Une analyse génomique de plus de 1 200 personnes de toute l'Afrique du Sud révèle comment les peuples européens de l'ère coloniale et autochtones Khoe-san, et les esclaves ont contribué au bassin de gènes moderne en Afrique du Sud. Publication le 23 septembre dans le Cell Press Journal The American Journal of Human Geneticsl'étude a révélé que les gènes hérités des Européens coloniaux et des esclaves sont les plus courants au Cap et deviennent moins fréquents avec la distance de l'épicentre de la colonie. Les résultats montrent également que les ancêtres européens étaient plus susceptibles d'être des hommes, tandis que les ancêtres autochtones de Khoe-san étaient plus susceptibles d'être des femmes.
« Ces données génétiques montrent l'impact direct du colonialisme européen sur la structure de la population en Afrique australe », explique le premier auteur Austin Reynolds, généticien humain chez Unt Health Fort Worth. « Les modèles que nous avons trouvés sont plus similaires à ce que nous voyons au Mexique et en Amérique du Sud, où les communautés autochtones étaient diversement incorporées dans le mode de vie colonial, par rapport aux États-Unis, où il y avait moins d'incorporation de communautés autochtones. »
En 1652, la Néerlandais India Company (COV) a ouvert une petite station commerciale dans ce qui est maintenant le Cap, et les colonisateurs européens ont continué à s'installer dans la région pendant les 250 prochaines années. Entre 1652 et 1808, le COV a esclavé environ 63 000 personnes d'Afrique équatoriale, d'Asie du Sud et du Sud-Est et de Madagascar et les a amenés dans la région. Le COV a également embauché des ouvriers des communautés locales autochtones Khoe-san. Les interactions sexuelles entre ces groupes – qui étaient parfois violentes, les auteurs notent dans les communautés de personnes atteintes d'anciennes.
« Nous avons des registres historiques des noms des hommes et des femmes qui ont été amenés au Cap, mais nous ne savons pas toujours qui a survécu, ou qui a été autorisé à se reproduire, c'est pourquoi la génétique est si puissante ici », a déclaré l'auteur principal Brenna Henn, anthropologue à l'Université de Californie à Davis.
Pour comprendre comment les colonisateurs européens, les peuples autochtones et les esclaves ont contribué aux génomes des Sud-Africains modernes, les chercheurs ont analysé les génomes de plus de 1 200 individus contemporains de différentes régions en Afrique du Sud, s'étendant du sud du Cap à l'Afrique du Sud de Nama et de l'Afrique du sud de Khomani. Plus de 90% des participants de l'étude s'identifient comme «colorés», une catégorie raciale institutionnalisée de l'apartheid.
« Nous avons essayé de capturer la composante temporelle et géographique de la période coloniale en échantillonnant de la pointe du Cap à la frontière même avec le Botswana et la Namibie », explique Henn.
En comparant ces génomes à ceux des ensembles de données accessibles au public, les chercheurs ont pu estimer la quantité d'ascendance de chaque personne dérivée des différentes lignées. Ils ont également étudié si les hommes et les femmes de lignées différentes étaient plus ou moins susceptibles de quitter les descendants en comparant des gènes sur les chromosomes X et Y de chaque personne à leurs chromosomes non sexistes.
Dans toutes les régions géographiques, il y avait un biais sexuel masculin pour l'ascendance européenne, ce qui signifie que les séquences génétiques européennes étaient principalement héritées des ancêtres masculins. En revanche, il y avait un biais féminin pour l'ascendance de Khoe-san, indiquant que les ancêtres de ces lignées étaient plus souvent des femmes. Les personnes réduites en esclavage d'Afrique équatoriale et d'Asie du Sud et du Sud-Est ont également contribué au pool génétique, mais il n'y avait pas de biais sexuel pour ces lignées.
Les gènes européens et asiatiques étaient moins fréquents plus fréquents du Cap, et les chercheurs ont estimé que ces gènes sont arrivés le plus tôt au Cap et plus tard dans les communautés qui sont les plus éloignées du Cap.
« Cela correspond au record historique, où le Cap était le Colonial Center, et les gens ont déménagé lentement au cours des centaines d'années et ont installé des maisons ou se sont incorporés dans les communautés d'une manière ou d'une autre », explique Reynolds.
Pour le NAMA et ≠ Khomani San, les chercheurs ont estimé qu'il y avait un seul afflux d'ascendance européenne dans chaque population environ 7 à 8 générations ou 210 à 240 ans. Des gènes de personnes esclaves étaient également présents dans ces communautés autochtones. Notamment, les chercheurs ont constaté que 15% de tous les chromosomes Y dans les segments génétiques NAMA portent des lignées asiatiques, mais ces mêmes séquences n'étaient pas présentes dans le ≠ khomani SAN.
« Ces hommes ont été amenés au Cap, et ils ont réussi à être libérés ou à s'échapper jusqu'au nord, c'est à 12 heures de route du Cap vers ces communautés maintenant, donc c'est une distance assez longue », explique Henn. « Et puis ils ont réussi à se constituer dans ces communautés, et aujourd'hui leurs descendants masculins parlent et pratiquent la culture de Nama. »
À l'avenir, les chercheurs prévoient de faire une analyse génomique plus à grande échelle de l'origine exactement en Asie et en Afrique équatoriale.
« Je suis également très intéressé à retracer certaines de ces lignées chromosomiques Y qui ont réussi de réussir dans un domaine par rapport à un autre domaine, par exemple pour voir s'ils sont liés à des noms de famille particuliers », explique Henn.
Cette recherche a été soutenue par le financement du South African Medical Research Council, de la South African National Research Foundation et des National Institutes of Health.
