Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont étudié les facteurs potentiels d’un déclin mondial de la circulation du virus de la grippe pendant la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19).
Sommaire
Arrière plan
Depuis 2020, avec la propagation mondiale du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2), les études ont montré un raccourcissement apparent de la saison grippale dans les pays tropicaux et dans certains pays de l’hémisphère nord. La tendance s’est poursuivie en 2021 et s’est étendue aux pays de l’hémisphère sud comme l’Australie et la Nouvelle-Zélande au cours des 18 mois suivants.
Étant donné que le virus de la grippe et le SRAS-CoV-2 ont une voie de transmission similaire, les mesures de restriction sociale imposées pendant la pandémie et les interventions non pharmaceutiques (NPI) contre le COVID-19 ont également entravé la circulation de la grippe dans le monde. Des études ont étudié ce phénomène pour des pays spécifiques, mais pas à l’échelle mondiale. Une analyse mondiale du déclin observé de la circulation de la grippe pendant la pandémie de COVID-19 pourrait aider à évaluer la circulation virale future et à interpréter les tendances actuelles de transmission.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont utilisé les données de la base de données FluNet sur la grippe pour calculer l’évolution de la grippe pour 166 pays et tous les trimestres de 13 semaines entre mars 2020 et septembre 2021 par rapport à une période pré-pandémique entre 2014 et 2019. Il y avait 20 trimestres entre hiver 2014 à 2015 et automne 2019 (période pré-pandémique) et six trimestres entre le printemps 2020 et l’été 2021 (période pandémique).
Ensuite, les chercheurs ont calculé le pourcentage de cas positifs pour la grippe pendant six trimestres pandémiques. De plus, ils ont déterminé le rapport entre le pourcentage de cas positifs pour la grippe au cours des trimestres pandémiques et le pourcentage moyen de cas positifs au cours des trimestres pré-pandémiques correspondants.
L’équipe a utilisé l’algorithme VSURF basé sur les forêts aléatoires (RF) pour identifier les prédicteurs du déclin de la grippe d’une valeur significative à partir d’une liste de 20 covariables (par exemple, l’incidence de la COVID-19, la réponse à la pandémie de COVID-19, la préparation à la pandémie de COVID-19, la démographie, les conditions météorologiques ) de sources publiques et de l’International Air Transport Association (IATA). Enfin, ils ont retenu des covariables avec des variables minimales, ayant une erreur de prédiction inférieure à l’erreur de prédiction minimale plus un écart-type (SD). Selon les prédicteurs du déclin de la grippe, l’équipe a classé des observations similaires dans le temps et dans l’espace à l’aide d’un arbre de régression. Enfin, ils ont effectué une analyse de robustesse pour vérifier les fluctuations stochastiques dans l’ensemble de données analysé à l’aide de l’arbre de régression et des critères d’inclusion des enregistrements FluNet.
Résultats de l’étude
Les données de FluNet ont montré des pics plus élevés de cas de grippe saisonnière dans les pays du nord et des pics plus bas pour les pays du sud pendant la période pré-pandémique. Les auteurs ont observé une forte baisse du pourcentage de tests positifs pour la grippe pendant la période de pandémie de COVID-19 à un minimum de 0,04 % en juillet et août 2020.
Les auteurs ont effectué 376 observations trimestrielles de pays dans 112 pays pendant la pandémie. Comparé à deux ordres de grandeur pendant la période pré-pandémique, le pourcentage de tests positifs pour la grippe a varié sur cinq ordres de grandeur selon les pays et les trimestres pendant la période pandémique. Contrairement aux attentes, le pourcentage de tests positifs pour la grippe était plus de 100 fois plus faible pour 135/376 observations trimestrielles-pays. Notamment, le Japon a signalé zéro test positif sur 26114 tests traités au printemps 2021. À l’inverse, le pourcentage de tests positifs était de 15% en Haïti pendant l’hiver 2020-21 contre à peine 2,2% avant la pandémie.
Au printemps 2020, la baisse de la circulation de la grippe était inférieure à 90 % par rapport à la période pré-pandémique pour 46/65 pays. Au cours des trimestres suivants, cette baisse s’est accentuée pour l’Europe, le Mexique, l’Amérique du Nord et le Japon au cours de l’hiver 2020-21 et du printemps 2021. De même, la baisse s’est accentuée pour plusieurs pays de l’hémisphère sud au cours de l’été 2020 et de l’été 2021.
L’arbre de régression a analysé les données de 93 pays et 330 trimestres. Alors que l’Amérique du Nord et l’Europe ont connu une faible baisse de la grippe malgré des restrictions strictes lors de la pandémie de COVID-19 au printemps 2020, les pays tropicaux ont montré une moindre diminution des cas de grippe malgré une mauvaise préparation à la pandémie. Dans les pays tropicaux, l’incidence des cas de COVID-19 et la force de la réponse au COVID-19 étaient également inférieures à celles des pays européens et américains.
Après le printemps 2022, les pays des régions tempérées se sont regroupés pour afficher une forte baisse de la circulation de la grippe. Ces pays avaient une incidence élevée de COVID-19 et des restrictions sociales strictes et étaient parfaitement préparés à une pandémie. L’analyse a également identifié quatre pays sans cas de COVID-19, avec un faible déclin de la grippe dans l’ensemble. Curieusement, ces pays n’avaient pas imposé de restrictions sociales strictes, mais seulement des contrôles stricts aux frontières pour maintenir les niveaux de réduction les plus bas.
conclusion
L’étude a montré une baisse de la circulation de la grippe dans le monde, et des 11 prédicteurs du niveau logarithmique relatif de la grippe, a identifié les cas quotidiens de COVID-19 et l’indice de vulnérabilité aux maladies infectieuses (IDVI) comme les deux principales covariables responsables de cette baisse, selon la règle de Breiman. Plus important encore, l’analyse de l’étude a mis en évidence un déclin spatio-temporel hétérogène de la circulation de la grippe pendant la pandémie de COVID-19.
En outre, les auteurs ont observé une association non linéaire entre le déclin observé de la circulation de la grippe et le stade sociodémographique des covariables de la pandémie de COVID-19. Semblable à son déclin, une résurgence de la circulation de la grippe pourrait également emprunter une voie diversifiée. Un réensemencement de la grippe pourrait entraîner des épidémies saisonnières dans plusieurs pays et augmenter les cas dans les populations sensibles, en particulier les enfants.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
