PacBio (NASDAQ : PACB), l’un des principaux développeurs de solutions de séquençage de haute qualité et très précises, a annoncé aujourd’hui avoir commencé à prendre des commandes pour ses kits révolutionnaires Kinnex RNA, qui augmentent le débit pour l’ARN complet, l’ARN unicellulaire et le 16S. Séquençage d’ARNr sur les systèmes de séquençage à lecture longue de PacBio pour permettre des études à grande échelle à une résolution difficile à atteindre avec le séquençage d’ARN à lecture courte.
« La nouvelle famille de kits Kinnex pour le séquençage d’ARN est conçue pour fournir aux clients des solutions de bout en bout rentables pour soutenir leurs recherches », a déclaré Christian Henry, président et chef de la direction de PacBio. « Le système Revio a apporté une grande ampleur au séquençage HiFi du génome entier. Nos clients ont demandé la même chose pour le séquençage de l’ARN, et ces kits Kinnex offrent exactement cela avec des dizaines de millions de lectures complètes par analyse. Cela change la donne pour le marché du séquençage d’ARN.
Les kits Kinnex sont basés sur la méthode MAS-Seq, qui concatène des fragments d’ADN plus petits en bibliothèques plus longues et prêtes pour la HiFi. Le séquençage à lecture courte a du mal à couvrir des transcriptions entières, tandis que le séquençage à lecture longue d’une transcription entraînerait traditionnellement une capacité de séquençage inutilisée. Avec Kinnex, les clients peuvent concaténer des transcriptions dans de longues bibliothèques pour le séquençage HiFi, augmentant ainsi le débit et rendant le séquençage d’ARN à lecture longue plus rentable.
Le nouveau kit d’ARN unicellulaire Kinnex s’appuie sur le kit MAS-Seq for Single Cell 3′ existant, ajoutant une prise en charge supplémentaire du kit 10x Genomics 5′ et du multiplexage de bibliothèques.
Le kit d’ARN complet Kinnex offre un séquençage d’ARN complet avec des informations abondantes et un multiplexage flexible des échantillons. Le kit peut générer 40 millions de lectures sur le
Système Revio par cellule SMRT de 25 M et 15 millions de lectures sur les systèmes Sequel II et IIe par cellule SMRT de 8 M. De plus, le flux de travail de bout en bout comprend l’accès au logiciel SMRT Link de PacBio pour l’analyse complète des données d’ARN et d’isoformes.
« Les kits Kinnex nous permettent désormais de générer des données de transcriptome HiFi à lecture longue à un débit beaucoup plus élevé que son prédécesseur Iso-Seq et de le faire au niveau d’une seule cellule. Cela va être très utile pour annoter plus précisément les régions géniques par rapport aux lectures courtes dans nos assemblages génomiques et pour mesurer leurs niveaux d’expression à la résolution unicellulaire », a déclaré Erich Jarvis, président du projet sur les génomes des vertébrés et directeur du laboratoire de génome des vertébrés. .
Enfin, le kit Kinnex 16S rRNA permet un séquençage du microbiome avec une résolution extraordinaire et une qualité supérieure à n’importe quelle échelle. Le kit produira 60 millions de lectures sur le système Revio par cellule SMRT de 25 M et 25 millions de lectures sur les systèmes Sequel II et IIe par cellule SMRT de 8 M. Avec une recommandation de 384 plex par bibliothèque, ce nouveau kit permettra le séquençage complet de l’ARNr 16S à un coût par échantillon compétitif par rapport au séquençage standard actuel à lecture courte.
« Nous sommes ravis de pouvoir réaliser de réelles avancées dans les études sur le microbiome et la recherche translationnelle pour nos clients avec le kit Kinnex 16S rRNA », a déclaré le Dr Shuiquan Tang, directeur du microbiome chez Zymo Research. « Avoir la capacité d’effectuer un séquençage 16S complet sur les systèmes PacBio nous permet de fournir à nos clients des données taxonomiques de plus haute résolution au niveau des espèces à un prix compétitif par rapport au séquençage à lecture courte. »
Avec les offres de kits Kinnex, Revio offrira aux clients la possibilité de séquencer jusqu’à 5 200 échantillons d’ARN par an pour moins de 500 $ US par échantillon – soit un débit 16 fois supérieur au nombre d’échantillons par rapport à ce qui était auparavant disponible pour les utilisateurs de PacBio RNA sur les systèmes Sequel II et IIe. Les trois kits Kinnex se vendent 5 700 USD chacun pour 12 réactions.
PacBio accepte désormais les commandes pour chaque kit et commencera les expéditions en décembre 2023.