du nombre important de mutations dans la protéine de pointe (S) de la variante Omicron préoccupante (VOC). Par conséquent, les infections à Omicron entraînent une diminution de l’efficacité de la vaccination et un taux de réinfection supérieur à celui des autres variantes du SRAS-CoV-2.
Notamment, les sous-lignées Omicron nouvellement apparues, à savoir BA.2 et BA.1.1, sont rapidement devenues les variantes prédominantes du SARS-CoV-2 en circulation.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les scientifiques ont déterminé l’activité sérique polyclonale contre les sous-lignées SARS-CoV-2 Omicron BA.2, BA.1 et BA.1.1 chez 50 personnes vaccinées ou convalescentes contre le COVID-19. Les auteurs ont également délimité les sensibilités des anticorps des variants du SRAS-CoV-2 à un niveau monoclonal en utilisant 163 anticorps.
Tous les volontaires de l’étude ont soumis un consentement éclairé écrit avant l’inscription. Au total, 20 échantillons de sérum de patients récupérés du COVID-19 ont été achetés à l’hôpital universitaire de Cologne entre avril et mai 2020.
Les personnes ayant des antécédents de COVID-19 confirmé par réaction en chaîne par polymérase (PCR) ont été recrutées pour la présente recherche dans les huit semaines suivant le diagnostic du SRAS-CoV-2 ou l’apparition des symptômes et ont été suivies longitudinalement pour évaluer l’immunité durable contre le virus. Les individus étaient probablement infectés par les souches ancestrales de type SARS-CoV-2 Wu01.
De plus, 30 échantillons de sérum de travailleurs de la santé vaccinés contre le SRAS-CoV-2 ont été prélevés. Le personnel de santé vacciné contre le COVID-19 à la Charité – Universitätsmedizin de Berlin, en Allemagne, a été inclus dans cette étude, quel que soit son état de santé.
Tous les échantillons de sérum ont été criblés pour les anticorps dirigés contre la protéine de la nucléocapside (N) du SRAS-CoV-2 à l’aide du dosage immunologique SeraSpot basé sur le microréseau d’immunoglobulines G (IgG) anti-SARS-CoV-2.
La cohorte de vaccination n’incluait pas d’échantillons de personnes ayant déjà été infectées par le SRAS-CoV-2, un test d’amplification d’acide nucléique positif pour le SRAS-CoV-2 ou des anticorps anti-N détectables. De plus, les groupes d’infection et de vaccination ont été vaccinés avec le vaccin COVID-19 à acide ribonucléique messager (ARNm) BNT162b2 après une médiane de neuf et 14 mois après deux doses de BNT162b2 et une infection par le SRAS-CoV-2, respectivement.
Les échantillons de sérum ont été obtenus après centrifugation et conservés à -80°C jusqu’à l’analyse. La capacité de neutralisation des échantillons de sérum contre les trois sous-lignées Omicron a été analysée à l’aide d’expériences de pseudovirus à base de lentivirus. La souche ancestrale SARS-CoV-2 Wu01 a été utilisée comme référence.
Résultats et discussions
Les résultats de l’étude ont illustré que les personnes récupérées du SRAS-CoV-2 avaient un âge médian de 51 ans et avaient une COVID-19 asymptomatique ou légère. Tous les échantillons de sérum provenant de convalescents COVID-19 après une médiane de 48 jours ont démontré une neutralisation à 100 % de la souche SARS-CoV-2 Wu01. Au contraire, l’activité sérique contre les trois sous-lignées Omicron était sensiblement faible à seulement 50 %, 0 % et 15 % pour les sous-lignées BA.2, BA.1.1 et BA.1, respectivement. Néanmoins, la vaccination de rappel COVID-19 à une médiane de 33 jours chez tous les patients récupérés du SRAS-CoV-2 a augmenté l’activité neutralisante d’Omicron.
Dans la cohorte de vaccination, la capacité de neutralisation des sous-lignées Wu01 et Omicron a été détectée chez les 30 sujets et 43 à 73 % des sujets, respectivement, à une médiane de 28 jours après la vaccination en deux doses. En outre, après une médiane de 29 jours après le rappel, les échantillons ont présenté une activité sérologique multipliée par huit contre la souche Wu01 et une activité neutralisante significativement élevée contre Omicron.
Notamment, la plupart des anticorps neutralisant Wu01 ont perdu leur activité contre les sous-lignées Omicron. Alors que la majorité des anticorps neutralisant BA.1 étaient également actifs contre BA.2 et BA.1.1, tels que R568-1G9 et R207-2F11, un sous-groupe d’anticorps avec une activité neutralisant Omicron spécifique à BA.2 implique des distinctions d’antigénicité de sous-lignée .
De plus, la plus grande incidence des anticorps neutralisants BA.2 par rapport aux anticorps neutralisants BA.1 parmi les anticorps analysés indique que la protéine BA.2 S a moins de caractéristiques liées à la résistance.
La majorité des 18 anticorps monoclonaux (mAbs) évalués en cours de développement ou en utilisation clinique ont neutralisé la souche SARS-COV-2 Wu01. Cependant, un effet moins puissant contre Wu01 a été observé avec le sotrovimab. D’autre part, la plupart des mAb en utilisation clinique ou en cours de développement étaient résistants aux sous-lignées Omicron BA.2, BA.1.1 et BA.1 prédominantes. Cependant, la sensibilité d’Omicron à ces anticorps peut varier considérablement au niveau de la sous-lignée.
Par exemple, alors que le mAb DZIF-10c neutralisait la sous-lignée Omicron BA.1, il n’était pas actif contre la sous-lignée BA.1.1. Le cilgavimab avait une activité neutralisante significative contre BA.2 comparable aux niveaux de neutralisation de Wu01 et était > 800 fois supérieure à BA.1.1 et BA.1. De tous les mAb analysés, le bebtélovimab a montré une capacité de neutralisation robuste contre les trois sous-lignées Omicron. Ainsi, l’identification de la sous-lignée ou l’épidémiologie doit être prise en compte lors du choix des mAb pour le traitement ou la prophylaxie des infections à Omicron.
conclusion
Les résultats de l’étude ont révélé une baisse considérable mais similaire de l’immunité sérologique des vaccinés contre le SRAS-CoV-2 ou des individus infectés par le virus contre les trois sous-lignées Omicron, qui ont notamment augmenté après la vaccination de rappel COVID-19. Néanmoins, des écarts significatifs de sensibilité à différents anticorps par les sous-lignées Omicron BA.2 et BA.1 révèlent leurs schémas d’échappement uniques qui ont un impact sur l’utilisation clinique des anticorps. Les résultats de la présente étude ont des implications importantes pour les approches de vaccination contre le SRAS-CoV-2 et les anticorps utilisés dans la thérapie et la prévention du COVID-19.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
