Les chercheurs révèlent comment les traitements antibiotiques chez les nouveau-nés prématurés peuvent déclencher des changements durables dans le microbiome intestinal, augmentant le risque d'infections dangereuses et de séjours à l'hôpital plus longs.
Étude: Associations entre l'intensité de l'exposition aux antibiotiques, les perturbations du microbiome intestinal et les résultats chez les nouveau-nés prématurés atteints de bactériémie. Crédit d'image: Iryna Inshyna / Shutterstock.com
Les infections chez les nouveau-nés s'accompagnent souvent de perturbations du microbiome intestinal. Une étude publiée dans le Journal of Perinatology analysé les associations de l'exposition aux antibiotiques avec la bactériémie chez les nouveau-nés et le rôle de la dysbiose intestinale induite par les antibiotiques.
Sommaire
Introduction
Les bébés nés trop tôt ou avec un poids de naissance trop faible sont susceptibles de développer des infections comme l'entérocolite nécrosante (NEC), la septicémie et la méningite. En tant que tels, de nombreux nourrissons reçoivent des antibiotiques préventifs ou thérapeutiques de la naissance pendant quelques jours, voire des mois.
De longues périodes de traitement se produisent lorsque les bébés ont des infections récurrentes nécessitant un traitement antibiotique prolongé ou répété pendant la période du nouveau-né. Malgré l'effet vital des antibiotiques dans les infections bactériennes graves, elles perturbent également gravement le développement normal du microbiome intestinal.
Une étude a révélé que lorsque les mères ont été exposées à des antibiotiques pendant l'accouchement, elles étaient relativement non affectées par rapport à leurs nourrissons, suggérant que le microbiome intestinal non développé rend les nourrissons plus vulnérables.
En tant que tel, une exposition plus élevée aux antibiotiques est associée à un risque plus élevé de dysbiose intestinale du nourrisson et à une prévalence accrue d'agents pathogènes spécifiques dans l'intestin. Ceci, à son tour, est lié à la NEC, à la perforation intestinale spontanée (SIP) et à la septicémie néonatale tardive. La présente étude se concentre sur la bactériémie, le NEC / SIP et les infections récurrentes.
Nombre plus élevé de Enterococcus Les espèces du microbiome intestinal peuvent entraîner une inflammation, dont l'effet varie selon le choix des antibiotiques. Les scores d'intensité de l'exposition aux antibiotiques comme l'indice du spectre antibiotique (ASI) peuvent mieux évaluer les protocoles d'antibiotiques chez les nourrissons de l'unité de soins intensifs néonatals (USI) que d'autres mesures comme le nombre de jours de traitement.
La présente étude visait à identifier une relation potentielle de cause à effet entre l'exposition aux antibiotiques, la dysbiose intestinale et les maladies du nouveau-né. Les chercheurs ont apparié les cas et les contrôles par âge gestationnel et postnatal. Bien que cela contribue à tenir partiellement des facteurs de confusion tels que les protocoles d'alimentation et le stade de développement, ils ne pouvaient pas contrôler indépendamment le régime alimentaire ou la nutrition en raison des changements fréquents pendant la maladie
À propos de l'étude
L'étude comprenait des nourrissons prématurés pesant 2000 g ou moins à la naissance, aucun de plus de deux mois au départ. L'analyse comprenait 398 échantillons de selles de 40 nouveau-nés bactériques et 39 témoins.
Des échantillons de selles ont été prélevés sur un an, environ cinq par nourrisson, assortissant des nouveau-nés avec une bactériémie à des témoins non infectés. Le séquençage du métagénome entier a été effectué sur des selles, et l'intensité de l'exposition aux antibiotiques a été comparée à l'aide de l'ASI.
Résultats de l'étude
Environ 70% des nourrissons dont les hémocultures étaient positifs pour les bactéries ont été infectés. Les agents pathogènes communs étaient la coagulase négative Staphylococcus (Cons), Klebsiella, Staphylococcus aureus, Escherichia coliet Enterococcus espèces.
Les bébés bactériques ont eu des séjours plus longs dans l'USIN que les témoins. Dans six des 15 cas de NEC, le diagnostic s'est produit dans les 48 heures avant le début de la bactériémie.
L'ampicilline et la gentamicine étaient les antibiotiques les plus utilisés pour prévenir la septicémie (EOS) à début précoce. La vancomycine et le céfepime ont été utilisés presque deux fois plus souvent parmi les cas que les témoins.
Parmi les nourrissons bactériques, le nombre d'espèces différentes (diversité α) dans la communauté du microbiote intestinal a été réduite à quatre semaines de vie. Cela a été plus prononcé parmi ceux avec NEC.
Cette différence a persisté jusqu'à 20 semaines après la naissance chez les bébés avec des infections respiratoires et urinaires récurrentes. Les bébés qui se sont rétablis sans infections ultérieures ont développé un microbiome qui est revenu à une diversité saine.
L'ASI était plus élevé chez les nourrissons bactériques tout au long de la période postnatale. Ces bébés ont montré un plus grand nombre de Enterococcus espèces (> 25% dans les échantillons de selles regroupés) mais une abondance inférieure d'anaérobies (<25%) par rapport aux témoins à 13-16 semaines. La réduction de l'abondance des anaérobies est un marqueur de la mauvaise maturation du microbiome intestinal, car ce groupe comprend plusieurs commensaux.
Parmi les bébés bactériémiques, ceux atteints de NEC ont montré des niveaux plus élevés de Enterococcus espèces à l'âge de 12 semaines par rapport à celles sans NEC. Enterococcus Les niveaux chez les nourrissons bactériques ont augmenté et sont restés élevés entre les semaines huit et 16. Chez les bébés non infectés, ces niveaux n'ont augmenté que de quatre semaines. Bébés avec plus haut Enterococcus L'abondance était également plus susceptible de subir des infections répétées.
Cela suggère que la bactériémie était associée à une maturation intestinale retardée et a prédit des chances plus élevées d'infections répétées, bien que la causalité ne puisse pas être confirmée. Il s'agit d'une constatation importante qui pourrait façonner la gestion dans ce groupe à haut risque.
Conclusions
Les nourrissons prématurés atteints de bactériémie ont trouvé la construction d'un microbiome intestinal normal difficile malgré une composition comparable entre la naissance et quatre semaines. Cet effet était plus notable si le bébé avait également NEC ou SIP.
Les nourrissons bactériémiques avaient une diversité α plus faible dans leur microbiote intestinal, ce qui était encore plus prononcé chez ceux avec NEC ou SIP. Ils avaient plus Enterococcus Abondance des espèces mais moins d'anaérobies, signalant une dysbiose.
Ces nourrissons étaient plus susceptibles d'avoir des infections répétées associées à une mauvaise composition du microbiome intestinal. Des résultats similaires dans la maladie du greffon contre l'hôte après des greffes de cellules souches pour les troubles de la moelle osseuse ont conduit à un changement dans les schémas d'utilisation des antibiotiques.
« À mesure que les signatures de la dysbiose du microbiome intestinal chez les nouveau-nés émergent, une approche proactive similaire pourrait être adoptée dans l'USIN où les prescripteurs considèrent plus fortement l'impact du microbiome de différents choix antibiotiques. «
L'utilisation de l'ASI a assuré la quantification objective de l'exposition aux antibiotiques et une meilleure comparaison des réponses du microbiome entre les cas et les témoins. Cela a démontré que les différences dans la diversité des microbiomes sont restées au fil du temps, même après avoir pris en compte une utilisation récente d'antibiotiques, ce qui suggère que l'exposition cumulée aux antibiotiques a un impact durable.
Cette étude observationnelle provenait d'un seul centre. Il n'a pas pu attribuer des effets à des antibiotiques spécifiques ou exclure l'influence d'autres facteurs tels que l'alimentation, l'inflammation ou l'instabilité clinique. En conséquence, les résultats peuvent ne pas être généralisables à toutes les populations de l'USIN.
Les études futures devraient évaluer les effets potentiels d'accumulation et à long terme de l'exposition répétée aux antibiotiques, en particulier avec des antibiotiques à large spectre. Ils devraient également examiner d'autres facteurs tels que l'inflammation, l'infection et le régime alimentaire pour leur impact sur le risque de dysbiose infantile.
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