Des chercheurs aux États-Unis ont publié une étude dans la revue Pathogènes PLOS qui a examiné l’excrétion des virions du coronavirus infectieux du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) malgré la vaccination contre celui-ci.
Étude : Excrétion du SRAS-CoV-2 infectieux malgré la vaccination. Crédit d’image : MrSquid/Shutterstock
Sommaire
Arrière plan
La variante SARS-CoV-2 Delta a été identifiée pour la première fois en mars 2021 et était liée à une recrudescence de l’incidence de l’infection par la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) en Amérique du Nord à l’été 2021. La recrudescence des cas liés aux virus de la lignée Delta a été la première augmentation notable des taux d’infection par le SRAS-CoV-2 après que les vaccins COVID-19 sont devenus facilement accessibles aux États-Unis.
En juillet 2021, les taux d’infection par le SRAS-CoV-2 étaient faibles aux États-Unis, et les organisations nationales et locales de santé publique assouplissaient les réglementations sur l’utilisation de masques faciaux et d’autres mesures non pharmaceutiques pour arrêter la propagation du virus. La question de savoir si les personnes infectées par le SRAS-CoV-2, malgré la vaccination, pouvaient transmettre l’infection à d’autres était une considération cruciale dans l’élaboration de ces politiques.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont évalué la charge d’acide ribonucléique (ARN) du SRAS-CoV-2 dans les écouvillons nasaux obtenus à partir de personnes vaccinées et non vaccinées pour déterminer si les personnes atteintes d’infections de percée vaccinale pourraient excréter les virus SRAS-CoV-2 Delta à des niveaux compatibles avec le transmission potentielle.
Les échantillons d’écouvillonnage nasal antérieur envoyés pour des tests cliniques à un service commercial de test de transcription inverse-réaction en chaîne par polymérase (RT-PCR) entre le 28 juin 2021 et le 1er décembre 2021 ont été utilisés. L’étude a utilisé des métadonnées associées à l’échantillon pour estimer la charge d’ARN viral chez les personnes testées positives pour le SRAS-CoV-2 pendant une période de prévalence élevée de la variante Delta et son association avec le statut vaccinal de la personne. Dans de nombreux sites cliniques du Wisconsin, des échantillons ont été obtenus à l’aide de kits de prélèvement standardisés auprès de patients nécessitant un test RT-PCR du SRAS-CoV-2. Pour évaluer la charge nasale d’ARN viral, l’équipe a analysé les données de seuil de cycle RT-PCR (Ct) relatives à 20 431 échantillons provenant de personnes complètement vaccinées ou non vaccinées.
Les niveaux de Ct ont été déterminés à l’aide du test multiplex Flu-SC2. Cette méthode RT-PCR peut identifier simultanément l’acide nucléique de la grippe A et B et du SRAS-CoV-2 dans les écouvillons nasaux antérieurs. La transcription inverse en acide désoxyribonucléique complémentaire (ADNc) et l’amplification ont été réalisées sur l’ARN obtenu à partir d’échantillons d’écouvillonnage nasal antérieur. Un contrôle sans matrice, un contrôle d’extraction positif contenant de la RNAse P humaine et un contrôle de RNAse P interne ont tous été utilisés comme contrôles.
Si le registre des vaccins ou les données autodéclarées montraient qu’une dose finale de vaccin avait été reçue au moins 14 jours avant la soumission d’un positif au SRAS-CoV-2, la personne était considérée comme complètement vaccinée au moment du test. L’équipe a évalué la présence d’un virus infectieux et observé la présence d’effets cytopathiques tout au long de cinq jours en utilisant un premier lot d’échantillons avec des valeurs de Ct inférieures à 25. Les échantillons ont été sélectionnés en utilisant la correspondance N1 Ct entre les individus non vaccinés et complètement vaccinés. .
Résultats
Le SRAS-CoV-2 infecté a déjà été lié à des valeurs de Ct RT-PCR du SRAS-CoV-2 inférieures à 25. Des valeurs de Ct inférieures à 25 ont été observées chez 6 253 des 9 347 personnes entièrement vaccinées et 6 739 des 11 084 personnes non vaccinées. Les chercheurs ont dérivé les différences standardisées, qui sont les différences moyennes entre les groupes divisées par les écarts-types regroupés, pour déterminer la taille des différences entre les groupes.
Les personnes infectées par le SRAS-CoV-2 malgré une vaccination complète ont de faibles valeurs de Ct et éliminent des quantités similaires de virus infectieux que les personnes non vaccinées.UN. Les valeurs N1 Ct des échantillons positifs pour le SRAS-CoV-2 ont été regroupées par statut vaccinal. La RT-PCR a été réalisée par Exact Sciences Corporation, responsable de plus de 10 % de tous les tests PCR dans le Wisconsin au cours de cette période, à l’aide d’un test de diagnostic qualitatif ciblant le gène SARS-CoV-2 N (oligonucléotides identiques à l’ensemble d’amorces et de sondes N1 du CDC) qui a été autorisé pour une utilisation d’urgence par la FDA (https://www.fda.gov/media/138328/download)). Une taille d’effet de d< 0,2 est négligeable. Le nombre d'échantillons dans chaque groupe est répertorié sous le diagramme de points. B Valeurs N1 Ct pour les échantillons positifs pour le SRAS-CoV-2 regroupés par statut vaccinal pour les personnes symptomatiques ou asymptomatiques ou ne disposant d’aucune information au moment du test. La case jaune clair indique les valeurs Ct <25. C Nous avons effectué des tests de plaque sur des cellules Vero E6 TMPRSS2 sur un sous-ensemble d’échantillons. Les échantillons ont été sélectionnés par appariement N1 Ct entre les personnes entièrement vaccinées et non vaccinées. Les échantillons provenant d’individus dont le statut vaccinal était inconnu ont été exclus de l’analyse. Les titres infectieux sont exprimés en unités formant plaque (PFU) par millilitre d’échantillon. Les échantillons ont subi un cycle de congélation-décongélation avant le titrage du virus.
Nous n’avons trouvé aucune corrélation perceptible entre les valeurs de Ct chez les personnes infectées et le statut vaccinal. Indépendamment du fait qu’ils avaient des symptômes au moment du test, les personnes vaccinées avaient de faibles valeurs de Ct, des valeurs de Ct inférieures à 25 étant trouvées chez 65 % des personnes non vaccinées symptomatiques et chez 70 % des patients symptomatiques complètement vaccinés.
Notamment, l’intervalle entre le début des symptômes et le test n’a pas été affecté par le statut vaccinal des patients présentant des symptômes. Dans notre cohorte, les personnes vaccinées et non vaccinées ont signalé un délai médian de 2,4 jours entre le début des symptômes et le test. Dans cet échantillon d’étude, 92% des personnes ont demandé un test dans les six jours suivant l’apparition des symptômes.
Conclusion
Les résultats de l’étude ont montré qu’une fraction importante de ceux qui ont développé des infections par le virus SARS-Cov-2 Delta après avoir reçu des vaccins avaient de faibles valeurs de Ct compatibles avec la possibilité d’excréter des virus infectieux. Les résultats ont indiqué que les personnes infectées malgré les vaccinations pourraient propager le SRAS-CoV-2. Afin d’arrêter la transmission, la prévention des infections est essentielle. Les chercheurs pensent que ceux qui ont et n’ont pas reçu le vaccin COVID-19 devraient continuer à suivre des mesures non pharmaceutiques pour limiter la transmission du COVID-19.
